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《中国农业科学院》 2000年
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SSR标记在玉米杂种优势及遗传图谱中的应用研究

曹永国  
【摘要】: 分子标记技术的出现和发展为分子生物学尤其是基因组学的发展提供了技术方法和手段。随着人类基因组计划的实施,开创了以图谱制作与序列测定为目的的序列基因组学时代。由于人类基因组计划的顺利进展,提供了以往不可想象的巨量的生物学信息资源,推动了世纪之交的生物学走向以功能基因组学为标志的后基因组时代,从根本上改变了传统生物学的思维方式。而植物基因组学研究,目前正处于序列基因组学与功能基因组学并重的时代。DNA芯片技术是新近出现的DNA分析技术,其突出特点在于高度并行性、多样性、微型化和自动化。使它成为后基因组时代基因功能分析的最重要技术之一。生物信息学是近年来发展并完善起来的热门交叉学科。从新基因的发现,蛋白质的结构功能预测、疫苗的筛选到新药研制无不依赖于生物信息学,它在生物、医药、农业、环境等学科的应用已无所不在。由于杂种优势的利用在作物改良中的极端重要性,其遗传基础的研究长期以来一直受到高度重视。本文综述了上述各方面的研究进展。 SSR标记是建立在PCR反应基础上的一种新型遗传标记,其特点是位点多态性相对较高、技术简便、共显性标记,故在作物的遗传作图、基因定位、遗传差异研究等方面得到了广泛应用。 选择较为均匀地分布于玉米10条染色体上的71对SSR引物,在17个自交系间共检测出377个等位基因变异,每对引物检测出2~12个等位基因,平均为5.3个。每个SSR位点的多态信息量(PIC)变化于0.278~0.896之间,平均为0.672。利用377个多态性SSR标记位点计算了17个自交系之间的遗传相似系数(GS),其范围在0.681~0.873之间,平均为0.740。以SSR标记遗传相似系数为原始数据,按UPGMA方法对17个自交系进行聚类分析,以相似系数0.750为标准,可将17个自交系分为6类,聚类结果和已知系谱的亲缘关系大多数是十分吻合的。按照直线相关法,自交系间SSR分子标记遗传距离与产量及杂种优势均存在极显著的相关关系,但相关系数较小,分别为0.443和0.310。分群后进行的相关分析表明,遗传距离与产量以及遗传距离与杂种优势的相关系数分别提高为0.682和0.609,均达到极显著水平。因此,合理分类,并选择合适的自交系配制组合,可避免群内自交系间杂交,减少育种的盲目性和工作量。 在玉米的遗传改良中,株高是十分重要的性状。本研究在前期构建的具有85个RFLP标记连锁图谱的基础上,增加了17个SSR标记,用这些探针构建了具102个标记的玉米分子连锁图,覆盖玉米基因组1854.6cM,标记间平均间距为20.2cM。田间采用10×11简单矩形格子设计考查了106个F_(2:3)家系的株高。采用区间做图法,对株高性状的QTL分析,可将自交系5003的致矮作用剖分为具对立效应的两组共5个QTLs,起增效作用的有2个QTLs,另外3个起致矮作用。发现效应对立的两个表现超显性的主效QTL,一个是具增效作用的ph1,位于第2染色体上,可解释表型变异的51.8%:另一个是具致矮作用的ph3,位于第5染色体上,与矮生突变基因bv1的图位相同或相近,可解释表型变异的38.6%。所检测到的致矮主效QTLph3离最近的标记bnlg 278相距仅有0.4cM,而且该标记为SSR标记。因此,可利用这个基于PCR的分子标记对致矮主效QTL位点进行遗传操纵如标记辅助选择,而且还为将来利用基于图谱克隆该主效QTL基因奠定一定的基础。
【学位授予单位】:中国农业科学院
【学位级别】:博士后
【学位授予年份】:2000
【分类号】:S513

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【引证文献】
中国期刊全文数据库 前1条
1 韩永增;王赞;高洪文;;小叶锦鸡儿SSR-PCR体系优化及应用[J];草业科学;2011年03期
中国硕士学位论文全文数据库 前2条
1 韩永增;小叶锦鸡儿SSR引物开发及遗传多样性研究[D];兰州大学;2010年
