收藏本站
《中国农业科学院》 2010年
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

大豆胞囊线虫抗病候选基因rhg1多样性及分子标记开发与利用

南海洋  
【摘要】: 大豆胞囊线虫(Heterodera glycines Ichinohe),英文名称是Soybean Cyst Nematode,简称SCN,是造成大豆减产的主要病害之一。实践证明培育和种植抗病品种是防治病害的最有效途径,研究大豆胞囊线虫抗病基因并根据抗病基因开发的标记用于分子标记辅助育种是加快抗病品种选育进程的基础。rhg1作为大豆胞囊线虫抗病候选基因能解释SCN3号生理小种贡献50%以上的抗性,本研究首先通过对5份大豆资源rhg1同源序列分子分析以明确rhg1在大豆基因组上的同源基因及rhg1基因进化模型;随后对57份栽培大豆材料的rhg1的多样性进行分析及控制群体结构的GLM关联分析,阐明rhg1基因SNP的发生频率及分布特点,发掘与SCN抗性相关的SNP位点;最后对57份大豆资源rhg1序列中的InDels位点与大豆资源的抗性进行了关联分析,发掘与SCN抗性相关InDels标记。为合理利用大豆种质拓宽抗性遗传基础以及SNP标记辅助选择提供理论依据和技术手段。 主要研究结果如下: 1.明确了rhg1与其同源基因的进化关系。克隆了多年生野生大豆(2份)、一年生野生大豆(1份)和栽培大豆地方品种(1份)及选育品种(1份)的rhg1及其同源序列,两者位于染色体Gm18和Gm11上,结构预测显示rhg1与其同源基因皆具有抗病基因结构,进化分析推测新基因产生的模型为EAC模型,rhg1具有新基因功能,而rhg1同源基因为祖先基因。 2.明确了rhg1的序列多态性及SNP发生规律。57份材料的rhg1全基因共发现63个SNPs,包括57个碱基替换和5个Indels,突变频率为1/80.6,共发现错义突变位点9个,其中3个发生在基因结构域内(均发生在激酶结构域内)。57份大豆种质的rhg1基因多样性π为0.00313,θ为0.00255;地方大豆的序列多态性(π为0.00335,0为0.00273)明显高于选育大豆(π为0.00206,θ为0.00227),说明了rhg1基因在育种中受到人工选择的作用。rhg1单倍型分析显示HAP-3和HAP-4为参试材料的优势单倍型,且这两个单倍型为抗病相关的单倍型。 3.扫描到与SCN抗性相关的SNP位点。通过57份大豆资源rhg1候选基因与SCN抗性的关联分析发现:57份大豆资源组成的自然群体中存在遗传结构,位于rhg1基因2480bp位置SNP位点(G/A)与SCN抗感表型显著相关(0.05水平),但是这个位于激酶结构域内的SNP未导致氨基酸的变化,其对抗性的贡献机制还需进一步研究。 4.发掘与SCN抗性相关的InDels标记。根据rhg1序列中的插入删除位点开发了3个InDels标记,33份材料中rhg1-I4等位变异与大豆胞囊线虫抗病性相关。将rhg1-I4标记与satt309配合使用,在胞囊线虫抗病资源鉴定上的效率为88.2%,显著提高了标记辅助选择的效率。
【学位授予单位】:中国农业科学院
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2010
【分类号】:S565.1

手机知网App
【参考文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 郑延海,张坤普,王少杰,杨秀凤,戴忠民,穆吉珍;优质高产抗病夏大豆新品系——德豆99-16[J];山东农业科学;2004年03期
2 张磊,戴瓯和,刘玉梅,陈品三;抗孢囊线虫病夏大豆皖豆16号的选育[J];安徽农业科学;1997年02期
3 张仁双,牛颖英,包力光,高连军;大豆孢囊线虫病抗源品种鉴定筛选研究[J];大豆科学;1985年02期
