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《中国农业科学院》 2011年
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瓜类细菌性果斑病菌种内遗传多样性的研究

阎莎莎  
【摘要】:瓜类细菌性果斑病是发生在葫芦科作物上的一种严重的世界性病害,其病原为西瓜嗜酸菌(Acidovorax citrulli)。该病可侵染多种葫芦科作物并在世界多国和我国多个省份发生,给当地的西甜瓜种植业造成了严重的经济损失。 瓜类细菌性果斑病菌存在丰富的遗传多样性,为抗病品种的筛选增加了困难,本论文用脉冲场凝胶电泳(Pulsed Field Gel Electrophoresis, PFGE)和多位点序列分型(Multilocus Sequence Typing, MLST)两种方法研究了118株国内外瓜类果斑病菌的种内遗传多样性,主要获得以下结论: (1) PFGE多态性电泳图谱表明118株菌共呈现出19条条带,大小在200~2000 kb之间,所有菌株归结为9种条带类型。Ntsys 2.1分析,所有菌株分为两个亚群,亚群1有73个菌株,其中67株分离自甜瓜;亚群2有45个菌株,其中42株分离自西瓜。即亚群1主要是分离自甜瓜的菌株,亚群2主要是分离自西瓜的菌株,表明果斑病菌在寄主上存在明显的遗传分化。112株中国菌株中,71株属于亚群1,其中64株是我国内蒙古和新疆的菌株;41株属于亚群2,包括我国多个省份的菌株,没有形成优势地理来源。美国的典型菌株Fc247和美国菌株Fc520归属于亚群1,其他4株国外菌株都归属于亚群2。PFGE分型技术结果容易判断、重复性好,独具对大片段DNA分子的分型能力,结果较准确。 (2)利用7个看家基因adk、gltA、glyA、pilT、spi、ugpB、glnA对果斑病菌进行MLST研究表明118个菌株共形成73个序列型(sequence type, ST),程序eBURST V3分析,所有菌株分成了3个群:亚群1(group 1)、亚群2(group 2)和1个单一群(singleton)。亚群1包括53个ST,共82个菌株;亚群2包括19个ST,共35个菌株。从寄主来看,亚群1的82个菌株中有甜瓜菌株68株、西瓜菌株14株;亚群2的35个菌株中有甜瓜菌株2株、西瓜菌株33株;美国的西瓜菌株Fc380成为1个单一群(singleton)。该结论与PFGE结果比较吻合,即亚群1主要是分离自甜瓜的菌株,亚群2主要是分离自西瓜的菌株。不同的是,北京的10个西瓜菌株分在了亚群1,可能说明这10个菌株与甜瓜菌株的亲缘关系较近。从地理来源看,亚群1的核心型ST45包括3个菌株,都来自我国新疆,推测亚群1的其他菌株与新疆的菌株关系更密切。亚群2的核心型ST5包括11个菌株,来自我国北京、新疆、海南、黑龙江和台湾,可见亚群2的菌株在我国的地理分布较分散。美国的典型菌株Fc247和美国菌株Fc520归属于亚群1,印度、美国、日本的菌株Fc356、Fc376、Fc491归属于亚群2,美国菌株Fc380成为1个单一群。MLST数据可以提交到官方网站http://www.mlst.net/,方便后续研究,该方法分辨率高,为该病害的流行学研究提供了重要数据。
【学位授予单位】:中国农业科学院
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2011
【分类号】:S436.5

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【引证文献】
中国硕士学位论文全文数据库 前1条
1 王铁霖;瓜类果斑病菌群体感应系统luxR/luxI功能研究[D];中国农业科学院;2012年
【参考文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 王中武;吴广成;;西瓜细菌性果斑病药剂防治试验[J];北方园艺;2009年01期
2 李柱刚,崔崇士,马荣才,曹鸣庆;遗传标记在植物上的发展与应用[J];东北农业大学学报;2001年04期
