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《中国农业科学院》 2006年
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中国茸鹿分子遗传多样性研究

邢秀梅  
【摘要】:我国的茸鹿资源(梅花鹿和马鹿资源)十分丰富。为了进一步了解中国茸鹿遗传资源的遗传结构和系统进化,本研究采用微卫星标记和线粒体DNA技术对中国茸鹿的9个梅花鹿、马鹿品种和类型遗传多样性进行了分析。结果如下: 1、本研究利用20个微卫星标记对9个梅花鹿、马鹿品种和类型的699个个体进行DNA多态性测定和统计分析。计算了等位基因频率、遗传杂合度、多态信息含量、奈氏遗传距离和奈氏标准遗传距离,采用UPGMA及NJ法构建了系统发生树,估算了遗传分化时间。结果表明:本研究在牛羊的微卫星位点中首次借用了6个位点(BL42、MGTG7、BMC1009、BM4107、BM6506、BOVIRBP)应用到鹿的微卫星研究中。TGLA10、BM757、BM5004和IDVGA-29为单态位点,塔里木马鹿平均杂合度为0.2732,阿尔泰马鹿与东北马鹿期望杂合度均高于观察杂合度,说明其遭受到了不同程度的瓶颈效应。平均多态信息含量为0.4420,平均分化系数为0.2820,基因流的平均值为0.6830。系统聚类结果与中国茸鹿的地理分布基本一致,可以将马鹿资源分成四大类,天山马鹿和阿尔泰马鹿聚为一类,东北马鹿与左家马鹿聚为一类,甘肃马鹿为一类,塔里木马鹿为一类。梅花鹿资源分成两大类,东丰梅花鹿和左家梅花鹿聚为一类,兴凯湖梅花鹿为一类。马鹿和梅花鹿品种或类型间的遗传分化时间为86年-2086年。在梅花鹿中东丰梅花鹿和左家梅花鹿的分化时间最短,为110年;在马鹿中塔里木马鹿和东北马鹿的分化时间最长,为793年;阿尔泰马鹿和天山马鹿的分化时间最短,为86年。由此可见在同一地区的分化时间相对较小,而地域较远的品种或类型的分化时间较大。 2、利用线粒体DNA细胞色素b基因测定马鹿、梅花鹿441个个体的mtDNA序列长度为425bp的片段,检测到44种单倍型,56个变异位点,有18个颠换和38个转换。东北马鹿和左家马鹿包含的单倍型数目最多,为9个:天山马鹿、兴凯湖梅花鹿和东丰梅花鹿的的单倍型数目最少为3个。中国茸鹿群体内的P-距离为0.00695±0.00129,群体间的P-距离为0.03399±0.00519,总群的P-距离为0.04095±0.00635。用SAS8.0中的聚类分析中的类平均法对梅花鹿和马鹿进行聚类分析,塔里木马鹿自成一类;天山马鹿与阿尔泰马鹿先聚为一支,东北马鹿和左家马鹿聚在一起,然后分别与甘肃马鹿聚成一类;兴凯湖梅花鹿自成一类;东丰梅花鹿和左家梅花鹿聚成一类。这一结果与微卫星的检测结果大体一致。 3、通过建立一般线性模型对东北马鹿、甘肃马鹿、左家马鹿、东丰梅花鹿、兴凯湖梅花鹿、左家梅花鹿微卫星遗传标记的筛选。左家梅花鹿AB型鹿茸产量与左家梅花鹿从型鹿茸产量之间的差异显著(p=0.01080.05),AA型鹿茸产量明显高于AB型的鹿茸产量,A基因对产茸量的效应为正效应。兴凯湖梅花鹿的微卫星位点TGLA226的AB、BB型有显著差异(p=0.04160.05),兴凯湖梅花鹿的AB、BB型产茸量之间差异显著,AB型的鹿茸产量明显高于BB型。
【学位授予单位】:中国农业科学院
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2006
【分类号】:S865.42

【引证文献】
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1 邢秀梅;中国茸鹿分子遗传多样性研究[D];中国农业科学院;2006年
2 李光玉;梅花鹿、马鹿营养、血清IGF-1浓度及鹿茸生长规律研究[D];中国农业科学院;2005年
3 陈省平;赤点石斑鱼种群遗传多样性研究[D];中国海洋大学;2007年
4 季从亮;鸡肉IMP含量相关候选基因SNP筛查及其用于地方鸡种群体遗传结构分析的研究[D];扬州大学;2005年
5 王丽;珍稀濒危植物华山新麦草的胚胎学及其遗传多样性研究[D];西北大学;2005年
6 张敬虎;猪微卫星标记与杂种优势的关联分析和QTL定位[D];华中农业大学;2005年
7 吕慎金;梅花鹿的行为学及其分子标记研究[D];扬州大学;2008年
8 巴恒星;中国梅花鹿全基因组初步组装、分析及单核苷酸多态性研究[D];中国农业科学院;2012年
9 吴华;梅花鹿保护遗传学研究[D];浙江大学;2004年
10 高庆华;精子流式分离和低剂量授精研究及XY精子差异表达基因筛选[D];西北农林科技大学;2009年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 张苏云;新疆3个马鹿亚种的微卫星遗传多样性分析[D];石河子大学;2006年
2 刘宇庆;梅花鹿行为学及微卫星标记研究[D];扬州大学;2008年
3 熊建杰;西北地区4个中国特有鹿种的微卫星遗传多样性研究[D];西北农林科技大学;2010年
4 韩莉;染色体N带研究和用分子标记技术探讨东北梅花鹿遗传多态性[D];重庆师范大学;2009年
5 査代明;基于线粒体DNA序列的鹿产品分子检测[D];江苏科技大学;2010年
6 邓铸疆;西北马鹿群体遗传多样性及系统地位[D];西北农林科技大学;2010年
7 龚明川;肉兔微卫星标记遗传多态性分析及其与体重性状的相关研究[D];四川农业大学;2004年
8 刘健;贵州6个地方水牛群体的遗传多样性及亲缘关系研究[D];贵州大学;2006年
9 何铿;中国南方黄曲条跳甲不同地理种群的遗传多样性研究[D];福建农林大学;2006年
10 徐云翔;波尔山羊微卫星标记与多胎性关联的研究[D];华中农业大学;2008年
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