2 李绪英;利用烟草野生种间F_2群体构建SSR分子标记遗传连锁图谱[D];云南农业大学;2012年
【参考文献】
中国期刊全文数据库 前3条
1 程宁辉,杨金水,高燕萍,徐明良,钱旻,葛扣麟;玉米杂种一代与亲本基因表达差异的初步研究[J];科学通报;1996年05期
2 胡建广,赵相山,袁自强,钱晓茵,程宁辉,杨金水;一个编码玉米转译起始因子新基因的克隆[J];科学通报;1998年02期
3 戴景瑞;玉米的矮生基因及其遗传效应[J];遗传;1979年05期
【共引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 张文兰,李群,谭振新,侯淑贞,崔梅;作物品种纯度快速鉴定技术及其应用[J];山东农业科学;2001年02期
2 柳展基;唐桂英;;玉米蛋白质组研究进展[J];山东农业科学;2007年04期
3 杜传印;王玉军;李斯深;李常保;刘洪祥;田纪春;;烟草AFLP银染分析体系的建立[J];山东农业科学;2007年05期
4 赵耀;刘康;李仕钦;陈光亮;郑海芳;李斌;钟英;张皓;;微卫星标记在种子质检工作中的应用[J];安徽农学通报(上半月刊);2011年07期
5 蔡健,赵小三;作物亲本间遗传差异与杂种优势研究进展[J];安徽农业科学;2002年04期
6 朱美霞;李英芝;王建书;侯英梅;孟艳玲;;利用SSR方法鉴定棉花品种纯度[J];安徽农业科学;2005年11期
7 刘冠明;郑奕雄;陈建萍;麦俊伟;黎国良;;汕油系列和粤油系列花生品种遗传多样性的SSR标记分析[J];安徽农业科学;2006年11期
8 于新艳;王凤格;赵久然;王玺;匡猛;;SSR标记及其在玉米研究中的应用[J];安徽农业科学;2007年07期
9 高双成;王世华;孔祥生;史国安;黄华;;mRNA差异显示技术及其在作物中的应用[J];安徽农业科学;2007年31期
10 许艳丽;鲍蕾;梁成珠;雷质文;林修光;汪东风;;黄曲霉毒素检测及其生物防治方法的研究进展[J];安徽农业科学;2007年32期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 李新海;袁力行;李明顺;;玉米品种纯度检验的方法与技术[A];作物科学研究理论与实践——'2000作物科学学术研讨会文集[C];2001年
2 刘宝;刘振兰;董玉柱;何孟元;黄百渠;郝水;Moshe Feldman;;多倍体小麦中迅速的基因组进化(英文)[A];Advances in Chromosome Sciences Volume1[C];2001年
3 孙其信;倪中福;吴利民;孟凡荣;王章奎;林展;;杂交种与亲本间基因差异表达与小麦杂种优势分子机理[A];21世纪作物科技与生产发展学术讨论会论文集[C];2002年
4 谭君;杨俊品;黄玉碧;孙仕贤;;利用SSR-DNA指纹的计算机分析鉴定玉米种子[A];2003年全国作物遗传育种学术研讨会论文集[C];2003年
5 于澄宇;胡胜武;郭蔼光;张春红;俞延军;;遗传标记与甘蓝型油菜杂种表现的关系[A];’2003中国作物学会学术年会文集[C];2003年
6 刘雪;李明顺;李新海;田清震;白丽;张世煌;;利用SSR标记分析玉米群体遗传变异的取样方法[A];2004全国玉米种质扩增、改良、创新与分子育种学术会议论文集[C];2004年
7 ;Genetic Relationship among Maize Populations Assessed Based on Yield SCA and SSR Markers[A];2004全国玉米种质扩增、改良、创新与分子育种学术会议论文集[C];2004年
8 李玉玲;王延召;吕德彬;陈绍江;汤继华;;爆裂与普通玉米自交系间的遗传关系及杂种优势预测研究[A];2004全国玉米种质扩增、改良、创新与分子育种学术会议论文集[C];2004年
9 番兴明;谭静;陈洪梅;黄云霄;段智利;杨荣芬;徐春霞;;利用配合力和SSR标记对热带和温带玉米自交系进行杂种优势群划分[A];2004全国玉米种质扩增、改良、创新与分子育种学术会议论文集[C];2004年
