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《中国农业科学院》 2001年
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白菜类蔬菜遗传多样性的AFLP分子标记和大白菜发育的差异显示研究

郭晶心  
【摘要】: 本论文工作是我室大白菜分子育种研究的重要组成部分,主要包括了两个部分的研究内容:第一部 分是利用AFLP分子标记技术研究白菜类蔬菜的遗传多样性,第二部分是利用mRNA差异显示技术研究大 白菜结球过程中的基因表达。 白菜类蔬菜包括大白菜和小白菜,原产于我国,是我国在世界各国蔬菜品种和蔬菜栽培中独具风格 的种类。白菜类蔬菜是我国最早的栽培植物之一,它们分布广泛,品种资源非常丰富。对其进行遗传多 样性分析,明确白菜类蔬菜之间的分类关系,有助于人们进一步开发利用其种质资源和更加有效的选择 育种材料。 大白菜的叶球是典型的变态器官。根据叶片发育的形态特征,大白菜的营养生长可分为幼苗期、莲 座期、包心期和结球期四个时期。从莲座期至包心期,是大白菜叶片形态特征和生理功能发生转变的关 键时期,它标志着叶球发生的开始。对大白菜结球过程的研究不仅可以揭示其独特的发育机制和代谢途 径,而且能够为白菜和其它芸薹属蔬菜的分子育种打下基础。 本实验采用AFLP的荧光标记检测技术和银染检测技术,对135份大白菜、小白菜、芜菁材料进行 了遗传多样性和分类研究。在此基础上 进一步以大白菜“北京桔红心”为材料,对其莲座期和包心期 的叶片进行了DD-PCR分析,为揭示由莲座期至包心期发育过程中大白菜叶片基因表达的变化作了一些初 步的尝试。现将主要结果总结如下: 第一部分,利用AFLP分子标记技术研究白菜类蔬菜的遗传多样性 1采用银染检测方法,比较了E+3/M+2、E+3/M+3引物组合对白菜类蔬菜DNA的扩增条带数,发现前者 的扩增条带过于密集,而后者扩增条带数目适中,电泳图谱清晰。 2采用银染检测方法,比较了64对E+3/M+3引物组合对白菜类蔬菜DNA的扩增总带数和多态性检出率, 发现不同引物的扩增总带数在16-58之间,多态检出率在40%-88%之间。从中选择了四对扩增总带 数多,多态性检出率高的引物组合用作分析。 3采用AFLP的荧光标记检测技术对135份材料进行了遗传多样性分析。选用SM系数作为相似性系数 的计算方法,选用UPGMA作为聚类方法。 4聚类结果表明:芜菁和所有的白菜类蔬菜各聚为两类,在白菜类蔬菜类群内部,薹菜和大白菜单独 聚为一类。这表明,芜菁与大白菜、小白菜的相似性程度较低,大白菜与小白菜的相似性程度较高, 大白菜在所有的白菜类蔬菜当中是比较特殊的类群。同意曹家树等提出的将芜菁和白菜(包括大白 菜和小白菜)归为Brassica campestris的两个不同的亚种,大白菜则为白菜亚种中的一个特殊的 变种的观点。 5在小白菜的不同类型中,薹菜与大白菜聚为一类,相似性程度较高,表明薹菜与大白菜的起源可能 存在密切的关系。 6小白菜的AFLP M结果与其综合园艺学分类不符,说明小白菜各类型在DNA M上的差异与其形 态学差异并不存在完全对应的关系。小白菜各类型间的椰以仕程度较大白菜各类型间的+引以性程度 低,分化程度高,说明小白菜的起源较大白菜要早。 7大白菜的AFLP聚类结果表明,目前生产中所用的大白菜材料之间榔以性矗缠舀交高,而两个大白菜农 家品种与它可l]之间的相似性稷图脚氏。这反映了大ewhIS.*ru*品种的遗传多样性较为狭窄,有必要从 大白菜的原始类型中挖掘新的种质资源。 第H部分,利用InRNAgn显示技术研究大白菜结球过程中的基因表达 IAN了4种G、Cng高的锚定引物和3种随机弓1物,共作了12个l)Iyl,nl,反应。在大白菜莲座期和 包吧溯叶片的 mRNA差异显示电泳图谱中,选择了 23个差异 cM )17ling+Y了 Reverse NOrthe。检验, 从中得到了两个在包心期表达量增加的阳性cDNA片段。 2对这两个cM片 了了核酌辙拓Uop性分析,发现它呵门u与 申因子egnl和呛删泪肽 转移酶的编匝归丐ung同源。根据核音酸序列阶即叮U,序列比较的结果表明在不同植物 中这两种蛋白质的氨基酸序列 叵强的保守性。 在国际上对大白菜的分子生物学研穷也是刚@瞒涉,捌〕的工作尚处于初始阶段,有关基因的结构 和功8铱抹进行研究,所以在此不对这些基因溯沽细讨论。相信随着我士门工作进一步的深入,将为大 白菜的分子+打下重要的基础。
【关键词】:AFLP mRNA差异显示 遗传多样性 基因表达 白菜类蔬菜 大白菜 小白菜 芜菁
【学位授予单位】:中国农业科学院
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2001
