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中国西门塔尔牛5个基因SNPs及表达量与经济性状关联分析

李姣  
【摘要】: 本试验以同龄、同场的135头中国西门塔尔牛公牛为研究对象,利用DNA序列分析、PCR-RFLP和DNA测序等技术检测GH、GHR、CAPN1、CAST和Leptin基因上的12个SNPs,采用最小二乘法拟合线性模型分析这些SNPs标记对中国西门塔尔牛经济性状的影响。同时,采用荧光定量双标准曲线法分析50头牛背最长肌中CAPN1和CAST基因表达量,并对CAPN1和CAST基因表达量及它们表达量比值CAPN1/CAST与牛经济性状进行相关分析。本试验旨在找到对该品种牛经济性状有重要影响的功能基因或分子标记,为中国西门塔尔牛重要经济性状的分子标记辅助选择及品系培育提供科学依据。主要结果如下: 1.采用PCR-RFLP检测GH-P3、CAPN1 316、CAPN1 4751、UoG-CAST、CAST-T1、CAST2870和E2-FB的多态性,并与经济性状进行关联分析发现:(1)GH-P3位点BB型个体胴体重和净肉重极显著高于AA型和AB型个体(P0.01),屠宰率和净肉率分别比其他基因型高出5%和6%(P0.05),背膘厚比AA型个体高0.09 cm(P0.01);(2)CAPN1 316位点与大理石花纹呈显著相关(P0.05),两种纯合型个体眼肌肉大理石花纹优于杂合型个体;(3)CAPN1 4751位点AA型个体眼肌肉大理石花纹优于AB型(P0.05),剪切力值也比BB型个体低1.11 k(gP0.05);(4)UoG-CAST位点BB型个体背膘厚比AB型高0.08 cm,胴体重和净肉重分别比AB型显著提高22.69 kg和21.15 kg,而宰前活重与其他基因型个体无显著差异(P0.05);(5)CAST-T1位点对剪切力有极显著影响(P0.01),AA型个体剪切力比AB型和BB型分别高0.95 kg和1.19 kg,宰前活重比AB型低28.14 kg(P0.01);(6)CAST2870位点对胴体重和净肉重有显著影响,BB型个体屠宰率比其它基因型高5%,净肉率高5%~6%(P0.05);(7)在试验中未发现E2-FB位点与经济性状有显著相关(P0.05)。 2.采用直接测序法检测GHR279和UASMS2位点多态性,与经济性状进行关联分析发现:(1)在试验群体中未发现GHR279位点与经济性状有显著相关(P0.05);(2)UASMS2位点对平均日增重和剪切力有显著影响(P0.05),BB型个体剪切力比AB型和AA型分别低2.19 kg和1.96 kg(P0.01)。 3.研究中新发现三个SNPs,分别是GHR299、UASMS2-1和UASMS2-2,直接测序法分型并与经济性状关联分析发现:(1)GHR299位点对育肥前体重有显著影响(P0.05);(2)UASMS2-1位点与胴体重和净肉重极显著相关(P0.01),BB型个体胴体重比AB型和AA型分别高出26.3%和22.0%,净肉重分别高出29.2%和24%,剪切力高1.31 kg和1.78 kg(P0.05);(3)UASMS2-2位点与大理石花纹极显著相关(P0.01),AA型个体大理石花纹评分极显著高于AB型,在本群体中未发现BB型个体。 4. CAPN1 4751、UoG-CAST、CAST-T1和CAST2870位点不同基因型个体相应基因表达量均无显著差异(P0.05);CAPN1基因表达量与育肥前体重和剪切力呈显著负相关(P0.05),相关系数(R)分别是-0.295和-0.330;CAST基因表达量与宰前活重呈显著负相关(P0.05,R:-0.293);CAPN1/CAST也与剪切力呈显著负相关(P0.05,R: -0.304)。


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