10 席章营;;作物次级作图群体的研究进展[A];2004全国玉米种质扩增、改良、创新与分子育种学术会议论文集[C];2004年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 黄俊骏;DNA甲基转移酶基因的表达和花粉母细胞DNA的甲基化[D];兰州大学;2010年
2 林荔辉;应用分子和常规技术通过籼粳交选育亲籼型水稻雄性不育系[D];福建农林大学;2010年
3 黄明;分子标记与水稻遗传多样性及杂种优势的相关性研究[D];湖南农业大学;2010年
4 史金铭;空间和重离子辐射环境的诱变效应与DNA甲基化变化的关联[D];哈尔滨工业大学;2010年
5 赵桂琴;不同早熟禾的杂交及杂种优势预测研究[D];甘肃农业大学;2000年
6 吴晓林;用分子标记预测植物和动物杂种优势的研究[D];湖南农业大学;2000年
7 杨蜀岚;水稻eui2基因的发现、遗传及其分子标记和定位[D];福建农林大学;2000年
8 钟代斌;水稻抗白叶枯病和抗倒伏性的分子剖析[D];中国农业科学院;2000年
9 王心宇;分子标记技术在小麦抗白粉病育种及指纹图谱分析中的应用研究[D];南京农业大学;2000年
10 万平;小麦Rht3,Gai3基因的分子标记和被导入外源染色体的部分同源群归属研究[D];南京农业大学;2000年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 朱家立;亚基因组杂种优势表现的评估及新型甘蓝型油菜FAE1指纹图谱分析[D];华中农业大学;2010年
2 李炫丽;ms2Bnap同源序列在萝卜—芥蓝异源四倍体中的克隆及表观遗传变异分析[D];华中农业大学;2010年
3 张庆路;利用重组自交系群体定位一般配合力相关性状QTL[D];华中农业大学;2010年
4 田雨;转基因抗虫恢复系配合力研究及强优势组合选育[D];华中农业大学;2010年
5 王彦玲;我国玉米核心种质磷胁迫蛋白质表达差异和基因组SSR分析[D];郑州大学;2010年
6 林少航;外源甲基紫精对盐胁迫下黄瓜叶片抗氧化酶与DNA甲基化的影响[D];山东农业大学;2010年
7 刘忠静;外源过氧化氢对干旱胁迫下两种生态型黄瓜叶片抗氧化酶与DNA甲基化的影响[D];山东农业大学;2010年
8 李启芳;玉米矮秆基因Dt的精细定位及其矮化机理的初步研究[D];山东农业大学;2010年
9 吴世文;不同小麦雄性不育类型AGPase活性及杂种光合特性的分析[D];山东农业大学;2010年
10 李卓坤;小麦苗期性状QTL定位及株高杂种优势的遗传分析[D];山东农业大学;2010年
【同被引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 李艳;朱列书;胡日生;詹良;;烟草种质资源研究进展[J];安徽农学通报;2008年09期
2 白玉;;DNA分子标记技术及其应用[J];安徽农业科学;2007年24期
3 艾鹏飞;方闪闪;甄志军;靳占忠;;仁用杏SSR反应体系的建立与优化[J];北方园艺;2009年08期
4 宋俊双;王赞;高洪文;;三种锦鸡儿遗传多样性ISSR分析(简报)[J];草地学报;2006年04期
5 张丽芳;魏臻武;杨占花;;蒺藜苜蓿SSR反应体系优化及在一年生苜蓿种质鉴定中的应用[J];草地学报;2007年05期
6 郭强;时永杰;魏臻武;杨占花;卢娟;贾艳琼;;河西走廊14种锦鸡儿遗传多样性SSR分析[J];草地学报;2008年03期
7 解新明,卢小良;SSR和ISSR标记及其在牧草遗传与育种研究中的应用前景[J];草业科学;2005年02期
8 孙建萍;袁庆华;;利用微卫星分子标记研究我国16份披碱草遗传多样性[J];草业科学;2006年08期
9 李香真,张淑敏,邢雪荣;小叶锦鸡儿灌丛引起的植物生物量和土壤化学元素含量的空间变异[J];草业学报;2002年01期
10 谢文刚;张新全;马啸;黄琳凯;曾兵;;中国西南区鸭茅种质遗传变异的SSR分析[J];草业学报;2009年04期
中国博士学位论文全文数据库 前6条
1 陈庆山;大豆灰斑病种质资源遗传多样性的RAPD和SSR分析[D];东北农业大学;2001年
2 魏臻武;苜蓿遗传多样性分子标记及其种质资源评价[D];甘肃农业大学;2003年
3 王赞;柠条锦鸡儿遗传多样性研究[D];中国农业大学;2005年