【分类号】:S634.01
【目录】:
  • 中文摘要6-8
  • 英文摘要8-11
  • 第一部分: 文献综述11-39
  • 第一章: 芸薹属植物起源、演化及分类的分子标记研究进展11-30
  • 一 关于芸薹属植物起源、演化及分类研究的基本情况11-15
  • (一) 起源和演化11
  • (二) 分类、禹氏假说的提出及验证11-15
  • 二 利用分子生物学技术深入研究芸薹属植物基因组15-26
  • (一) 用于芸薹属植物基因组研究的主要分子标记技术16-18
  • (二) 利用分子标记技术研究芸薹属植物的亲缘关系18-21
  • (三) 利用分子标记技术构建芸薹属植物的遗传连锁图,进行比较基因组研究21-26
  • (四) 芸薹属植物基因组研究展望26
  • 三 白菜类蔬菜起源、演化及分类研究概况26-30
  • (一) 白菜类蔬菜的起源和演化26-28
  • (二) 白菜类蔬菜的分类28-30
  • 第二章: mRNA差异显示技术与大白菜发育的分子生物学研究进展30-39
  • 一 mRNA差异显示技术的原理和实验程序30-34
  • (一) mRNA差异显示技术的原理30
  • (二) mRNA差异显示技术的实验程序30-34
  • 二 mRNA差异显示技术存在的问题及解决的方法34-35
  • 1 mRNA差异显示技术的敏感性34
  • 2 mRNA差异显示技术的假阳性34-35
  • 三 mRNA差异显示技术的应用与展望35-36
  • 四 大白菜发育的分子生物学研究进展36-39
  • 1 大白菜的EST(Expressed Sequence Tags 表达序列标签)36-37
  • 2 大白菜结球特性的研究37-39
  • 第二部分: 实验部分139-84
  • 第一章: 白菜类蔬菜遗传多样性的AFLP分子标记研究39-68
  • 一 引言39
  • 二 材料与方法39-51
  • (一) 材料40
  • (二) 实验方法40-44
  • 1 DNA提取40-42
  • 2 AFLP方法42-44
  • 3 变性聚丙烯酰胺凝胶电泳及凝胶扫描44
  • 4 AFLP银染程序44
  • (三) 数据处理44-51
  • 三 结果分析51-60
  • 1 白菜类蔬菜的DNA提取51-52
  • 2 AFLP反应条件的优化52
  • 3 引物选择52-56
  • 4 相似性系数计算方法和聚类方法的选择56-57
  • 5 白菜类蔬菜遗传多样性的AFLP分析57-60
  • 四 讨论60-63
  • (一) AFLP技术用于分类和遗传多样性检测的优越性60-61
  • (二) 白菜类蔬菜的遗传多样性61-63
  • 五 主要结论63-68
  • 第二章: 利用mRNA差异显示技术研究大白菜结球过程中的基因表达68-84
  • 一 引言68
  • 二 材料与方法68-74
  • (一) 材料68
  • (二) 方法68-74
  • 1 RNA提取(TE3D法)和DNaseⅠ处理69
  • 2 RT及RT-PCR反应69-71
  • 3 变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离差异显示片段71
  • 4 条带的回收及再扩增71
  • 5 Reverse Northern分析71-73
  • 6 序列测定及同源性分析73-74
  • 三 结果与分析74-81
  • 1 RNA的提取74
  • 2 莲座期和包心期大白菜叶片的DD-PCR分析74-75
  • 3 Reverse Northern分析75-77
  • 4 序列分析及同源性比较77-81
  • 四 讨论81-83
  • 1 本研究所用方法和技术特点81-82
  • 2 分离与大白菜结球有关的基因,深入认识变态器官发生的生理机制82-83
  • 五 主要结论83-84
  • 参考文献84-96
  • 致谢96-97
  • 作者简介97

【引证文献】
中国博士学位论文全文数据库 前2条
1 李柱刚;芸薹属(Brassica)脂肪酸合成基因的分子标记及系统发育分析[D];东北农业大学;2002年
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中国硕士学位论文全文数据库 前10条
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2 韩和平;大白菜抗芜菁花叶病毒病基因的AFLP分子标记的研究[D];中国农业科学院;2003年
