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《中国农业科学院》 2002年
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大豆遗传图谱的构建及若干农艺性状的QTL定位分析

宛煜嵩  
【摘要】: 遗传连锁图谱构建和重要农艺性状或基因定位是植物基因组研究的重要内容和基础。大豆是重要的经济作物,但由于其为古源四倍体,基因组含有广泛的复制区和丰富的重复序列;为严格的自花授粉植物并且种内同源性程度非常高等原因使得其遗传图谱研究落后其他作物。SSR标记对来自不同群体的遗传图谱的整合起着关键作用。大豆基因组研究的一个重要内容就是创制针对特定重要农艺性状进行定位的大容量群体,并以之为材料平台对重要农艺性状进行基因定位。 晋豆23是山西省主栽品种,丰产性好,抗旱能力强,高抗SMV S2株系同时至少兼抗其他三个SMV株系,对SCN敏感。大豆材料灰布支黑豆是黑种皮农家种大豆,高抗SCN4号生理小种,并对其它生理小种亦具有良好抗性,对SMV敏感。本研究以晋豆23为母本,灰布支黑豆为父本进行杂交,构建了重组自交系F_8代群体,并SSR标记对该群体进行评估。构建了该群体的基于PCR标记的分子遗传图谱,并对若干重要农艺性状进行QTL定位,主要结果如下: 构建了包含487个株系的重组自交系F_8代群体,该群体是目前大豆研究领域中最大的重组自交系群体,是我国第三个用于大豆遗传图谱研究及基因定位的RIL群体。 选用355对基本覆盖大豆的全基因组的SSR引物,对从该群体随机选取的118个株系的样本群体进行评估表明:绝大多数SSR座位趋于纯合;除个别外,其他家系基本纯合;父本灰布支及母本晋豆23对群体的遗传贡献分别为0.51和0.49,群体各家系基因型组成近似符合正态分布;对各株系间的根井遗传距离采用UPGMA法对群体进行聚类分析表明群体中很少存在代表性重复现象。评估结果说明该群体遗传结构合理,分离的情况良好,适合于遗传作图等遗传研究。 应用该群体构建了一张包含32个连锁群的基于PCR标记的遗传图谱,其中包括104个SSR标记、8个ISSR标记和5个AFLP标记共117个座位。总长度为824.5cM,标记间平均间距为7.0 cM。图谱上的主要的标记为微卫星标记,与公共遗传图谱具有很好的可比性,标记的顺序和距离都很好地符合公共遗传图谱。将大豆黑色种皮基因(BSC)定位于A2连锁群,距Satt187为5.3cM。 利用本研究所构建的图谱采用复合区间作图法对大豆百粒重进行QTL定位分析。共检测到两个大豆百粒重的QTL,其一位于连锁群g18(K)的Satt167-Satt387区间,距Satt167 0.3 cM,为减效基因来自父本灰布支,可解释13.7%的遗传变异;另一QTL位于g28(D2)的Sat 022-Satt256区间,距Sat 022 0.02cM,为减效基因,来自父本灰布支,可解释12.7%的遗传变异。 中国农业科学院博士学位论文 中文摘要 一 利用本研究所构建的图谱采用复合区间作图法对大豆 SMV抗性进行 QTL定位 分析。检测到一个大豆 SMV抗性的 QTL,位于连锁群 923(H)的 Salllslsattl42 区间,距Sattl81刀2 cM,为加效基因来自母本晋豆23,可解释门.73%的遗传变异。 利用本研究所构建的图谱采用复合区间作图法对大豆 SCN 4号生理小种进行 QTL定位分析。检测到一个大豆 SCN 4号生理小种抗性的 QTL,位于连锁群 922(O) 的Satt345-Satt479区间,距Satt345 6刀1。M,为减效基因来自母本晋豆23,可解释 11.73%的遗传变异。
【学位授予单位】:中国农业科学院
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2002
【分类号】:S565.1

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【引证文献】
中国期刊全文数据库 前10条
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3 刘丽君;孙欣;薛永国;杨喆;;大豆抗疫霉根腐病基因SSR标记[J];大豆科学;2008年03期