4 张永生;玉米遗传图谱构建和花粉管通道法转化玉米的研究[D];山东大学;2005年
5 张震;小叶锦鸡儿对不同放牧强度的生物学响应[D];中国科学院研究生院(植物研究所);2006年
6 王付华;水稻RIL群体SSR标记遗传图谱构建和耐冷相关性状QTL的定位[D];南京农业大学;2006年
中国硕士学位论文全文数据库 前8条
1 张阿英;中国紫花苜蓿(Medicago Sativa L)地方品种SSR分析[D];东北农业大学;2002年
2 张静;利用SSR分子标记研究山杨杂种无性系的遗传多样性[D];东北林业大学;2003年
3 韩香婷;大白菜抗软腐病性状的SSR分子标记分析[D];首都师范大学;2006年
4 杨静;黑龙江省水稻品种SSR标记遗传多样性分析[D];东北农业大学;2006年
5 那潼;两种锦鸡儿种子人工老化中生理生化变化及基因组DNA损伤的ISSR研究[D];扬州大学;2007年
6 吴宗怀;紫花苜蓿、杂花苜蓿和黄花苜蓿SSR分子标记分析[D];内蒙古农业大学;2007年
7 徐博;内蒙古东部野生小叶锦鸡儿遗传多样性研究[D];中国农业科学院;2009年
8 高加明;烟草青枯病抗性基因的分子标记研究[D];中国农业科学院;2010年
【二级参考文献】
中国期刊全文数据库 前2条
1 程宁辉,杨金水,高燕萍,徐明良,钱旻,葛扣麟;玉米杂种一代与亲本基因表达差异的初步研究[J];科学通报;1996年05期
2 杨金水,王光清;植物转基因的失活与沉默[J];生物工程进展;1995年03期
【相似文献】
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1 宋方威;彭惠茹;刘婷;张义荣;孙其信;倪中福;;利用三重测交群体剖析玉米株高与穗位高杂种优势的遗传学基础[J];作物学报;2011年07期
2 季洪强;常纪苹;付志远;丁冬;谭晓军;汤欣欣;刘宗华;;玉米植株抗倒伏性状的遗传分析[J];河南农业大学学报;2011年03期
3 王利英;乔军;石瑶;李素文;;基于SSR优化反应体系的茄子亲子鉴定[J];山西农业科学;2011年08期
4 ;《基因组学与应用生物学》征订启事[J];基因组学与应用生物学;2011年03期
5 ;我国本年度将进口500万吨玉米[J];畜禽业;2011年08期
6 ;2011/12年度世界玉米供需(美国农业部月度预测)[J];农业展望;2011年08期
7 施雪艳;王顺领;;玉米空棵的原因及防治措施[J];农家参谋(种业大观);2009年05期
8 周文革;;玉米高产栽培技术[J];吉林农业;2011年06期
9 ;《基因组学与应用生物学》征稿启事[J];基因组学与应用生物学;2011年03期
10 ;基因组学与应用生物学论文编写指南[J];基因组学与应用生物学;2011年03期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 王晓阳;李火根;;利用SSR分子标记探测鹅掌楸杂种优势机理[A];第六届全国林木遗传育种大会论文集[C];2008年
2 王泽立;祝静静;靳亮;李新征;;玉米杂种优势分子基础探讨[A];2005年全国作物遗传育种学术研讨会暨中国作物学会分子育种分会成立大会论文集(一)[C];2005年
3 谭静;番兴明;杨峻芸;陈洪梅;杨荣芬;;玉米分子标记遗传距离与产量杂种优势关系的研究[A];云南省作物学会2000—2003年优秀论文选集[C];2004年
4 严建兵;郑用琏;;玉米杂种优势遗传基础及玉米与水稻比较基因组研究[A];湖北省暨武汉市生物化学与分子生物学学会第七届第十四次学术年会论文摘要集[C];2003年
5 赵庆勇;张亚东;朱镇;陈涛;周丽慧;姚姝;赵凌;王才林;;采用SSR标记和表型性状聚类对杂交粳稻亲本的遗传多样性研究[A];现代分子植物育种与粮食安全研讨会论文集[C];2011年
6 赵庆勇;张亚东;朱镇;赵凌;陈涛;周丽慧;王才林;;采用SSR标记和表型性状聚类对杂交粳稻亲本的遗传多样性研究[A];江苏省遗传学会第八届会员代表大会暨学术研讨会论文集[C];2010年
7 艾烨;刘太国;高利;陈万权;;SSR分子标记及其在植物病原真菌研究中的应用[A];中国植物病理学会2010年学术年会论文集[C];2010年
