收藏本站
《第三军医大学》 2010年
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

FOXP3基因内含子1区SNP与寻常型银屑病发病相关性的研究

宋秋荷  
【摘要】:随着人类基因组计划的完成,有关个体遗传变异与疾病的关系日益受到重视,单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNPs )是人类基因组中遗传学变异中最常见的一种类型,也是决定不同个体临床表型多样性的重要因素。因此对复杂性疾病进行SNPs研究对于临床上早期诊断、预防和治疗这类疾病有重要意义。 银屑病(俗称牛皮癣)是一种发病率高、易反复、治疗困难的常见皮肤病。尽管一般情况下银屑病不会威胁到患者的生命,却严重影响着患者的生活质量、工作效率和身心健康。 以往认为,银屑病的病因和发病机理与遗传、感染、代谢障碍、内分泌、神经精神和免疫等多种因素有关。后有研究发现,环境因素在银屑病的发生和发展过程中也起重要作用。现在一致公认,银屑病是一种由多基因遗传决定、多种环境因素刺激诱导的免疫异常性慢性炎症性增生性皮肤病。即遗传背景的多样性影响基因功能,在环境因素的作用下,激发机体的细胞免疫应答,产生以CD4+T细胞介导的自身免疫紊乱,从而导致患病。 目前,已有研究表明FOXP3基因及其所影响的CD4+CD25+FOXP3+调节性T细胞(CD4+CD25+FOXP3+ regulatory T cells, Tri-Treg)参与了许多自身免疫性疾病的发病机制。Tri-Treg数量降低,尤其是其与效应性T(effectiveness T Cell, Te)细胞之间免疫失衡,导致Te细胞过度活化,是重型及进展期寻常型银屑病(psoriasis vulgaris, PV)病程发展中的核心环节。 近期国内已报道,FOXP3基因中个别SNPs位点与银屑病发病有相关性。但是,对于受多基因影响的复杂性自身免疫性疾病,我们有必要进行大样本、多位点SNPs检测,并在此基础上对FOXP3转录调控进行研究,为机制研究提供更多更可靠的靶向分子。 为此,我们选择与免疫性疾病发病密切相关的FOXP3基因,拟在中国PV人群中筛查其SNPs中基因型频率分布,并对阳性关联位点的生物学意义进行初步实验研究。 本研究收集408例PV患者及363例正常对照,采用问卷调查,多因素logistic回归分析寻找出与PV发病相关的危险因素。 采用聚合酶链式反应-连接酶检测(polymerase chain reaction and ligase detection reaction, PCR-LDR)方法,在中国PV人群中,对FOXP3基因4个SNPs候选位点(rs2232365, rs3761547, rs3761548, rs3761549)进行病例-对照研究。 等位基因频率直接由基因型计算,Hardy-Weinberg平衡由χ~2检验检测,以P0.05为符合Hardy-Weinberg平衡,两组间差异由列联表χ~2检测,位点间交互作用使用χ~2检测,P0.05为有统计学意义。所有数据的计算使用统计分析系统(version 9.0, SAS Institute Inc, Cary NC) 对与PV相关的FOXP3基因阳性SNP位点(rs2232365, rs3761547A, rs3761549)进行初步的功能研究,即通过实时定量-PCR( realtime- PCR, RT-PCR)法,对比白介素2(Interleukin 2, IL-2)体外刺激前后不同基因型PV患者中FOXP3 mRNA的表达水平,分析不同基因型对FOXP3基因内含子1区中核酸转录的影响。 研究主要结果如下: 1.本次研究发现,有家族史(p0.001, OR=3.12, 95% CI= 2.40-4.07)和40岁以前发病(p0.001,OR= 1.12, 95% CI= 0.92-1.38)仍然是严重影响PV发病的因素;一些环境因素也是PV发病的危险因素:吸烟( p0.001, OR =3.91, 95% CI=2.68-5.71),饮酒(偶尔饮酒: p=0.037, OR=1.46, 95% CI=1.02-2.09;戒酒: p0.001, OR=5.37, 95% CI=3.21-8.98;继续饮酒: p0.001, OR=11.90, 95% CI=7.08-19.98);失业(p=0.0175, OR=3.72, 