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8 刘春燕;栾淮海;裴宇峰;张维耀;刘业丽;何琳;陈庆山;胡国华;;大豆形态性状的QTL分析[J];湖南农业大学学报(自然科学版);2007年S1期
9 于清岩;刘春燕;王家麟;胡国华;陈庆山;;大豆花色的QTL分析[J];湖南农业大学学报(自然科学版);2007年S1期
10 陈庆山,张忠臣,刘春燕,王伟权,李文滨;应用Charleston×东农594重组自交系群体构建SSR大豆遗传图谱[J];中国农业科学;2005年07期
中国重要会议论文全文数据库 前2条
1 刘春燕;栾淮海;裴宇峰;张维耀;刘业丽;何琳;陈庆山;胡国华;;大豆形态性状的QTL分析[A];中国作物学会2007年全国作物遗传育种学术研讨会论文集[C];2007年
2 于清岩;刘春燕;王家麟;胡国华;陈庆山;;大豆花色的QTL分析[A];中国作物学会2007年全国作物遗传育种学术研讨会论文集[C];2007年
中国博士学位论文全文数据库 前7条
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中国硕士学位论文全文数据库 前10条
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2 王乾钦;不同大豆品种叶片含氮代谢物的变化及SSR标记分析[D];吉林农业大学;2011年
3 刘玉林;大豆遗传图谱构建及重要农艺性状QTL定位[D];中国农业科学院;2011年
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5 徐宇;大豆(Glycine max L. Merr.)籽粒大小和形状的QTL定位和驯化研究[D];南京农业大学;2011年
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7 汪霞;大豆遗传图谱构建和百粒重等七个农艺性状的QTL定位[D];南京农业大学;2010年
8 张忠臣;大豆基因组作图和重要农艺性状的基因定位[D];东北农业大学;2004年
9 朱晓丽;大豆遗传图谱构建及在两个群体重要农艺性状的QTL定位[D];东北农业大学;2006年
10 王惠君;橡胶树初级分子遗传图谱的构建[D];华南热带农业大学;2007年
【参考文献】
中国期刊全文数据库 前8条
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【共引文献】
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5 董艳敏;卢金东;刘栓桃;;分子标记技术在葫芦科瓜类作物中的应用进展[J];山东农业科学;2008年02期
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7 陈新;张士刚;魏海蓉;宗晓娟;王甲威;刘庆忠;;陕西核桃实生居群遗传多样性ISSR分析[J];山东农业科学;2012年05期
8 张延明;曲敏;闫玉清;徐香玲;李集临;;EST-SSRs在小麦研究中的应用[J];安徽农学通报;2006年13期
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中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 方清茂;崔光红;黄璐琦;张美;周先建;;栽培与野生何首乌种质资源遗传多样性的ISSR分析[A];中药饮片质量分析与中药鉴别技术交流研讨会论文集[C];2009年
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4 谭君;杨俊品;黄玉碧;孙仕贤;;利用SSR-DNA指纹的计算机分析鉴定玉米种子[A];2003年全国作物遗传育种学术研讨会论文集[C];2003年
5 王强;张茂君;;分子标记及其在苹果属植物研究上的应用[A];2003年全国作物遗传育种学术研讨会论文集[C];2003年
6 周新成;李立会;;两个小麦-黑麦杂交组合杂种F_2植株中黑麦染色体的鉴定[A];2003年全国作物遗传育种学术研讨会论文集[C];2003年
7 崔世友;;大豆分子标记研究的现状及展望——Ⅰ 遗传图谱的构建[A];’2003中国作物学会学术年会文集[C];2003年