4 刘汉起,商绍刚,霍虹,吴和礼;大豆品种对大豆孢囊线虫1、3、4号小种的抗性[J];大豆科学;1989年01期
5 商绍刚,刘汉起;东北三省大豆孢囊线虫生理小种分布情况[J];大豆科学;1989年04期
6 田清震,盖钧镒;大豆起源与进化研究进展[J];大豆科学;2001年01期
7 吴海燕,远方,陈立杰,段玉玺;大豆胞囊线虫病与大豆抗胞囊线虫机制的研究[J];大豆科学;2001年04期
8 王文辉,邱丽娟,常汝镇,马凤鸣,谢华,林凡云;中国大豆种质抗SCN基因rhg1位点SSR标记等位变异特点分析[J];大豆科学;2003年04期
9 袁翠平;李英慧;刘章雄;关荣霞;常汝镇;邱丽娟;;一种大豆SNP分型新方法[J];大豆科学;2007年04期
10 高亚梅;韩毅强;杜吉到;刘金文;;大豆抗胞囊线虫基因Rhg 1和Rhg 4产物基本性质分析与结构预测[J];大豆科学;2007年05期
中国博士学位论文全文数据库 前1条
1 李英慧;中国大豆地方品种遗传多样性分析及大豆抗胞囊线虫SNAP标记发掘[D];中国农业科学院;2005年
【共引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 郝欣先,蒋惠兰,高建伟,吴建军;孢囊线虫抗性基因导入及夏大豆高产材料创造研究[J];山东农业科学;2000年03期
2 管延安;杨延兵;张华文;王玉海;王洪刚;;基因组学辅助作物改良研究进展[J];山东农业科学;2008年01期
3 徐冉;王彩洁;张礼凤;李伟;戴海英;;高油双抗夏大豆品种齐黄33的选育[J];山东农业科学;2008年02期
4 张玉红;梁燕;陈利平;赵世杰;;人工气候室条件下冬小麦DH群体苗期光合性状基因定位实验设计与实施[J];山东农业科学;2008年08期
5 张自坤;刘世琦;张强;王忠全;孟凡鲁;于晓丽;;根结线虫对不同砧木黄瓜嫁接苗生理生化指标的影响[J];山东农业科学;2009年07期
6 金国良;王富;霍雨猛;何启伟;徐苑芳;;耐根结线虫瓜类砧木的筛选[J];山东农业科学;2010年05期
7 王培明;冯向阳;冯春玲;王伟;;昌乐县根结线虫病发生情况调查[J];山东农业科学;2011年02期
8 沈阳;;植物病原线虫的危害及其防治策略初探[J];安徽农学通报;2007年18期
9 王会艳;徐香玲;李集临;;不同抗性大豆品种对大豆孢囊线虫发育的影响[J];安徽农学通报;2007年20期
10 袁辉;赵从凯;赵洪海;;牡丹根际寄生线虫种类概述[J];安徽农学通报(上半月刊);2010年15期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 张爱民;薛建平;;药用植物种质资源保存的研究进展[A];中医药理论与应用研究——安徽中医药继承与创新博士科技论坛论文集[C];2008年
2 刘春燕;栾淮海;裴宇峰;张维耀;刘业丽;何琳;陈庆山;胡国华;;大豆形态性状的QTL分析[A];中国作物学会2007年全国作物遗传育种学术研讨会论文集[C];2007年
3 于清岩;刘春燕;王家麟;胡国华;陈庆山;;大豆花色的QTL分析[A];中国作物学会2007年全国作物遗传育种学术研讨会论文集[C];2007年
4 姚明哲;乔婷婷;马春雷;金基强;陈亮;杨亚军;;利用EST-SSR基因分型研究分子标记与茶树表型性状的关联性[A];中国茶叶科技创新与产业发展学术研讨会论文集[C];2009年
5 李曼莉;韩建国;王赟文;汤山奈奈;平田球子;才宏伟;;结缕草高密度SSR标记遗传连锁图谱的构建[A];中国草学会草坪专业委员会2010年学术年会论文集[C];2010年
6 付家兵;廖红;董英山;严小龙;;大豆根构型性状遗传分析及其与磷效率的关系[A];第九届中国青年土壤科学工作者学术讨论会暨第四届中国青年植物营养与肥料科学工作者学术讨论会论文集[C];2004年