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8 张波;不结球白菜晚抽薹分子标记及抽薹性遗传分析[D];南京农业大学;2007年
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10 牟晋华;山东省大白菜软腐病菌优势种群的筛选及抗病基因的AFLP标记[D];山东农业大学;2007年
【参考文献】
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【共引文献】
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4 丁照华;吴洪飞;刘治先;汪黎明;孟昭东;杨菲;张发军;;山东省主要审(认)定玉米杂交种种质分析[J];山东农业科学;2008年06期
5 刘天文;王翠花;于占东;徐文玲;牟晋华;杨晓红;;大白菜RAPD反应条件的优化[J];山东农业科学;2008年09期
6 张淑霞;孙兆法;宋朝玉;;早熟耐热大白菜品种比较试验[J];山东农业科学;2009年01期
7 张淑霞;孙兆法;宋朝玉;崔健;;青岛地区春大白菜温度敏感性初步研究[J];山东农业科学;2009年03期
8 缪军;霍雨猛;杨妍妍;修景润;刘冰江;张一卉;霍凤梅;吴雄;;高效TAIL-PCR的改良及在洋葱中的应用[J];山东农业科学;2009年10期
9 苏学军;徐茂俊;金刚;赵传双;张涛;孔德禄;张吉祥;;大白菜质核互作型雄性不育的转育与应用[J];山东农业科学;2011年06期
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中国重要会议论文全文数据库 前10条
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7 唐丽;湖南南天竹遗传多样性及园林利用评价体系研究[D];中南林业科技大学;2007年
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9 文亚峰;人心果品种资源亲缘关系及其授粉亲和性的研究[D];中南林业科技大学;2006年
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中国硕士学位论文全文数据库 前10条
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7 邓姗;旱稻IRAT109辐照突变体的抗旱性鉴定和窄叶突变体(nal8)的初步定位[D];华中农业大学;2010年
8 杨堃;鹅CYP7A1基因克隆、表达调节及表达规律的研究[D];华中农业大学;2010年
9 李霞;人工合成甘蓝型黄籽油菜粒色基因的精细定位[D];华中农业大学;2009年
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【同被引文献】
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【二级引证文献】
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3 郭晶心,周乃元,马荣才,曹鸣庆;白菜类蔬菜遗传多样性的AFLP分子标记研究[J];农业生物技术学报;2002年02期
4 赵大芹,黄贵平;黔白1号大白菜小株采种技术[J];种子;2005年10期
5 ;大白菜雄性不育系之父——记沈阳市绿星大白菜研究所首席顾问张书芳[J];吉林蔬菜;2003年01期
6 张涛;;天津市春种大白菜研究取得突破性进展[J];农业知识;2006年01期
7 石永成;李金玲;;大白菜无公害栽培[J];吉林蔬菜;2008年04期
8 王振亮;;复播大白菜栽培技术[J];农村科技;2010年10期
9 萧春英;;获得武汉郊区晚熟大白菜高产量的农业技术[J];华中农业大学学报;1957年02期
10 ;大白菜室外堆垜貯藏[J];农业科技通讯;1974年10期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 杨晓云;张清霞;张淑霞;马荣群;孙秀峰;陈振德;;大白菜耐低钙品系筛选[A];中国园艺学会第六届青年学术讨论会论文集[C];2004年
2 闫春芳;;地膜鲜黏玉米复种大白菜技术[A];第四届全国鲜食玉米暨速冻果蔬大会专集[C];2008年
3 蒋武生;原玉香;张晓伟;耿建峰;韩永平;高睦枪;栗根义;;提高大白菜游离小孢子胚诱导率的研究[A];全国蔬菜遗传育种学术讨论会论文集[C];2002年
