收藏本站
《中国农业科学院》 2006年
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

猪肺组织中差异表达基因的筛选

董敏  
【摘要】:目前,猪呼吸系统疾病已成为我国许多规模化猪场和农村养猪大户十分关注的问题。猪的呼吸道疾病被认为是困扰猪场生产经营的主要问题之一,是造成最大经济损失的疾病。 猪呼吸系统疾病是多种因素综合作用的结果,除了传染性、环境以及管理因素等以外,还包括遗传因素。对猪肺组织炎症抗性的基因表达调控和分子机制目前还不是很清楚,本研究旨在通过分离和克隆与猪肺组织炎症抗性相关基因的探索性研究,初步揭示参与肺组织炎症抗性的基因种类和数量,为进一步深入开展肺组织炎症抗性的分子机理研究及将米通过遗传选择提高肺组织炎症的抗性提供理论基础。 1:本实验中首先应用抑制性消减杂交(SSH)技术成功构建了猪病变肺组织与健康肺组织著异表达cDNA文库。以大白猪为材料,通过SSH方法技术初步筛选到部分基因差异表达序列,并将这些序列产物纯化后与pGM-T Easy载体连接,转化大肠杆菌TOP10感受态细胞进行文库扩增,最终构建得到了具有高消减效率的猪肺组织炎症抗性相关cDNA文库。文库扩增后得到422个白色阳性克隆,随机挑选21个克隆进行PCR鉴定,鉴定结果表明插入片段主要分布在150-500bp之间。 2:随后将从抑制性消减杂交过程中筛选到的初步差异表达的基因片段,经过反Northern斑点杂交技术从消减cDNA文库中高通量筛选得到422个差异表达的克隆。分别用地高辛标记猪病变肺组织和无病变肺组织cDNA作为杂交探针,对构建的cDNA消减文库利用反向Northern斑点杂交技术筛选了41个差异表达克隆,测序后得到34个满意的EST序列。 3:根据在GenBank非冗余核酸数据库(nr)和EST数据库中BLASTn序列比对结果,将这些ESTs分为2类:第一类代表已知基因,共12个;第二类代表已知EST,共22个。代表已知基因的ESTs按照基因功能分为六类:信号转导与细胞间通信、细胞结构与运动、细胞与机体防御、物质转运、翻译与表达调控及其它。 4:结合相关文献初步探讨了部分猪肺组织炎症抗性相关差异表达基因的作用和意义,其中猪免疫球蛋白重链基因(LOC396781)、核转录因子—κB基因(NF—κB)、补体分子C1_q基因(C1QC)、钙粒蛋白B基因(S100A9)(calgranulin B gene)、平滑肌激动蛋白基因(ACTA2)、核糖体蛋白基因(RPS11) (RPS20)等基因可能在猪肺组织炎症抗性中发挥重要作用,但是这些基因之间通过何种方式相互作用促进肺组织炎症的发生还不十分清楚,有待进一步研究。
【学位授予单位】:中国农业科学院
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2006
【分类号】:S858.28

手机知网App
【参考文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 黄健华,苗雪霞,黄勇平;基因表达研究新方法SAGE和GLGI及其在家蚕功能基因组研究中的应用前景[J];蚕业科学;2004年04期
2 毛晓健;人类个体发育中的免疫球蛋白重链可变区基因谱型[J];中国当代儿科杂志;2002年05期
3 张莉娟,郑伟达,史美娜,王小众;白细胞介素10对大鼠肝星形细胞表达α-平滑肌肌动蛋白和核因子-κB的影响[J];福建医科大学学报;2005年01期
4 马雪云,韩建秋,牛钟相;补体C3b肽段的免疫功能[J];动物医学进展;2005年06期