7 许艳丽;陈伊里;司兆胜;李兆林;李春杰;温广月;;不同茬口条件下作物的根渗出物对大豆胞囊线虫卵孵化的影响[A];农业生物灾害预防与控制研究[C];2005年
8 常祖明;胡变英;李维蛟;郭恺;周厚发;胡先奇;;云南省空心莲子草根结线虫病病原鉴定[A];粮食安全与植保科技创新[C];2009年
9 尚二莹;彭德良;段玉玺;;烟草根结线虫研究现状和展望[A];中国植物病理学会第六届青年学术研讨会论文集——植物病理学研究进展(第五卷)[C];2003年
10 刘大伟;段玉玺;陈立杰;;灰皮支黑豆(ZDD2315)抗大豆胞囊线虫病的研究进展[A];中国植物病理学会2009年学术年会论文集[C];2009年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 白洁;太平洋牡蛎分子标记的开发与应用研究[D];中国海洋大学;2010年
2 刘凤楼;大麦成株叶锈病抗性基因的发掘、分子标记及遗传研究[D];西北农林科技大学;2010年
3 陈景堂;玉米×Teosinte远缘杂种后代重要性状的表型及遗传分析[D];河北农业大学;2011年
4 张轲;利用三亲本复合杂交群体构建陆地棉遗传连锁图谱与纤维品质QTL定位[D];西南大学;2011年
5 杨慧;云南糯稻遗传多样性研究[D];云南农业大学;2011年
6 王丽鸳;基于EST数据库和转录组测序的茶树DNA分子标记开发与应用研究[D];中国农业科学院;2011年
7 张圣平;黄瓜果实苦味基因遗传分析及精细定位[D];中国农业科学院;2011年
8 成飞雪;光合细菌代谢产物5-氨基乙酰丙酸杀线虫作用及其机理研究[D];湖南农业大学;2011年
9 刘仙俊;大麦特异种质资源的分子生物学研究[D];四川农业大学;2011年
10 曾兴;144份玉米自交系纹枯病抗性相关性状的关联分析[D];四川农业大学;2011年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 迟丽达;几种土壤熏蒸剂对姜瘟菌及其他土传病原物的防控效果研究[D];华中农业大学;2010年
2 汤珏婷;1,3-二氯丙烯在土壤环境中的行为及其对土传病原物的防控研究[D];华中农业大学;2010年
3 彭英;水稻脯氨酸累积相关基因多样性及与苗期耐盐性关系[D];华中农业大学;2010年
4 刘健;甘蓝型油菜C2连锁群种子含油量QTL簇及品质性状的分析[D];华中农业大学;2010年
5 郭一鸣;全球白菜型油菜遗传多样性分析[D];华中农业大学;2010年
6 汪航;“柏拉玛地”玉米大斑病无病斑型抗性基因HtNB的定位[D];华中农业大学;2010年
7 王朝军;几种辣根素类化合物熏蒸活性研究及EITC合成工艺优化探讨[D];华中农业大学;2010年
8 韩芳;甘蓝型油菜A3染色体遗传连锁图谱的构建[D];华中农业大学;2010年
9 朱明涛;分子标记辅助番茄自交系改良及其配合力的测定[D];华中农业大学;2010年
10 李卓坤;小麦苗期性状QTL定位及株高杂种优势的遗传分析[D];山东农业大学;2010年
【二级参考文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 郝欣先,蒋惠兰,高建伟;山东省农科院育成抗孢囊线虫病的黄豆系列品系[J];山东农业科学;1994年04期
2 张磊;;安徽省大豆孢囊线虫病的发生情况与防治措施研究[J];安徽农业科学;1986年02期
3 戴瓯和,张磊;夏大豆优质高产高效栽培技术研究[J];安徽农业科学;1993年02期
4 张磊;安徽省大豆品种资源抗大豆孢囊线虫5号小种鉴定研究[J];安徽农业科学;1995年02期