95% CI=1.26- 10.97)、未婚(p0.0001, OR=3.93, 95% CI= 2.80-5.52)、睡眠不足(time5h: p0.0001, OR=56.61, 95% CI= 13.56 -236.36; 8htime5h : p0.0001, OR= 10.30, 95% CI=7.16-14.82)以及在城市以外的居住地点(p0.001,郊区: OR=3.72, 95% CI= 2.06-6.72;县城: OR=40.56, 95% CI= 6.27-101.14;农村: OR=26.80, 95% CI= 10.65-67.47),月经紊乱(p=0, OR=3.88, 95% CI= 1.88-7.92)。 2.在408例PV患者及363例正常对照中,采用PCR-LDR对FOXP3基因4个SNP位点(rs2232365,rs3761547,rs3761548,rs3761549)进行分型,结果发现rs2232365,rs3761547和rs3761549等位基因和基因型频率在PV患者及正常对照组中的分布存在显著差异(p值均0.05)。 低频纯合子(低频等位纯合基因型)(rs2232365 GG, rs3761547 GG, rs3761549 TT)是PV发病的保护性基因型,对应高频纯合子是危险基因型。携带保护性基因型的个体患PV危险性将显著降低rs2232365 GG: p=0.0206, adjusted OR= 0.38, 95%CI=0.17-0.86; rs3761547 GG: p=0.0288, adjusted OR=0.30, 95% CI=0.10-0.88; rs3761549 TT: p=0.0399,adjusted OR = 0.33, 95% CI = 0.12- 0.95。 3.联合各样本基因型进行分层分析,研究基因多态性与PV临床表型的相关性,结果显示:分别以rs2232365 AA ,rs3761547 AA和rs3761549 CC基因型为参照,多因素Logistic回归分析发现,携带三个与疾病关联位点中rs2232365,rs3761547和rs3761549的G等位、G等位、T等位,可以降低发病年龄40岁患者的发病率,并可以明显缓解女性群体的发病;三个阳性位点中的低频等位纯合子对有家族史患者发病有降低作用;rs3761547 AG+GG和rs3761549 CT+TT基因型将显著降低不伴有代谢性疾病人群中PV发病风险性。 4.本实验发现FOXP3基因的功能性SNP位点rs3761548与PV的发病无相关性。 5.对rs2232365 (位点1),rs3761547 (位点2)和rs3761549 (位点4)进行连锁不平衡分析提示,三个位点存在连锁(分别为D’_(1,2)=0.8794, r~2= 0.3927; D’_(1,4)=0.9924, r~2= 0.4223; D’2,4=0.9306, r~2= 0.9455)。 6.对FOXP3基因的多态性位点之间的交互作用进行分析,统计结果显示三个阳性位点之间两两存在交互作用,rs2232365与rs3761547、rs2232365与rs3761549C/T、rs3761547与rs3761549之间的联合型在患者和健康对照之间的分布存在显著差异(p值分别为0.0356, 0.0004和0.0043)。其中FOXP3-rs2232365 AA -3761547 AG+GG联合基因型可增加PV发病危险性2.897倍(校正后p=0.0393, 95%CI =1.05–7.97),而rs2232365AG+GG-rs3761547AG+GG(p=0.0019, adjusted OR=0.59, 95% CI= 0.42-0.82)、rs2232365AG+GG-rs3761549CT+TT(p=0.0012, adjusted OR=0.57, 95% CI= 0.41-0.80)、rs3761547AG+GG- rs3761549CT+TT (p=0.0027, adjusted OR=0.62, 95% CI= 0.45-0.85)联合基因型显著降低PV发病率,分别提示各位点之间具有联合效应。 7.采用配对和非独立样本t检验,对IL-2刺激前后外周血白细胞中FOXP3基因mRNA表达量进行统计学比较,结果发现当等位基因改变时,携带保护型基因患者血中FOXP3 mRNA的表达量明显增高,与FOXP3基因三个阳性关联的SNP位点保护基因型可降低PV患病风险的研究结果一致。 