5 范保星,张开泰,笪冀平,谢玲,王升启,吴德昌;联合应用SSH和cDNA Microarray筛选肺癌相关基因[J];中国肺癌杂志;2003年02期
6 罗小龙,孙沫逸,吕春堂,周中华,郭峰;肌动蛋白和S100蛋白在腺样囊性癌中的共表达及其意义[J];第二军医大学学报;2005年06期
7 郭延松,吴宗贵,杨军柯,黄高忠;三种大鼠动脉粥样硬化模型复制方法的比较[J];中国动脉硬化杂志;2003年05期
8 杨帆,刘卫平;核糖体蛋白基因及其与人类疾病的研究进展[J];临床与实验病理学杂志;2005年03期
9 王海震,李学仁,刘文波,周斌,苏鑫铭,冯秀丽,王旭东,陈溥言;猪瘟病毒保护抗原E2和猪IgG重链基因的合成及其表达蛋白[J];中国生物工程杂志;2004年02期
10 赵亮,童坦君,张宗玉;消减杂交筛选2BS细胞衰老过程中差异表达基因[J];中国生物化学与分子生物学报;2004年03期
中国硕士学位论文全文数据库 前2条
1 李文海;双肌臀大白猪肌肉组织差异表达基因的研究[D];中国农业大学;2004年
2 李文君;具C1q抑制活性C1q结合短肽的研究[D];第一军医大学;2002年
【共引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 王毓洲;白澎;张沪生;陈书长;李建业;马山;;肺鳞癌信号传导及免疫相关基因表达谱的初步研究[J];癌症进展;2006年01期
2 宋建平;李瑞琴;李伟;秦俊莲;张瑞;徐建明;田黎;马莉娜;;《金匮要略》不同方药对肺纤维化模型早期阶段的影响(一)[J];中华中医药杂志;2006年11期
3 马靖,何冰,李楠,张红;白细胞介素-18在肺纤维化大鼠肺组织中的表达[J];北京大学学报(医学版);2002年04期
4 张兴超;雷鹏;;S-100B蛋白在颅脑损伤中的表达及其修复作用[J];创伤外科杂志;2006年05期
5 梁应霞,李关荣,卢忠燕,鲁成;一种适用于蚕卵mRNA差异显示的方法[J];蚕业科学;2001年02期
6 李光乾,林忠东,焦颖,施旭来,叶秀云,胡鸿文;癫痫发作后患儿血清和脑脊液中神经元特异性烯醇化酶S-100β蛋白髓鞘碱性蛋白的变化[J];中国当代儿科杂志;2004年06期
7 高福,杨平,韩玲,蔡建明,黄越承,赵芳,李百龙,崔建国,孙顶;~(60)Coγ射线诱导的白血病小鼠中辐射致癌相关基因的筛选[J];第二军医大学学报;2003年07期
8 郭延松,吴宗贵,杨军柯,黄高忠;大鼠动脉粥样硬化不同阶段的血管紧张素变化[J];第二军医大学学报;2004年06期
9 郭慧琛,刘在新,孙世琪,刘光清,谢庆阁;口蹄疫基因疫苗研究进展[J];动物医学进展;2003年04期
10 杨新艳,刘培欣,单文鲁,曹殿军;mRNA差异显示技术及其改进[J];动物医学进展;2004年06期
中国重要会议论文全文数据库 前3条
1 董敏;王立贤;苏振环;程笃学;;抑制消减杂交构建大白猪肺组织抗性相关cDNA文库[A];中国畜牧兽医学会2006学术年会论文集(上册)[C];2006年
2 黄翠琴;陈宁;林瑞庆;宋慧群;朱兴全;;猪蛔虫感染期幼虫抑制消减cDNA文库的构建及分析[A];中国畜牧兽医学会2006学术年会论文集(下册)[C];2006年
3 华海婴;樊予惠;朱琳;;川芎嗪对肝星状细胞α-平滑肌肌动蛋白及核因子-κB的影响[A];第十届全国中药药理学术会议论文集[C];2007年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 张金林;坪草腐霉病菌除草活性毒素组分的分离鉴定与突变菌株的DDRT差异显示分析[D];河北农业大学;2005年
