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《中国人民解放军军事医学科学院》 2004年
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碱基切除修复基因SNP的鉴定及其与食管癌的关联研究

郝冰涛  
【摘要】:细胞的基因组要经常面对来自环境和自身的多种因素的损伤乃至破坏,这些因素包括辐射,各种致癌剂和细胞自身的代谢物。为了保持基因组的完整性和遗传的稳定性,细胞发展了一套DNA损伤修复系统来对抗各种DNA损伤带来的不良影响。已有研究表明DNA损伤修复的缺陷可以导致各种与癌症相关的疾病。流行病学的研究表明在个体中存在DNA损伤修复能力的差异,修复能力的低下与多种肿瘤的遗传易感性关联。 食管癌是我国北方地区一种常见的恶性肿瘤,其流行病学和病因学的研究表明,遗传因素和能导致DNA损伤的环境因素同食管癌的患病风险相关。根据常见疾病常见多态理论,我们推测DNA损伤修复基因的遗传多态可能与食管癌的患病风险相关。本项研究旨在寻找影响食管癌的易感性基因。首先采用PCR-测序技术路线对8个碱基切除修复基因(MBD4,MUTYH,OGG1,ADPRT,APEX,LIG3,POLB和XRCC1)的单核苷酸多态进行了筛查,寻找合适的遗传标记和潜在的功能多态;然后在419个组织学确定的原发性食管鳞癌病例和480个在年龄和性别上匹配的正常对照中进行基因分型。基因型和食管癌患病风险之间的关联采用非条件的多变量logistic回归和逐步回归进行分析,得到最后的回归模型。在8个基因的编码区,调控区和外显子内含子交界区57kb的基因组区域内鉴定出129个SNP,其中18个影响到蛋白质的编码序列。关联的结果显示有4个SNP进入了最后回归模型,包括2个改变氨基酸序列的SNP(ADPRT Val762Ala和MBD4 Glu3d6Lys)和2个处于非编码区的SNP(LIG3 A3704G和XRCC1 T-77C)。对风险等位基因(ADPRT 762Ala,MBD4 346Lys,LIG3 3704A和XRCC1 -77C)的联合分析发现约50%的个体携带2个或2个以上的风险等位,这些个体与不携带和携带1个风险等位基因的个体比较食管癌的风险显著增加,而携带3个和4个风险等位的个体(大约占正常群体的10%)患食管癌风险是不携带风险等位个体的2倍以上。根据吸烟状况分层分析表明,3个参与核心反应的风险等位基因(ADPRT 762Ala,LIG3 3704A和XRCC1 -77C)对吸烟者患食管癌的风险影响更大,但是1个糖苷酶的风险等位基因(MBDd 346Lys)在吸烟者和非吸烟者中表现一致。对基因之间的交互作用分析发现两个在物理和功能上相互作用的蛋白XRCC1和ADPRT上2个变异有显著的相互作用,双风险等位纯合携带者ESCC的风险增加了8倍作用。我们的研究表明碱基切除修复基因的遗传变异在很大程度上影响到食管癌的易感性。
【学位授予单位】:中国人民解放军军事医学科学院
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2004
【分类号】:R735.1

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