综上所述:本研究通过在中国人群中进行病例-对照研究,发现FOXP3基因rs2232365,rs3761547,rs3761549位点多态性与中国人群PV发病相关;三个阳性位点中低频率等位是保护性等位,而高频等位是危险性等位。这三个位点存在连锁, rs2232365 AA - 3761547 AG+GG能显著增加PV患病的风险。FOXP3基因三个阳性位点中高频率等位基因可能是通过下调FOXP3基因的表达而增加了PV发病风险。同时,本实验还发现,伴有家族史和发病年龄在40岁以前是PV发病的危险因素;一些环境因素对PV的发病有密切关系,在城市以外的居住环境下、未婚状态、失业状况女性激素水平紊乱与PV的发病呈正向关,那些吸烟与饮酒者也更易患PV。 总之,本研究表明FOXP3基因的SNPs与PV发病相关,该基因的SNP可能通过影响转录水平而导致发病。一些环境因素与PV发病有密切的关联。支持遗传与环境共同作用学说是银屑病重要的发病机理之一。
【学位授予单位】:第三军医大学
【学位级别】:博士
【学位授予年份】:2010
【分类号】:R758.63

手机知网App
【参考文献】
中国期刊全文数据库 前2条
1 关宁;沈柱;刘玉峰;;寻常型银屑病患者治疗前后外周血中单个核细胞Foxp3 mRNA水平的检测分析[J];中国皮肤性病学杂志;2007年05期
2 江沁,冯信忠;银屑病患者血清中链球菌抗体的研究[J];中华皮肤科杂志;1997年02期
【共引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 薛磊;徐志飞;;转录因子FOXP3在肿瘤免疫中的作用[J];第二军医大学学报;2009年09期
2 王宏伟;陈福琴;;FOXP3与自身免疫性甲状腺疾病[J];国际内科学杂志;2009年10期
3 雷漾;郑和义;;T淋巴细胞及细胞因子与银屑病的发病关系[J];国际皮肤性病学杂志;2007年06期
4 奚敏;张瑞祺;;CD_4~+CD_(25)~+调节性T细胞在病毒性肝炎中的研究进展[J];临床肝胆病杂志;2008年06期
5 王礼文;CD4~+CD25~+调节性T淋巴细胞及相关标记物的研究进展[J];临床检验杂志;2005年02期
6 曹新国;王礼文;;人类免疫调控转录因子FOXP3研究进展[J];临床检验杂志;2006年01期
7 赵广,冯晓玲,那爱华,蔡瑞康,杜孝元,梅英杰;点滴状银屑病患者咽部菌群调查及链球菌抗体的研究[J];临床皮肤科杂志;1999年05期
8 杨森,魏生才,张学军,陈珊宇,王红艳;寻常型银屑病诱因流行病学研究[J];中国麻风皮肤病杂志;2000年03期
9 陈小红,吴勤学,刘训荃;银屑病患者血清中抗溶血性链球菌抗体的类别及其意义[J];中国麻风皮肤病杂志;2001年02期
10 席强;;364例银屑病诱发因素调查结果分析[J];中国麻风皮肤病杂志;2006年10期
中国重要会议论文全文数据库 前1条
1 邱晓燕;焦正;张明;陈建平;施孝金;钟明康;;FOXP3基因多态性对肾移植患者排斥发生率的影响[A];第十二次全国临床药理学学术会议会议论文集[C];2010年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 郭昊;白介素35基因治疗协同地西他滨抑制小鼠心脏移植排斥反应的研究[D];天津医科大学;2011年
2 黄青;复方黄连乳膏治疗银屑病血热证的临床和实验研究[D];北京中医药大学;2004年
3 孙丽光;诱导T细胞成熟及免疫抑制剂对调节性T细胞的影响[D];吉林大学;2006年
4 张建;原发性胆汁性肝硬化患者中CD4~+CD25~+免疫调节性T细胞的研究[D];第二军医大学;2006年
5 陈小红;β-溶血性链球菌、结核分支杆菌与银屑病相关性研究[D];中国协和医科大学;2002年
6 樊昕;白细胞介素18对银屑病T细胞趋化因子受体7表达调控的研究[D];第四军医大学;2006年
7 张爱军;靛玉红对CD4+CD25+调节性T细胞的影响及在特发性血小板减少性紫癜中的应用研究[D];山东大学;2007年
8 杨治芳;LADA患者罗格列酮的治疗及其免疫机制研究[D];中南大学;2007年
9 高琳;Foxp3,Fas,FasL,COMT基因多态性与汉族寻常型银屑病相关性分析[D];第四军医大学;2008年