3 蔡学清;黄月英;杨建珍;陈军;蔡国隆;胡方平;;福建省西瓜细菌性果斑病的病原鉴定[J];福建农业大学学报;2005年04期
4 蔡学清;鄢凤娇;林玉;胡方平;;西瓜细菌性果斑病拮抗内生细菌的分离和筛选[J];福建农林大学学报(自然科学版);2009年05期
5 王晓东;孙玉宏;葛米红;李国庆;;武汉地区保护地甜瓜细菌性斑点病病原鉴定[J];湖北农业科学;2010年08期
6 任小平;李小妮;王琳;孙嘉祥;吴九玲;刘琼光;;广东西瓜果斑病的病原鉴定[J];华南农业大学学报;2010年04期
7 张少敏;徐建国;;多位点序列分型及其应用[J];疾病监测;2008年10期
8 金岩,张俊杰,吴燕华,高洁;西瓜细菌性果斑病的发生与病原菌鉴定[J];吉林农业大学学报;2004年03期
9 张荣意,谭志琼,文衍堂,张惠梅,简日明;西瓜细菌性果斑病症状描述和病原菌鉴定[J];热带作物学报;1998年01期
10 马克平;试论生物多样性的概念[J];生物多样性;1993年01期
中国博士学位论文全文数据库 前1条
1 王晓东;防治哈密瓜细菌性果斑病拮抗酵母菌的筛选及其生防机理研究[D];华中农业大学;2009年
【共引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 徐莹莹;杜秉海;丁延芹;王翠翠;王璇;姚良同;;生姜根际姜瘟病拮抗菌的筛选及鉴定[J];山东农业科学;2012年01期
2 徐如松,高林;皇甫山板栗林的物种多样性研究[J];安徽农学通报;2002年02期
3 王爱英;李国英;曾义;王钦英;;新疆哈密瓜细菌性斑点病种子带菌的分离检测[J];安徽农学通报;2006年09期
4 张鑫;杨杰;;生物多样性的丧失原因与保护策略[J];安徽农学通报;2007年10期
5 李广京;李建丰;;生物多样性及其保护措施[J];安徽农学通报;2008年03期
6 姚佳;许大为;蒙宽宏;鲁少波;王玉华;;我国生物多样性保护的研究现状和发展趋势[J];安徽农学通报;2008年03期
7 闻慧;刘兴洋;李国英;张力群;;甜瓜细菌性果斑病菌检测技术研究进展[J];安徽农业科学;2007年20期
8 卢双珍;喻庆国;曹顺伟;;无量山国家级自然保护区及其周边地区生态系统多样性测度[J];安徽农业科学;2008年06期
9 黄丽娜;李文宾;廉振民;;生物多样性的丧失及其保护[J];安徽农业科学;2009年05期
10 宋小艳;郝建锋;;物种多样性的研究进展[J];安徽农业科学;2011年14期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 朱利;;汉石桥湿地生态景观建设——以藕塘区域改造为例[A];2011北京园林绿化与生物多样性保护[C];2011年
2 韩晨霞;李旭光;沈洪国;;大板营自然保护区种子植物区系组成及地理分布特征研究[A];重庆市首届工程师大会论文集[C];2004年
3 陈秀蓉;杨成德;贾迎春;;西瓜细菌性果斑病菌的分离鉴定[A];节能环保 和谐发展——2007中国科协年会论文集(三)[C];2007年
4 孙成虎;尚庆茂;李平兰;;几种消毒剂对甘蓝种传黑斑病和种子理化特性的影响[A];中国园艺学会第七届青年学术讨论会论文集[C];2006年
5 李海燕;黄炜;吉相霞;;浅谈生物多样性在濮阳城市园林建设中的应用[A];濮阳市首届学术年会论文选编[C];2006年
6 向青松;彭军;舒杰;谢春凤;;利用农业生物多样性控制烟草病虫害[A];依靠科技进步和创新加快发展现代农业学术研讨会优秀论文集[C];2009年
7 何毅;李文信;洪日新;覃斯华;黄金艳;李天艳;;西瓜嫁接育苗细菌性果腐病综合防治措施[A];第13次全国无籽西瓜科研与生产协作组会议论文集[C];2010年
8 刘春霞;韩烈保;;高速公路边坡植被不同生态恢复阶段物种多样性的调查研究[A];中国草学会草坪专业委员会第六届全国会员代表大会及第九次学术研讨会论文汇编[C];2004年
9 王明福;薛万琦;佟艳丰;;蝇类的生物多样性浅议[A];当代昆虫学研究——中国昆虫学会成立60周年纪念大会暨学术讨论会论文集[C];2004年