2 李关荣;家蚕sch系统胚胎期高温致死性的基因表达差异研究[D];西南农业大学;2002年
3 邢国宏;Ⅰ期低分化肺腺癌基因表达谱及Cyclin D1、MMP-2和pRb表达的临床意义[D];中国人民解放军军医进修学院;2003年
4 蒋宁;保肺方对肺间质纤维化大鼠模型细胞外基质代谢影响的实验研究[D];北京中医药大学;2003年
5 石锦萍;乌三颗粒抗肺癌药理作用及机理研究[D];成都中医药大学;2003年
6 周亦红;褐飞虱生物型的研究[D];南京农业大学;2003年
7 范贤明;STAT1、STAT1依赖性免疫反应基因ICAM-1在肺纤维化中的作用及反义寡核苷酸干预的研究[D];四川大学;2003年
8 郭慧琛;O型口蹄疫病毒多基因DNA疫苗的研制[D];中国农业科学院;2004年
9 范永山;玉米大斑病菌MAPK基因的克隆和功能分析[D];河北农业大学;2004年
10 刘颖超;拟南芥不同生态型对马铃薯晚疫病菌的抗性机制及抗病相关基因表达研究[D];河北农业大学;2004年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 郭英;上皮性恶性肿瘤外周血微转移检测及微转移基因芯片研制[D];东南大学;2003年
2 赵凯;高脂血症与大鼠内皮功能关系的实验研究[D];天津医科大学;2007年
3 陈丽娜;参莲方对大鼠动脉粥样硬化形成过程的初步研究[D];山东中医药大学;2005年
4 郭富平;17β-雌二醇对涎腺粘液表皮样癌高转移细胞系M_3SP_4细胞生物学特性的影响[D];第四军医大学;2005年
5 杨华;控制绵羊毛囊发育相关基因的筛选[D];石河子大学;2005年
6 胡玉崇;应用基因芯片筛查宫颈癌的相关基因[D];大连医科大学;2005年
7 郭江;丙型肝炎病毒p7蛋白反式调节作用的研究[D];山西医科大学;2005年
8 汪涛;IL-4在博莱霉素致大鼠肺纤维化模型中的表达及意义[D];重庆医科大学;2005年
9 孙雪松;芪红汤治疗特发性肺间质纤维化临床观察及机理初步探讨[D];北京中医药大学;2005年
10 刘朝晖;培哚普利、福辛普利对心衰细胞因子的影响比较[D];四川大学;2002年
【二级参考文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 范保星,张开泰,谢玲,项小琼,吴德昌;α粒子诱发人支气管上皮细胞恶性转化不同时期差异表达基因cDNA文库的构建[J];癌变.畸变.突变;2002年01期
2 葛世丽,李刚,陈伟,楼铁柱,吴德昌;SAGE方法分析永生化BEP2D细胞及α粒子诱发恶性转化BEP2D细胞的基因表达[J];癌症;2001年01期
3 姜润德,张立新,岳文,朱运峰,路浩军,刘昕,岑信棠,关新元,李春海;人鼻咽癌顺铂耐药细胞系(CNE2/DDP)的建立及耐药相关基因的筛选[J];癌症;2003年04期
4 罗小龙,孙沫逸,吕春堂,周中华,郭峰;肌动蛋白和神经细丝酸性蛋白在腺样囊性癌中表达的免疫电镜研究[J];第二军医大学学报;2005年06期
5 马长艳,周开亚,郭豫杰,王义权,赵乃刚,汪朝晖;中华绒螯蟹卵巢差减cDNA文库的构建[J];动物学研究;2003年01期
6 郑伟达,王小众,张莉娟,史美娜;分离肝星形细胞的简便方法[J];福建医科大学学报;2004年01期
7 郑伟达,王小众,张莉娟,史美娜,陈治新,陈运新,黄月红;大鼠肝纤维化过程星形细胞MMP-2的表达及白细胞介素10的影响[J];福建医科大学学报;2004年04期
8 史美娜,郑伟达,张丽娟,陈治新,王小众;转化生长因子β_1在白细胞介素10干预肝纤维化大鼠肝星形细胞的表达[J];福建医科大学学报;2004年04期