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9 王毅;姚骥;张祖新;郑用琏;;玉米QTL图谱的整合和基于比较基因组学的QTL克隆策略探讨[A];2004全国玉米种质扩增、改良、创新与分子育种学术会议论文集[C];2004年
10 席章营;;作物次级作图群体的研究进展[A];2004全国玉米种质扩增、改良、创新与分子育种学术会议论文集[C];2004年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 韩英鹏;多环境、多遗传背景下不同发育时期大豆籽粒重的QTL分析[D];哈尔滨师范大学;2010年
2 刘名;太平洋鲱和大头鳕的群体遗传学研究[D];中国海洋大学;2010年
3 张立楠;鲢遗传连锁图谱的构建及精子竞争对性别间重组率差异的影响[D];中国海洋大学;2010年
4 林荔辉;应用分子和常规技术通过籼粳交选育亲籼型水稻雄性不育系[D];福建农林大学;2010年
5 王发明;柚(citrus grandis Osbeck)单染色体AFLP分子标记体系及文库的建立[D];福建农林大学;2010年
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8 石从广;油菜EMS诱变群体的构建以及油脂代谢相关基因等位多态性与油脂品质关系的研究[D];浙江大学;2010年
9 何小勇;翅荚木种源遗传多样性及其抗低温胁迫能力研究[D];中南林业科技大学;2007年
10 唐丽;湖南南天竹遗传多样性及园林利用评价体系研究[D];中南林业科技大学;2007年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 杨丹;湖北省油菜菌核病病菌多样性研究[D];华中农业大学;2010年
2 刘敏;基于SSR、ISSR和RAPD对大豆疫霉菌的遗传多样性研究[D];华中农业大学;2010年
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4 林兵;甘蓝型油菜A8连锁群种子含油量QTL簇解析及连锁累赘分析[D];华中农业大学;2010年
5 刘健;甘蓝型油菜C2连锁群种子含油量QTL簇及品质性状的分析[D];华中农业大学;2010年
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7 石伟平;二倍体马铃薯遗传群体构建和抗低温糖化分析[D];华中农业大学;2010年
8 杨盖宇;近等基因系群体的Ghd7和Qph1上位性分析[D];华中农业大学;2010年
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10 董巍;分子标记辅助选择改良光温敏核不育系的稻瘟病抗性和稻瘟病抗性基因的初步定位[D];华中农业大学;2010年
【同被引文献】
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1 罗瑞梧;杨崇良;尚佑芬;赵玖华;李长松;;山东省大豆花叶病毒株系鉴定[J];山东农业科学;1990年05期
2 尚佑芬,赵玖华,杨崇良,李长松,路兴波,辛相启,罗瑞梧;黄淮地区大豆花叶病毒株系鉴定[J];山东农业科学;1997年06期
3 滕彩珠;刁英;常福浩森;谢世清;韩永华;胡中立;;云南魔芋种质资源亲缘关系的ISSR分析[J];安徽农学通报;2006年11期
4 薛红;;增施氮、磷、钾和有机肥对大豆产量、品质的影响及经济效益分析[J];安徽农学通报(上半月刊);2009年07期
5 张为社,曹耿全,邓仰勇,汪胜军,吕令华,刘磊;大豆粒茎比和主要农艺性状关系的研究[J];安徽农业科学;2004年03期
6 张富厚;郑跃进;侯典云;韦淑亚;;大豆荚粒性状对单株产量的效应分析[J];安徽农业科学;2006年15期
7 黄清华;曹连莆;张新忠;黄天荣;吴新元;;数量性状定位及作物抗旱性分析研究进展[J];安徽农业科学;2007年21期
8 文阳平;贺浩华;王建革;徐景坤;孙晓磊;;关联分析及其在玉米中的研究进展[J];安徽农业科学;2009年19期
9 吕祝章;杨建华;李玉环;常汝镇;邱丽娟;;大豆农艺性状的QTL分析[J];安徽农业科学;2010年06期
10 赵春梅;金荣荣;刘英;;甜瓜种质资源遗传多样性ISSR分析[J];安徽农业科学;2012年01期
中国博士学位论文全文数据库 前10条