5 杨文杰,苗以农;大豆光合生理生态的研究——第2报 野生大豆和栽培大豆光合作用特性的比较研究[J];大豆科学;1983年02期
6 吴和礼,姚振纯,李秀兰,林红,刘汉起,商绍刚,霍虹;大豆孢囊线虫病抗病性鉴定技术的研究[J];大豆科学;1984年01期
7 王金陵,张仁双;巴西的大豆生产与科学研究[J];大豆科学;1984年01期
8 张仁双,牛颖英,包力光,高连军;大豆孢囊线虫病抗源品种鉴定筛选研究[J];大豆科学;1985年02期
9 刘维志;关于加速抗孢囊线虫病大豆品种选育问题的商榷[J];大豆科学;1986年01期
10 刘汉起,商绍刚,霍虹,吴和礼,姚振纯,李秀兰;黑龙江省大豆孢囊线虫发生危害及研究现状[J];大豆科学;1987年02期
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 郑延海,闫世纯;大豆胞囊线虫生理小种的鉴定及大豆种质资源对其抗性的评价[J];植物保护;1997年04期
2 陈理来;;ARF:一种防治线虫的潜在生物药剂[J];世界农药;2005年02期
3 李进荣,段玉玺,陈立杰,薛春生;大豆根瘤内生细菌对大豆胞囊线虫影响研究[J];大豆科学;2005年02期
4 孙漫红,刘杏忠,缪作清;大豆胞囊线虫病生物防治研究进展[J];中国生物防治;2000年03期
5 梁定东,武扬,郑经武;大豆胞囊线虫种内群体rDNA-ITS区的比较研究[J];莱阳农学院学报;2004年02期
6 王惠,邱丽娟,陈立杰,关荣霞,段玉玺;SSR标记技术及其在大豆抗胞囊线虫研究中的应用[J];杂粮作物;2004年04期
7 王志,李原萍,穆志新,田齐建,师颖;大豆种质资源抗SCN4号生理小种的鉴定研究[J];大豆通报;2005年01期
8 郑延海,阎世纯,贾爱君;盆栽大豆胞囊线虫接种及大豆抗性资源的再评价[J];中国种业;1999年02期
9 梁晨,赵洪海,吕国忠;施用农用化学品及生防制剂的大豆胞囊线虫田根际真菌区系动态[J];沈阳农业大学学报;2001年03期
10 吴海燕,段玉玺,陈立杰,刘维志;不同抗性的大豆品种对田间大豆胞囊线虫群体动态的影响[J];大豆科学;2002年02期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 杜春梅;葛菁萍;平文祥;刘惕若;;侧孢芽孢杆菌生物种衣剂防治大豆胞囊线虫[A];2008年中国微生物学会学术年会论文摘要集[C];2008年
2 刘大伟;段玉玺;陈立杰;朱晓峰;;灰皮支黑豆抗大豆胞囊线虫3号生理小种的蛋白质组学研究[A];中国植物病理学会2010年学术年会论文集[C];2010年
3 孙漫红;刘杏忠;;淡紫拟青霉发酵滤液对大豆胞囊线虫趋化性的影响[A];全国生物防治暨第八届杀虫微生物学术研讨会论文摘要集[C];2000年
4 郑雅楠;段玉玺;陈立杰;孙晶双;;大豆胞囊线虫二龄幼虫对含氮离子及化合物适应性的初步研究[A];中国植物病理学会2007年学术年会论文集[C];2007年
5 孙晶双;郑雅楠;段玉玺;陈立杰;王媛媛;;玉米根系分泌物对大豆胞囊线虫休眠卵孵化的影响[A];中国植物病理学会2009年学术年会论文集[C];2009年
6 罗璇;段玉玺;陈立杰;黄少北;朱晓峰;陈井生;;胞囊线虫不同生理小种对大豆生理及根内酶活力的影响[A];中国植物病理学会2010年学术年会论文集[C];2010年
7 刘大伟;段玉玺;陈立杰;;灰皮支黑豆(ZDD2315)抗大豆胞囊线虫病的研究进展[A];中国植物病理学会2009年学术年会论文集[C];2009年
8 陈立杰;段玉玺;范圣长;秦博;刘霆;王媛媛;;大豆胞囊线虫病的生防因子研究进展[A];中国植物病理学第七届青年学术讨论会论文集[C];2005年
9 李俊华;董志新;刘建国;肖华;危常州;孟宝民;;新疆春大豆叶片荧光动力学参数的变化[A];第八届全国青年土壤暨第三届全国青年植物营养与肥料科学工作者学术讨论会论文集[C];2002年