10 杨立美;穆彪;;生物多样性研究综述[A];中国农学会农业气象分会2006年学术年会论文集[C];2006年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 李培英;新疆草坪用野生偃麦草种质资源评价[D];新疆农业大学;2010年
2 田晔林;北京百花山自然保护区苔藓植物多样性研究[D];北京林业大学;2011年
3 戴天放;鄱阳湖流域农业环境变迁与生态农业研究[D];福建师范大学;2010年
4 方江平;西藏原始林芝云杉林群落结构与功能研究[D];中南林业科技大学;2010年
5 李建军;广东湛江红树林生态系统空间结构优化研究[D];中南林业科技大学;2010年
6 荣立苹;东北地区野生百合种质资源及遗传多样性研究[D];沈阳农业大学;2010年
7 龙茹;湖北大老岭落叶阔叶林群落结构和植物性系统多样性研究[D];北京林业大学;2011年
8 李兰花;北京市低山区残次水土保持林评价[D];北京林业大学;2011年
9 张庆;内蒙古短花针茅草原生物多样性格局及环境解释[D];内蒙古大学;2011年
10 刘鸿雁;哈尔滨市景观格局变化及典型小流域水土保持分析[D];东北林业大学;2011年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 武欣;武汉城市乡村聚落植物物种组成与多样性研究[D];华中农业大学;2010年
2 郭一鸣;全球白菜型油菜遗传多样性分析[D];华中农业大学;2010年
3 高伟;四倍体棉种的遗传多样性分析[D];华中农业大学;2010年
4 于斯惟;野生动物园规划与设计初探[D];中南林业科技大学;2009年
5 郭晓丽;大王滩水库集水区沉水植物分布特征及多样性研究[D];广西师范学院;2010年
6 霍凤梅;洋葱种质资源遗传多样性的SRAP分析与查尔酮合成酶基因的分子克隆与表达研究[D];山东农业大学;2010年
7 王晓菡;中国芍药品种遗传多样性SRAP分析和核心种质的初步构建[D];山东农业大学;2010年
8 郝美彬;山地型郊野公园景观规划设计研究[D];山东农业大学;2010年
9 杨培浩;不同小麦品种的细胞遗传学研究及SSR遗传多样性分析[D];安徽农业大学;2010年
10 蒋燕锋;厚朴遗传多样性层次变异规律研究[D];浙江农林大学;2010年
【同被引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 王中武;吴广成;;西瓜细菌性果斑病药剂防治试验[J];北方园艺;2009年01期
2 蔡学清;黄月英;杨建珍;陈军;蔡国隆;胡方平;;福建省西瓜细菌性果斑病的病原鉴定[J];福建农业大学学报;2005年04期
3 蔡学清;鄢凤娇;林玉;胡方平;;西瓜细菌性果斑病拮抗内生细菌的分离和筛选[J];福建农林大学学报(自然科学版);2009年05期
4 张新忠;罗逢健;刘光明;楼正云;陈宗懋;;超高效液相色谱-串联质谱法测定茶叶和土壤中丁醚脲及其代谢物的残留[J];分析化学;2011年09期
5 黄昆;王文辉;李宝才;王齐;杨俊;李晚谊;;超高效液相色谱和质谱联用在药物研究领域的应用[J];光谱实验室;2009年04期
6 胡俊;黄俊霞;刘双平;杨利国;翟艳霞;李勇;路妍;;不同哈密瓜品种对细菌性果斑病抗病性及发展动态的研究[J];华北农学报;2006年06期
7 王晓东;孙玉宏;葛米红;李国庆;;武汉地区保护地甜瓜细菌性斑点病病原鉴定[J];湖北农业科学;2010年08期
8 路彩红;刘新刚;董丰收;徐军;王旭;郑永权;;烯啶虫胺在棉花和土壤中的残留及消解动态[J];环境化学;2010年04期
9 任小平;李小妮;王琳;孙嘉祥;吴九玲;刘琼光;;广东西瓜果斑病的病原鉴定[J];华南农业大学学报;2010年04期
10 温晓芳,黄俊生;细菌的群体感应及其信号分子[J];华南热带农业大学学报;2005年01期
中国博士学位论文全文数据库 前1条
1 孙蕾;水稻白叶枯病菌群体感应信号DSF和c-di-GMP系统中重要基因的鉴定和功能分析[D];中国农业科学院;2009年
中国硕士学位论文全文数据库 前3条