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9 谢华;中国大豆预选核心种质代表性样品遗传多样性研究[D];中国农业科学院;2002年
10 易克;西瓜遗传图谱的构建及其重要农艺性状的基因定位[D];湖南农业大学;2002年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
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2 程嘉琪;黄瓜核心种质的遗传多样性分析及白粉病抗性和低温耐受性评价[D];中国农业科学院;2011年
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4 吴项丹萍;湖桑种质资源遗传多样性分析及其核心种质初选[D];江苏科技大学;2011年
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8 赵剑峰;中美半矮秆大豆杂交后代高世代遗传多样性分析[D];东北农业大学;2001年
9 任旭琴;利用RAPD分子标记对红皮云杉种源遗传多样性的研究[D];东北林业大学;2001年
10 王全富 ;大豆植株氮素动态变化与籽粒蛋白质积累关系的研究[D];东北农业大学;2003年
【二级引证文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 周文才;熊冬金;;SSR标记技术在大豆中的应用[J];安徽农业科学;2007年11期
2 颜秀娟;李楠;李明姝;孙星邈;;分子标记在大豆育种中的应用现状[J];安徽农业科学;2008年13期
3 章彦俊;常宝;董建新;;不同大豆品种生理特性及产量的比较研究[J];安徽农业科学;2012年19期
4 罗瑞萍;赵志刚;姬月梅;连金番;;几个春大豆新品系的多元统计评价[J];安徽农业科学;2012年22期
5 张芳;谢皓;陈学珍;;大豆分子标记辅助育种研究进展[J];北京农学院学报;2010年02期
6 王晓丽;常楚瑞;宋聚先;邹佳宁;;天麻不同种质的AFLP和SSR分析[J];中华中医药杂志;2012年03期
7 薛永国;刘丽君;杨喆;高明杰;张雷;;大豆油分含量QTL分析[J];东北农业大学学报;2007年06期
8 田俊;宋雯雯;韩雪;高慕娟;杨继学;王继安;;大豆皂甙含量的QTL分析[J];东北农业大学学报;2010年10期
9 刘春燕;齐照明;韩冬伟;单大鹏;蒋洪蔚;陈庆山;胡国华;;大豆产量相关性状的多年多点QTL分析[J];东北农业大学学报;2010年11期
10 刘丽君;薛永国;赵贵兴;张雷;;大豆亚麻酸相关基因的标记与验证[J];大豆科学;2007年06期
中国重要会议论文全文数据库 前1条
1 刘春燕;栾淮海;裴宇峰;张维耀;刘业丽;何琳;陈庆山;胡国华;;大豆形态性状的QTL分析[A];中国作物学会2007年全国作物遗传育种学术研讨会论文集[C];2007年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 张超凡;湖南甘薯品种遗传多样性分析[D];中南大学;2010年
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3 周斌;大豆遗传连锁图谱的构建、整合及苗期耐旱性的QTL分析[D];南京农业大学;2009年
4 程浩;大豆异黄酮合酶,黄烷酮3-羟化酶基因SNPs与种子异黄酮含量及抗逆性的关联分析[D];南京农业大学;2008年
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6 梁慧珍;大豆子粒性状的遗传及QTL分析[D];西北农林科技大学;2006年
7 孟庆长;大豆GmNAC和GmLFY转录因子编码基因的克隆、鉴定和种子性状的QTL定位研究[D];南京农业大学;2006年
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10 王贤智;大豆产量相关性状的遗传与稳定性分析及QTL定位研究[D];中国农业科学院;2008年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
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7 刘玉林;大豆遗传图谱构建及重要农艺性状QTL定位[D];中国农业科学院;2011年