8 徐晓薇;江南;杨俊波;杨燕萍;王丽芳;;寒兰株系间的遗传多样性和亲缘关系的SSR分子标记分析[A];中国观赏园艺研究进展2011[C];2011年
9 张月华;李刚;赵云坡;徐安英;沈兴家;孙平江;钱荷英;苗雪霞;黄勇平;郭锡杰;;利用SSR标记对家蚕多星纹基因(ms)进行定位分析[A];江苏省遗传学会第八届会员代表大会暨学术研讨会论文集[C];2010年
10 张鹏;刘向东;李金泉;李晓玲;卢永根;;利用SSR标记对水稻核心收集群体结构和遗传多样性的研究[A];2010中国作物学会学术年会论文摘要集[C];2010年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 杨焕明;有的放矢,促进我国“个体基因组学”发展[N];人民政协报;2009年
2 王进;基因组学年代正式终结[N];医药经济报;2009年
3 本报记者 朱广菁;个性化医疗研究成国际基因组学热点[N];大众科技报;2009年
4 记者 李嫦娟 通讯员 蒋婷燕;第四届国际基因组学大会在深召开[N];广东科技报;2009年
5 记者 谭大跃 第五燕燕 实习生 栗洋洋;200余国际顶尖科学家聚深探讨宏基因组学[N];深圳特区报;2010年
6 本报记者 李大庆;迎接基因组学新时代的到来,我们准备好了吗?[N];科技日报;2010年
7 记者 贾少强 通讯员 王静思;国际基因组学 大会在深召开[N];深圳商报;2010年
8 记者 易运文;华大基因研究院领先国际基因组学研究[N];光明日报;2010年
9 本报记者 沈湫莎;基因组学造福百姓还缺口气[N];文汇报;2011年
10 本报记者 刘旭;我国玉米出口增势将放缓[N];国际商报;2005年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 曹永国;SSR标记在玉米杂种优势及遗传图谱中的应用研究[D];中国农业科学院;2000年
2 兰进好;玉米强优势组合重要性状杂种优势遗传基础研究[D];沈阳农业大学;2005年
3 严建兵;玉米杂种优势遗传基础及玉米与水稻比较基因组研究[D];华中农业大学;2003年
4 杜金昆;小麦ISSR标记遗传差异及赤霉素代谢调控与杂种优势机理[D];中国农业大学;2004年
5 谢晓东;小麦杂交当代和亲本自交种子发育早期的基因表达差异与杂种优势[D];中国农业大学;2003年
6 杨俊品;玉米分子遗传图谱构建及数量性状基因定位[D];四川农业大学;2001年
7 武耀廷;棉花产量性状杂种优势的遗传基础研究[D];南京农业大学;2001年
8 马朝芝;甘蓝型油菜遗传多样性和杂种优势的研究[D];华中农业大学;2002年
9 王章奎;普通小麦杂交种与亲本间根系基因表达差异与杂种优势分子机理[D];中国农业大学;2004年
10 权瑞党;农杆菌介导的玉米转化技术的改进及转betA基因玉米抗逆性分析[D];山东大学;2003年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 蒋守华;多叶玉米主要性状配合力及其杂种优势的研究[D];扬州大学;2004年
2 刘玉强;玉米生物诱导孤雌生殖DH系遗传分析与青枯病抗性研究[D];中国农业大学;2005年
3 李美娜;玉米主要性状基因效应及杂种优势分子标记的研究[D];内蒙古农业大学;2005年
4 张富;玉米苗期根系杂种优势及根系基因表达谱分析[D];中国农业大学;2004年
5 廖勇;AFLP分子标记与米产量杂种优势的关系的研究[D];中国农业大学;2003年
6 王元东;玉米P群种质的杂种优势表现及在温带育种中的利用潜力[D];中国农业大学;2004年
7 蒋玮;不同类型啤酒大麦品种遗传多样性及遗传差异的SSR分析[D];甘肃农业大学;2010年
8 徐新福;分子标记预测甘蓝型油菜杂种优势的初步研究[D];西南农业大学;2005年
9 马倩;玉米种质更新过程中遗传完整性变化的影响因素研究[D];中国农业科学院;2005年
10 王新军;玉米基因差异表达与杂种优势的关系[D];中国农业大学;2004年
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