1 刘鹏;哈密瓜果斑病菌群体感应系统相关基因的克隆及其在检测中的应用[D];中国农业科学院;2007年
2 陈涛;哈密瓜细菌性果斑病菌群体感应信号分子的检测及其合成基因luxI的功能[D];南京农业大学;2008年
3 管文静;水稻白叶枯病菌转录调控因子Clpxoo的分子鉴定及功能分析[D];中国农业科学院;2009年
【二级参考文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 王钦英;李国英;任毓忠;姚慧贤;王付成;;种子处理对籽瓜细菌性果斑病防治效果的研究[J];北方园艺;2006年02期
2 李威;任毓忠;丁建军;侯鹏;谢方生;;新疆瓜类细菌性果斑病品种抗病性鉴定[J];北方园艺;2007年03期
3 别之龙;杨普社;刘绍银;;武汉市西甜瓜产业发展现状、问题与对策[J];长江蔬菜;2008年02期
4 刘绍军,林学岷,周丽艳,路丽娜,潘秋芬,侯文波;啤酒酵母对草莓保鲜作用研究初报[J];河北农业大学学报;1996年03期
5 蔡学清,何红,胡方平;双抗标记法测定枯草芽孢杆菌BS-2和BS-1在辣椒体内的定殖动态[J];福建农业大学学报;2003年01期
6 蔡学清;黄月英;杨建珍;陈军;蔡国隆;胡方平;;福建省西瓜细菌性果斑病的病原鉴定[J];福建农业大学学报;2005年04期
7 洪鹏翔;邱思鑫;陈航;赵秀丹;胡方平;;4种茄科作物内生细菌的分离及拮抗菌的筛选[J];福建农林大学学报(自然科学版);2007年04期
8 夏青;谢田;文红梅;刘永翔;;8株国外引进的酿酒酵母菌的分类鉴定[J];贵州农业科学;2007年02期
9 赵军营,常永义,朱建兰;杏树受嗜果刀孢菌侵染后叶片内苯丙氨酸解氨酶活性的变化[J];果树科学;2000年04期
10 周洪友,刘正坪,胡俊,张俊祥,唐文华;2,4-二乙酰基藤黄酚产生菌在番茄根部的定殖及对番茄青枯病的防治[J];华北农学报;2004年04期
中国重要会议论文全文数据库 前1条
1 古勤生;徐永阳;彭斌;徐志红;刘丽锋;李莉;;河南西瓜甜瓜发生细菌性果腐病[A];中国植物病理学会2004年学术年会论文集[C];2004年
【相似文献】
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1 赵廷昌,孙福在,刘双平,康杰;哈密瓜细菌性果斑病及其防治[J];植物保护;2001年01期
2 赵廷昌;哈密瓜细菌性果斑病及其防治[J];柑桔与亚热带果树信息;2001年07期
3 邢东光;西瓜细菌性果斑病发生与防治[J];北方园艺;2002年03期
4 赵廷昌,王建荣,孙福在,刘双平;哈密瓜细菌性果斑病综合治理指南[J];植保技术与推广;2003年04期
5 王政,胡俊;哈蜜瓜细菌性果斑病种子带菌血清学检测技术的初探[J];内蒙古农业大学学报(自然科学版);2005年01期
6 周桂珍;王兰芳;严成灼;张时兴;;西瓜细菌性果斑病调查初报[J];中国植保导刊;2006年09期
7 金岩,张俊杰,吴燕华,高洁;西瓜细菌性果斑病的发生与病原菌鉴定[J];吉林农业大学学报;2004年03期
8 黄月英;;西瓜细菌性果斑病的检测与防治[J];福建农业科技;2008年02期
9 马引萍;马质朴;;西瓜细菌性果斑病的发生及防治[J];种子世界;1992年10期
10 赵廷昌,孙福在,王兵万;西瓜细菌性果斑病研究进展[J];植保技术与推广;2001年03期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 邱思鑫;陈新凯;;西瓜细菌性果斑病菌快速检测方法的建立[A];中国植物病理学会2010年学术年会论文集[C];2010年
2 赵玉强;韩振华;高杜鹃;田艳丽;范加勤;胡白石;刘凤权;;瓜类细菌性果斑病菌luxR基因的功能初析[A];第三届全国生物入侵大会论文摘要集——“全球变化与生物入侵”[C];2010年
3 邱思鑫;陈新凯;;巢式PCR技术检测西瓜细菌性果斑病菌[A];第三届全国生物入侵大会论文摘要集——“全球变化与生物入侵”[C];2010年
4 王晓东;李国庆;;拮抗酵母菌0732-1的鉴定及其ITS-5.8S rDNA序列分析[A];中国植物病理学会2010年学术年会论文集[C];2010年