9 张云汉,殷智榕,温洪涛,陈东,高冬玲,姜国忠;食管癌相关基因片段的筛选与鉴定[J];河南医科大学学报;2001年05期
10 吴开云,高摄渊,袁融,庄文华;维生素D诱发大鼠动脉粥样硬化的实验研究[J];解剖学报;1996年02期
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 廖焰国,吴喜云,王俊杰;从英国引进杜洛克、汉普夏、长白及英国大白猪的生产性能测定[J];中国畜牧杂志;1982年02期
2 陈曙光;英系大白猪后备猪适宜粗蛋白质水平初探[J];养猪;1997年03期
3 吴同山,王敬军,胡毅军;大白猪的选育研究与推广[J];广东畜牧兽医科技;2002年03期
4 肖功炎,赖贻海;双肌臀大白猪生长情况观察[J];中国畜牧杂志;1999年04期
5 杨倩,毛卫华,赵如茜,唐晓萍,陈杰;太湖猪与大白猪小肠发育及其免疫功能形态学比较[J];南京农业大学学报;2001年04期
6 宋忠旭;彭先文;梅书棋;华升;;氟烷基因标记辅助选择技术在大白猪选育中的应用[J];养殖与饲料;2006年10期
7 肖功炎,熊慎苏,赖贻海;双肌臀大白猪生产性能及适应性观察[J];中国畜牧杂志;2002年02期
8 ;2004年度全国大白猪育种协作组年会在厦门召开[J];当代畜牧;2004年12期
9 何孔泉,陈伟华,张汤杰,陈杰;泌乳二花脸猪和大白猪下丘脑-垂体-性腺轴功能的比较研究[J];中国农业科学;2000年03期
10 肖功炎,吴志坚,熊慎苏,赖贻海,郑永林;双肌臀大白猪生产性能及适应性观察[J];江西畜牧兽医杂志;2001年03期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 赵云翔;谈成;刘德武;郑银彩;吴珍芳;;大白猪生长及繁殖性状有效遗传标记的鉴定[A];第十二次全国畜禽遗传标记研讨会论文集[C];2010年
2 文雅芹;李爱云;;应用PCR—RLFPs技术检测大白猪氟烷基因的研究[A];第四届中国畜牧兽医青年科技工作者学术研讨会论文集[C];2001年
3 邓振强;余丽明;;采用生物技术结合常规育种技术培育大白猪高繁殖力专门化品系[A];中国猪业发展大会论文集[C];2004年
4 黄志宏;王翀;陈瑶生;;ESR基因对大白猪繁殖性能的影响及基因频率变化研究[A];第六届动物遗传学讨论会论文集[C];2002年
5 李良良;雷明刚;;大白猪中H-FABP基因分子标记检测[A];中国动物遗传育种研究进展——第十五次全国动物遗传育种学术讨论会论文集[C];2009年
6 李发弟;赵茹茜;陈杰;;二花脸猪和大白猪睾丸组织中生长激素受体基因表达及发育性变化[A];中国生理学会第21届全国代表大会暨学术会议论文摘要汇编[C];2002年
7 卫忠;陈文广;;澳洲大白猪生长繁殖性能初步观察[A];第六届重庆饲料工业暨养殖行业发展战略研讨会论文集[C];2010年
8 侯春艳;黄江南;李小平;余梅;;不同品种猪在妊娠不同时期子宫内膜和绒毛膜上皮皱褶宽度差异的研究[A];第十二次全国畜禽遗传标记研讨会论文集[C];2010年
9 朱弘焱;苏玉虹;于百平;宋恒元;;猪抗病基因Mx1基因第14外显子多态性及免疫性状检测[A];东北养猪研究会2010学术年会论文专集[C];2010年
10 董敏;王立贤;苏振环;程笃学;;抑制消减杂交构建大白猪肺组织抗性相关cDNA文库[A];中国畜牧兽医学会2006学术年会论文集(上册)[C];2006年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 ;大约克(大白猪)[N];河南科技报;2004年
