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《中国农业科学院》 2014年
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番茄前景标记和背景标记的开发与应用研究

苏晓梅  
【摘要】:随着分子技术的发展,分子标记辅助选择技术已成为番茄育种的常规手段。分子标记技术具有周期短和准确性高的特点,可以进行单株基因型分析,在缩短育种进程、加快品种选育方面具有显著优势。本研究通过番茄已知序列信息开发SNP和InDel功能标记(前景标记),通过番茄基因组重测序信息开发InDel背景标记,同时使用前景标记与背景标记对番茄育种材料进行分析,以提高选种效率,加速育种进程。主要研究结果如下: (1)针对已知的5个番茄抗病基因Tm-2,Pto,Sw-5,Ve1,Ty1和2个农艺性状基因ovate,sp的基因序列,设计开发了7个SNP标记和1个InDel标记。利用HRM技术对已知材料进行验证,上述标记均能准确鉴定目的基因的基因型;另外,通过验证已发表的Mi基因的共显性标记PMi的有效性,明确该标记可用于番茄线虫抗性辅助筛选。 (2)使用PMi标记和本试验开发的Ty1-InDel标记对本课题组的83份番茄材料进行鉴定,结果显示83份材料中有24份兼抗根结线虫和番茄黄化曲叶病毒,9份单抗番茄黄化曲叶病毒,18份单抗根结线虫。 (3)利用开发的372个InDel标记,对8份高代稳定材料和3组不同世代的群体材料进行背景分析发现:经过人工选育的8份高代稳定材料的杂合度虽然很低,但仍难以达到100%的纯合水平,在3组低代材料及其衍生系材料中,经过多代的选育,材料的杂合度降低,但高代材料在分子水平上仍存在一定程度的杂合。 (4)利用背景标记对4个F2分离群体的传统入选单株进行遗传分析,结果表明部分入选单株之间存在较高的遗传相似度,这是传统选择效率较低的原因。结合前景标记分析,从4个分离群体的入选单株中初步筛选了33份杂合度较低且遗传关系较远的单株。这些单株可作为重点株系进行下一轮的育种筛选。
【学位授予单位】:中国农业科学院
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2014
【分类号】:S641.2

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【参考文献】
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