5 冯建军;陈坤杰;李健强;许勇;周向阳;;盐溶液引发无籽西瓜种子对幼苗生长和细菌性果斑病菌消毒的效果[A];中国植物病理学会2006年学术年会论文集[C];2006年
6 赵廷昌;回文广;王建荣;孙福在;;哈密瓜细菌性果斑病种子带菌检测方法的研究[A];中国植物病理学会2005年学术年会暨植物病理学报创刊50周年纪念会论文集[C];2005年
7 赵廷昌;回文广;王建荣;孙福在;;哈密瓜细菌性果斑病种子带菌检测方法的研究[A];中国植物病理学会2005年学术年会暨植物病理学报创刊50周年纪念会论文摘要集[C];2005年
8 胡俊;胡宁宝;翟艳霞;郑喜清;彭军;;哈密瓜对细菌性果斑病抗性机制的初步研究[A];科技创新与绿色植保——中国植物保护学会2006学术年会论文集[C];2006年
9 罗明;芦云;张祥林;姜云琴;陈金焕;;哈密瓜果斑病内生拮抗细菌P38菌株的分离及其防病促生作用研究[A];中国植物病理学会2006年学术年会论文集[C];2006年
10 李威;任毓忠;李国英;陈遂中;;BTH和硅酸诱导哈密瓜对细菌性果斑病的抗性[A];中国植物病理学会2007年学术年会论文集[C];2007年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 卫宝林;瓜类品种[N];农民日报;2002年
2 卫宝林;瓜类品种[N];农民日报;2002年
3 苏化洲;瓜套葵花:光、热资源深度开发的有效途径[N];巴彦淖尔日报(汉);2009年
4 何永梅;瓜类白粉病怎么防[N];河南科技报;2009年
5 王国勇;瓜类枯萎病的防治[N];中国特产报;2006年
6 吴棉 徐吉;定安高秀洋大棚连营[N];海南日报;2006年
7 记者 吴棉 特约记者 郑善;品种与品牌是关键[N];海南日报;2006年
8 张建林侯小刚;焦村乡面向市场搞种植2.67万亩晚熟西瓜走俏[N];陇东报;2007年
9 贺军栋;蒲城西瓜俏销市场[N];渭南日报;2007年
10 记者 王思俊;中牟西瓜实现顺畅销售[N];郑州日报;2007年
中国博士学位论文全文数据库 前6条
1 王婧;种传西瓜细菌性果斑病菌快速分子检测方法研究[D];甘肃农业大学;2012年
2 王晓东;防治哈密瓜细菌性果斑病拮抗酵母菌的筛选及其生防机理研究[D];华中农业大学;2009年
3 龚鹏;棉蚜Aphis gossypii Glover种群分化的分子遗传标记研究及性蚜的诱导[D];南京农业大学;2000年
4 刘向东;棉蚜Aphis gossypii Glover寄主型和迁飞型的研究[D];南京农业大学;2003年
5 李兴海;2-氧代环烷基磺酰胺和磺酰脲的合成与生物活性研究[D];中国农业大学;2005年
6 虞慧芳;赤霉素诱导无蔓南瓜蔓伸长生理和分子生物学机制的研究[D];浙江大学;2005年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 阎莎莎;瓜类细菌性果斑病菌种内遗传多样性的研究[D];中国农业科学院;2011年
2 董明明;瓜类细菌性果斑病菌及辣椒细菌性斑点病菌的快速检测技术研究[D];山东农业大学;2011年
3 汪新;瓜类细菌性果斑病菌hrp基因簇部分基因的克隆及功能研究[D];南京农业大学;2010年
4 陈新垲;西瓜细菌性果斑病菌的PCR检测[D];福建农林大学;2010年
5 赵玉强;瓜类细菌性果斑病菌致病相关基因筛选及luxR基因功能分析[D];南京农业大学;2010年
6 金岩;西瓜细菌性果斑病研究[D];吉林农业大学;2003年
7 严婉荣;瓜类细菌性果斑病菌hrcN基因的克隆及功能分析[D];湖南农业大学;2012年
8 尚琳琳;植物检疫性病原菌分离与检测技术研究[D];华东理工大学;2011年
9 回文广;哈密瓜果斑病菌快速检测方法的建立[D];中国农业科学院;2004年
10 翟艳霞;哈密瓜品种对细菌性果斑病菌的抗性鉴定及抗性机制的研究[D];内蒙古农业大学;2006年
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