10 孙晶双;段玉玺;郑雅楠;陈立杰;;不同酸性条件对大豆胞囊线虫孵化的影响[A];植物保护科技创新与发展——中国植物保护学会2008年学术年会论文集[C];2008年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 湖南省农科院作物所研究员 李小红;春大豆可秋播[N];湖南科技报;2009年
2 越农;庆元鲜食春大豆效益明显[N];粮油市场报;2006年
3 中国科学院生态环境研究中心教授 侯彦林;春大豆:有机磷钾喜钙钼 少氮高产促根瘤[N];中华合作时报;2003年
4 中国科学院生态环境研究中心教授 侯彦林;春大豆:有机磷钾喜钙钼 少氮高产促根瘤[N];中华合作时报;2004年
5 孙鲁威;东北春大豆播种要落实良种良法[N];农民日报;2007年
6 胡兴 彭兴富;春大豆——优质稻轮作技术[N];云南日报;2007年
7 ;中豆32[N];农民日报;2004年
8 中国农业大学教授 曹一平;春大豆的施肥[N];人民日报;2008年
9 武深秋;大豆,荚不饱满啥缘由?[N];瓜果蔬菜报.农业信息周刊;2006年
10 洞口县高沙镇农技站 彭启礼;春玉米间作春大豆[N];湖南科技报;2006年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 刘大伟;灰皮支黑豆对大豆胞囊线虫3号生理小种抗性机制研究[D];沈阳农业大学;2011年
2 吴海燕;大豆与大豆胞囊线虫相互关系研究[D];沈阳农业大学;2003年
3 刘丹丹;酸类化合物杀线虫活性及作用机理研究[D];沈阳农业大学;2011年
4 罗璇;大豆胞囊线虫不同生理小种的致病性及其分子基础研究[D];沈阳农业大学;2011年
5 王雪;大豆抗胞囊线虫机制及与抗性相关的差异蛋白质组学研究[D];沈阳农业大学;2009年
6 汪自强;春大豆雄性不育系S903B的遗传特性研究[D];浙江大学;2001年
7 郑雅楠;大豆胞囊线虫环境适应性的研究[D];沈阳农业大学;2009年
8 向梅春;明尼苏达被毛孢(Hirsutella minnesotensis)相关种分类及其分子生态学研究[D];湖南农业大学;2006年
9 于佰双;黑龙江省主要大豆抗源对胞囊线虫的抗病特性及线虫防治体系研究[D];沈阳农业大学;2009年
10 王媛媛;多功能生防根瘤菌工程菌株的构建[D];沈阳农业大学;2007年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 南海洋;大豆胞囊线虫抗病候选基因rhg1多样性及分子标记开发与利用[D];中国农业科学院;2010年
2 赵晓晖;大豆胞囊线虫抑制性土壤中寄生真菌及其作用研究[D];东北林业大学;2011年
3 孙晶双;影响大豆胞囊线虫孵化及休眠相关因子研究[D];沈阳农业大学;2010年
4 贾洪琪;大豆胞囊线虫病生防菌株筛选与防效的初步研究[D];黑龙江大学;2010年
5 马锐;大豆胞囊线虫二龄幼虫寄生菌的研究[D];中国农业科学院;2000年
6 远方;大豆抗胞囊线虫3号生理小种的抗性机制研究[D];沈阳农业大学;2001年
7 吴早贵;菜用春大豆高产栽培及生态型研究[D];浙江大学;2004年
8 李秀侠;大豆胞囊线虫孵化特性与滞育机理研究[D];山东农业大学;2008年
9 钱洪利;明尼苏达被毛孢对大豆胞囊线虫作用的研究[D];东北林业大学;2009年
10 马丽丽;发光杆菌NJ菌株发酵条件及对大豆胞囊线虫的作用研究[D];黑龙江八一农垦大学;2008年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62791813
  • 010-62985026