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9 冯耀文;木薯SBEⅡ和MeEFⅠ基因物理定位的研究[D];海南大学;2011年
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【二级参考文献】
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8 刘峰,庄炳昌,张劲松,陈受宜;大豆遗传图谱的构建和分析[J];遗传学报;2000年11期
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8 ;优质、丰产、多抗大豆新品种“中野1号”[J];中国农业科技导报;2001年04期
9 裴顺强;珍稀大豆新品种 黑魔豆[J];农技服务;2001年03期
10 彭宝,程砚喜,王雪飞;大豆新品种九农26[J];作物杂志;2002年03期
中国重要会议论文全文数据库 前5条
1 王晓群;付仲沛;;佳木斯地区大豆新品种适宜播期、适宜密度的确定及高产分析[A];中国气象学会2005年年会论文集[C];2005年
2 杨光宇;洋锋;;野生大豆在大豆育种中的应用[A];全面建设小康社会——中国科协二○○三年学术年会农林水论文精选[C];2003年
3 韩立德;;菜用大豆品质研究概况[A];食品安全的理论与实践——安徽食品安全博士科技论坛论文集[C];2005年
4 王国扣;;大豆产业发展概况[A];中国营养产业发展报告(2006)[C];2006年
5 彭德良;张东升;;大豆孢囊线虫病发生危害、生理小种及抗性鉴定研究进展[A];“植物保护21世纪展望”——植物保护21世纪展望暨第三届全国青年植物保护科技工作者学术研讨会文集[C];1998年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 记者 陈云芬;滇豆新品种增产促增收[N];云南日报;2008年
2 王朝霞;“金张掖”系列大豆新品种亮相“兰洽会”[N];农民日报;2009年
3 侯双龙 记者 石家家;大豆新品种助产业 增收两亿元[N];大连日报;2010年
4 实习生 曾勋 记者 曹湘黔;我市已有23个大豆新品种通过国家省审定[N];自贡日报;2010年
5 邓文桂 林贵发;清流国家大豆新品种示范喜获高产[N];三明日报;2010年
6 记者 蔡玉冰 通讯员 蒙丽 程艳波;华南农大新增一个大豆新品种[N];广东科技报;2011年
7 张宜军;沈阳农大育出大豆新品种“沈农7号”[N];农民日报;2003年
8 记者 张冬凡 师威;“奎丰1号”大豆新品种通过国家审定[N];铁岭日报;2008年
9 木子;大豆新品种开豆41号[N];河南科技报;2009年
10 ;河北选育成功无腥大豆新品种[N];国际经贸消息;2000年
中国博士学位论文全文数据库 前1条
1 陈丽丽;野大豆与栽培大豆杂交后代的鉴定评价研究[D];内蒙古农业大学;2013年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 章彪雄;大豆新品种中豆30配套栽培技术研究[D];江西农业大学;2011年
2 王慧;茉莉酸甲酯在大豆抗旱适应中保护作用的生理响应[D];中央民族大学;2011年
3 尹海龙;大豆miR169d的表达分析及功能验证[D];吉林农业大学;2013年
4 安磊;播期和密度对宁夏灌溉大豆的产量及品质影响研究[D];宁夏大学;2014年
5 徐晶;平头炭疽菌对大豆抗感品种的致病差异及其MAPK基因CtPMK1的功能研究[D];南京农业大学;2013年
6 杨旭;大豆新品种山宁16号适宜播期与种植密度的研究[D];山东农业大学;2013年
7 于淼;带鱼内源消化酶系酶解豆粕的研究[D];中国海洋大学;2012年
8 周莹;大豆幼荚全长cDNA文库的构建[D];吉林农业大学;2013年
9 李发院;栽培和野生大豆杂交后代SSR标记鉴定、耐盐性、GmsSOS1基因克隆及其表达分析[D];南京农业大学;2012年
10 张海波;TvNHX1基因转化大豆及其耐盐性分析[D];哈尔滨师范大学;2011年
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