4 刘庆丰;熊国如;王志远;吴兴兴;毛自朝;何月秋;;枯草芽孢杆菌XF-1在大白菜根际定殖能力研究[A];中国植物病理学会2009年学术年会论文集[C];2009年
5 郝云凤;李可伟;张培宏;李小红;马俊;顾敏;;巴彦淖尔市城郊早熟马铃薯复种大白菜高产栽培技术[A];中国作物学会马铃薯专业委员会2008年马铃薯大会论文集[C];2008年
6 远方;张松贺;屈淑平;马荣才;;大白菜对软腐欧文氏菌防御反应分子基础研究[A];中国农业生物技术学会第三届会员代表大会暨学术交流会论文摘要集[C];2006年
7 于拴仓;于仁波;戚佳妮;张凤兰;余阳俊;张德双;赵岫云;;大白菜桔红心or基因的定位研究[A];中国遗传学会植物遗传和基因组学专业委员会2007年学术研讨会摘要集[C];2007年
8 何玉科;余旭红;彭洁松;冯献忠;郑志仁;杨素欣;沈瑞娟;刘平林;;大白菜包叶形态发生的基因调控[A];面向21世纪的科技进步与社会经济发展(下册)[C];1999年
9 张树清;张夫道;刘秀梅;张建峰;;四环素类抗生素对大白菜幼苗生长及生理指标的影响[A];十一五农业环境研究回顾与展望——第四届全国农业环境科学学术研讨会论文集[C];2011年
10 王东平;柳林坡;郭立娟;张成合;;大白菜两用系小孢子发育过程及POD同工酶的比较研究[A];中国园艺学会第九届学术年会论文集[C];2001年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 张麦熟;如何做到种大白菜价跌收益增[N];河北科技报;2006年
2 记者 卞思杰;明年大白菜咋种才赚钱[N];济南日报;2006年
3 赵红梅;冬储大白菜上市质优价稳[N];河北日报;2007年
4 本报记者 李竞立 刘云;安宁农民种出“巨型”大白菜[N];云南日报;2007年
5 本报记者 刘丽娜;胶州大白菜品牌成就规模[N];青岛日报;2009年
6 李荣云;大白菜贮藏措施[N];中国特产报;2004年
7 丰硕;大白菜防病先治虫[N];农民日报;2002年
8 魏雅华;评“卖彩电不如卖大白菜”[N];中国信息报;2003年
9 记者张悦;货源紧俏 今秋大白菜价格有点高[N];新农村商报;2009年
10 河北省农科院经作所 戴素英;大白菜受冻后说“捆菜”[N];河北科技报;2009年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 郭晶心;白菜类蔬菜遗传多样性的AFLP分子标记和大白菜发育的差异显示研究[D];中国农业科学院;2001年
2 卢泳全;大白菜冷相关基因的克隆及功能分析[D];福建农林大学;2003年
3 武剑;白菜类蔬菜锌积累和锌胁迫反应的遗传分析[D];中国农业科学院;2005年
4 薛万新;白菜类蔬菜叶球发育相关基因的分子克隆及其转基因植物研究[D];西北农林科技大学;2001年
5 丁晓蕾;20世纪中国蔬菜科技发展研究[D];南京农业大学;2008年
6 马伟;大白菜转芜菁花叶病毒外壳蛋白基因的研究[D];东北农业大学;2002年
7 严继勇;BcpLH反义基因在大白菜中的转化及其功能的研究[D];浙江大学;2004年
8 耿新翠;抗根肿病桔红心大白菜雄性不育系转育方法研究[D];沈阳农业大学;2012年
9 宋廷宇;薹菜品质分析及种质资源的亲缘关系研究[D];南京农业大学;2009年
10 王丽丽;大白菜核基因雄性不育系定向转育及分子标记辅助育种研究[D];沈阳农业大学;2010年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 葛佳;大白菜抗芜菁花叶病毒SSR标记及其系统获得性抗性反应基因表达分析[D];首都师范大学;2005年
2 王志和;大白菜亲本耐热性筛选方法的研究[D];山东农业大学;2005年
3 潘凯;大白菜花芽分化和抽薹过程的光温诱导效应及其机理研究[D];东北农业大学;2000年
4 屈淑萍;大白菜品质性状综合评价及配合力研究[D];东北农业大学;2000年
5 熊玉兰;橘红心白菜和普通大白菜类胡萝卜素代谢途径主要酶基因的表达分析[D];首都师范大学;2002年
6 吕建华;夏播大白菜未熟抽薹原因研究[D];河南农业大学;2001年
7 张继红;大白菜小孢子再生植株的遗传分析[D];华中农业大学;2004年
8 王文雅;大白菜部分三体光合作用研究[D];河北农业大学;2001年
9 陶新颖;大白菜自交不亲和基因的分子鉴别[D];山东农业大学;2004年
10 阎瑾琦;大白菜抗芜菁花叶病毒病基因的RAPD分子标记研究[D];中国农业科学院;2000年
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