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《中国农业科学院》 2018年
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新城疫病毒感染鸡胚成纤维细胞的mRNAs和lncRNAs的研究

刘炜玮  
【摘要】:新城疫(Newcastle disease,ND)是由新城疫病毒(NDV)引起的一种烈性病毒性传染病,是当今全球范围内最严重的家禽传染病之一,被国际兽疫局列为必须报告的疾病,其强毒可引起全身性出血和胃肠道病变,引起家禽的大量死亡,是严重危害养禽业的烈性传染病。尽管已有多种新城疫病毒疫苗问世,但世界动物卫生组织(OIE)最新数据显示新城疫病毒在全球的流行并无减缓趋势,随着Class I新城疫病毒的出现,新城疫病毒防控面临着新的挑战。因此,认识新城疫病毒的复制机制以及新城疫病毒与宿主的相互作用对于新城疫的防控十分重要,研究新城疫病毒与宿主细胞互作有利于发现新的抗病毒靶点。在本研究中,我们用新城疫参考强毒Herts/33和弱毒LaSota分别感染了原代鸡胚成纤维细胞,经转录组测序和生物信息学分析发现,感染新城疫参考强毒Herts/33后获得1ncRNA992条,感染新城疫参考弱毒LaSota后获得1ncRNA572条,其中404条是感染新城疫参考强毒Herts/33和参考弱毒LaSota共有的;,感染新城疫参考强毒Herts/33后获得mRNA7603条,感染新城疫参考弱毒LaSota后获得mRNA4105条,其中3275条是感染新城疫参考强毒Herts/33和参考弱毒LaSota共有的。在对新城疫病毒感染获得mRNA分析中,对这些差异表达基因进一步做了 GO和KEGG分析,结果显示这些基因在细胞组分和代谢过程中表现出高度富集。在这8433个转录本中,获得了与干扰素刺激基因相关的3616个转录本,这些转录本涉及代谢过程,包括蛋白质磷酸化和蛋白质修饰。研究结果对揭示新城疫病毒与宿主相互作用以及对鸡天然免疫应答反应有重要意义。在对新城疫病毒感染获得1ncRNA分析中,得到了病毒感染引起的关键1ncRNA分子反义 1ncRNA LNC_000710。1ncRNA LNC__000710 带 polyA 尾,位于细胞核。反义 1ncRNA LNC_000710在感染新城疫病毒后显著上调,随着感染时间的增加,LNC_000710的表达也增加。利用RNAi抑制LNC_000710后,新城疫病毒复制增加,说明1ncRNA LNC_000710对新城疫病毒的复制有抑制作用。因而推测LNC_000710在新城疫病毒复制中发挥重要作用,但具体调控机制仍需进一步研究。
【学位授予单位】:中国农业科学院
【学位级别】:博士后
【学位授予年份】:2018
【分类号】:S852.65

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