10 马铮;重症肌无力胸腺Foxp3表达及临床意义的研究[D];第三军医大学;2007年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 张秀娟;FOXP3、T淋巴细胞亚群在鼻息肉中的表达及其临床意义[D];郑州大学;2010年
2 耿晔;类风湿关节炎患者CD4~+CD25~+T细胞FOXP3基因启动子区甲基化水平研究[D];山西医科大学;2011年
3 周秉侠;FOXP3在玫瑰糠疹、扁平苔藓、大斑块型副银屑病及蕈样肉芽肿中的表达及意义[D];山东大学;2011年
4 崔善;FOXJ1基因多态性与中国朝鲜族人群哮喘易感性的相关性研究[D];延边大学;2011年
5 赵艳霞;银屑病的发病与治疗的回顾性分析[D];成都中医药大学;2003年
6 徐元勇;安徽省部分地区四种常见皮肤病流行病学研究[D];安徽医科大学;2003年
7 屈双擎;银屑病证候分布、演变及证治研究[D];北京中医药大学;2006年
8 杨坤杰;肝阴虚所致寻常型银屑病与情志的关系[D];中国中医科学院;2006年
9 周丽娜;酵母双杂交系统筛选FOXP3相互作用蛋白[D];第三军医大学;2006年
10 贾维胜;Foxp3基因转染的CD4+CD25-T细胞对小鼠心脏移植物存活的影响[D];第三军医大学;2006年
【二级参考文献】
中国期刊全文数据库 前1条
1 王雷;王刚;高天文;刘玉峰;;以NB-UVB为主的联合疗法治疗寻常型银屑病疗效观察[J];中国麻风皮肤病杂志;2006年01期
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 范媛;詹瑧;刘杰;;口腔扁平苔藓基因表达谱中差异表达基因初步探讨[J];华西口腔医学杂志;2007年04期
2 刘红生;袁作彪;韩天权;蒋兆彦;张圣道;;肝脏基因表达谱在急慢性胆囊炎中的差异[J];中国医药;2007年09期
3 欧阳玉梅;;酵母蛋白质相互作用与基因表达谱和亚细胞定位的相关性[J];中国生物化学与分子生物学报;2008年10期
4 黄成玉;于臻;冉晓瑛;;一种有效的算法在胃癌特征基因选取中的应用研究[J];华北科技学院学报;2008年04期
5 宋洁;;肾阳虚证基因表达谱的研究进展[J];辽宁中医杂志;2010年01期
6 许亮国,谢鹭,王磊,何志巍,杨玉文,姚开泰;鼻咽癌组织基因表达谱的研究[J];中国病理生理杂志;2000年10期
7 姚连生;生物芯片在生命科学研究领域中的应用[J];第一军医大学学报;2001年07期
8 托娅,苏秀兰,路桂荣,辛学东,王文礼,柯杨,包文宇;基因芯片在抗肿瘤血管生成中草药相关基因筛选中的研究[J];第二军医大学学报;2002年03期
9 袁开宇,赵震宇,刘瑛,邹江,刘梅冬,陈广文,尢家騄,肖献忠;用cDNA微阵列研究内毒素休克小鼠肺组织基因表达谱的改变[J];生物化学与生物物理进展;2002年03期
10 李泽,包雷,黄英武,孙之荣;基于基因表达谱的肿瘤分型和特征基因选取[J];生物物理学报;2002年04期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 王琦;李雪;刘彦;朱志兵;薛英威;傅松滨;;应用基因表达谱芯片研究胃癌基因表达谱[A];中国的遗传学研究——中国遗传学会第七次代表大会暨学术讨论会论文摘要汇编[C];2003年
2 李冬果;华琳;刘红;郑卫英;张金旺;;人类淋巴母细胞基因表达的遗传分析[A];中国生物医学工程进展——2007中国生物医学工程联合学术年会论文集(下册)[C];2007年
3 蔡彦宁;温玫;张愚;陈彪;;帕金森患者尾状核中基因表达谱研究[A];中华医学会第七次全国神经病学学术会议论文汇编[C];2004年
4 石文静;陈超;胡宝洋;龚红华;周国民;;新生小鼠视网膜病变的基因表达谱变化[A];2006(第三届)江浙沪儿科学术会议暨浙江省儿科学术年会论文汇编[C];2006年
5 于英男;洪源;李烨;成军;李燕;;刀豆素蛋白引起免疫性肝损伤小鼠肝脏基因表达谱变化[A];第十届全国生化与分子药理学术会议论文摘要汇编[C];2007年
6 孙开来;郝冬梅;孙秀菊;郑志红;富伟能;;胃癌发生发展过程中基因表达谱检测[A];中国的遗传学研究——中国遗传学会第七次代表大会暨学术讨论会论文摘要汇编[C];2003年