2 北京华都种猪繁育有限责任公司 王爱国 阎学军 宁海林 黄国英 牛爱东;法系大白猪选育总结[N];中国畜牧报;2004年
3 北京市房山种猪场 曹利 王学祥 刘金兰;大白猪饲养管理[N];中国畜牧水产报;2001年
4 记者杨健;两头大白猪生出黑白仔[N];人民日报;2003年
5 北京华都种猪繁育有限责任公司 韩子民;华都大白种猪实施科学繁育体系[N];中国畜牧报;2003年
6 北京华都种猪繁育有限责任公司 韩子民;求真务实 开拓进取[N];中国畜牧报;2003年
7 $$PIGS国际种猪公司中国区总经理 孙玉贤 博士 $$伟望种猪公司总工程师 樊生楠 教授;现代猪场快速有效的品种改良方案[N];中国畜牧水产报;2001年
8 吴日辉;广西有个龙宝猪[N];中国畜牧报;2002年
9 陕西省原种猪场 张强胜;猪的品种资源与利用[N];陕西科技报;2002年
10 北京华都种猪繁育有限责任公司 韩子民;培育有效持续的种猪企业核心竞争力[N];中国畜牧报;2003年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 高妍;东北民猪与大白猪背最长肌的差异表达基因研究[D];吉林大学;2011年
2 李发弟;生长轴激素在猪睾丸表达的发育性变化及其对睾酮分泌的影响[D];甘肃农业大学;2003年
3 周泉勇;大白猪和二花脸猪妊娠后期胎盘转录谱比较及印记基因鉴定研究[D];华中农业大学;2009年
4 徐永杰;猪肌肉组织差异蛋白质组学研究[D];华中农业大学;2010年
5 周波;猪正反交F_1代生长性能的差异及MicroRNA的鉴定与表达[D];南京农业大学;2010年
6 胥清富;生长激素作用的靶基因在猪肝脏和肌肉上的表达及调控[D];南京农业大学;2002年
7 乔木;猪胚胎期五个基因的分离、印记鉴定及甲基化分析[D];华中农业大学;2011年
8 晁哲;多基因标记辅助选择及Lbx基因家族的分子生物学研究[D];华中农业大学;2011年
9 杨晓静;猪骨骼肌生长及肌纤维类型分布的分子机理研究[D];南京农业大学;2004年
10 崔景香;猪肌内脂肪沉积相关基因的mRNA表达及功能分析[D];山东农业大学;2011年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 董敏;猪肺组织中差异表达基因的筛选[D];中国农业科学院;2006年
2 孙晓杰;经产大白猪和二花脸猪排卵前卵泡差异表达基因对母猪繁殖性能影响的研究[D];华中农业大学;2011年
3 王宪龙;野莱F1代猪肉品品质研究[D];山东农业大学;2011年
4 陈亚新;提高大白猪生长速度和体型外貌育种措施的研究[D];河北农业大学;2012年
5 李良良;应用分子标记技术选育高肌内脂肪含量大白猪新品系[D];华中农业大学;2010年
6 俄广鑫;猪SRPK1及SRPK3基因的克隆、表达及多态性研究[D];东北农业大学;2010年
7 祝继原;猪LXRα、HNF-4α基因多态性及其与生长性状的相关性分析[D];东北农业大学;2010年
8 邱峥艳;大白猪及其与莱芜猪杂交一代肌肉组织DNA甲基化程度差异分析[D];吉林大学;2013年
9 刘远;基于基因聚合策略选育高产仔数大白猪新品系的研究[D];华中农业大学;2010年
10 刘阳;猪PRDX2和PRDX6基因的分离及遗传效应分析[D];华中农业大学;2011年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62791813
  • 010-62985026