7 刘培强;谢青松;朱大铭;;用于基因表达谱数据聚类分析的贪心图划分算法研究[A];2006年全国理论计算机科学学术年会论文集[C];2006年
8 高瑞兰;陈小红;林筱洁;钱煦岱;徐卫红;吴超群;;三七皂苷诱导造血细胞基因表达谱的研究[A];2005年华东六省一市血液病学学术会议暨浙江省血液病学学术年会论文汇编[C];2005年
9 张进;肖波;吴志国;李国良;杨晓苏;李静;;颞叶癫痫大鼠模型海马基因表达谱和蛋白表达谱的研究[A];中华医学会第七次全国神经病学学术会议论文汇编[C];2004年
10 高瑞兰;陈小红;林筱洁;钱煦岱;徐卫红;吴超群;;三七皂苷诱导造血细胞基因表达谱的研究[A];第三届海峡两岸中西医结合学术研讨会论文集[C];2005年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 记者 衣晓峰 通讯员 李小莲;探寻“证”的基因表达谱[N];中国中医药报;2009年
2 ;聚类分析在自身免疫病基因表达谱研究中的初步应用[N];中国医药报;2003年
3 记者 张学全 张建松;我人类功能基因研究获重要进展[N];新华每日电讯;2000年
4 胡永忠;专家热论生物医药[N];医药经济报;2002年
5 通讯员吴志军 刘征云;咬定青山不放松[N];科技日报;2002年
6 Marvin;测基因而知天命?[N];经济观察报;2009年
7 记者 胡德荣 通讯员 汪敏;我国两项基因研究达国际先进[N];健康报;2000年
8 秦红 冷明祥 王兴东;南医大汇集 群雄“抢”基因[N];新华日报;2001年
9 陈瑜;沈自尹;陈伟平;淫羊藿总黄酮重建衰老免疫稳态的分子机制[N];中国医药报;2005年
10 薛开先;基因组学研究对中医现代化的启示[N];中国中医药报;2001年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 宋秋荷;FOXP3基因内含子1区SNP与寻常型银屑病发病相关性的研究[D];第三军医大学;2010年
2 田素礼;应用基因表达谱芯片探讨Oxaliplatin诱导人结肠癌细胞凋亡分子机制的实验研究[D];吉林大学;2005年
3 胡吉;垂体瘤组织基因表达谱及发病机制研究[D];复旦大学;2005年
4 黄志刚;应用肿瘤基因解剖工程数据库及RNA干扰技术检测大肠癌基因表达谱[D];复旦大学;2005年
5 黄静;扶正增效方对非小细胞肺癌放射增敏的临床及基因表达谱研究[D];北京中医药大学;2006年
6 姚实林;阳虚质理论及其外周血基因表达谱研究[D];北京中医药大学;2007年
7 马丽娟;利用激光捕获显微切割及基因芯片技术构建喉鳞状细胞癌基因组差异表达谱[D];中南大学;2008年
8 周美启;针刺心经与小肠经干预急性心肌缺血大鼠心脏和下丘脑基因表达谱比较研究[D];广州中医药大学;2005年
9 祝骥;人红白血病K562细胞基因表达谱芯片制作及应用研究[D];华南理工大学;2002年
10 张骞;红色毛癣菌孢子EST构建及基因表达谱分析[D];吉林大学;2007年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 魏悦爽;从肌钙蛋白相关基因筛选举重运动员选材用分子标记[D];北京体育大学;2010年
2 毕煜;初探应用关联规则筛选与癌症有关联性的SNP[D];复旦大学;2010年
3 田小春;Klotho三个位点SNP及组合在重庆汉族老年人群分布及其与原发性骨质疏松症的关系[D];重庆医科大学;2011年
4 王爽;鼻咽低分化鳞状细胞癌分子分类的初步研究[D];第一军医大学;2004年
5 申晓敏;人胃癌耐药细胞系的建立及相关基因研究[D];天津医科大学;2005年
6 高泓;一个糖尿病家系肾阴阳两虚证基因表达谱研究[D];成都中医药大学;2005年
7 黄丽俊;应用基因芯片筛选植物激活蛋白处理水稻相关差异基因及其验证[D];重庆大学;2005年
8 杨庆平;基于贝叶斯网络的基因调控网络构建算法的研究[D];哈尔滨工业大学;2006年
9 张秋水;支持向量机在基因表达数据中的研究[D];厦门大学;2007年
10 段艳华;基于基因表达谱的肿瘤分类特征基因选择研究[D];北京工业大学;2008年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62791813
  • 010-62985026