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多重耐药铜绿假单胞菌的对比基因组学研究

王玉明  
【摘要】: 目的:对比分析多重耐药铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa, P. aeruginosa)的基因组差异,并探索其与临床多重耐药性演变的关系。 方法:1.收集P. aeruginosa临床分离株连续性抗生素敏感性监测结果,分析其演变规律; 2.琼脂稀释法测定49株P. aeruginosa临床分离株抗生素药物敏感性;3.应用脉冲场凝胶电泳(PFGE)对49株P. aeruginosa临床分离株进行基因组分型;4.对8株代表性P. aeruginosa临床分离株的16S rDNA和mutL进行测序做进化关系分析。 结果:1.参与连续性药敏监测的所有P. aeruginosa临床菌株始终对氨苄西林、氨苄西林/舒巴坦及头孢替坦耐药,大部分P. aeruginosa临床菌株始终对亚胺培南、环丙沙星、左旋氧氟沙星、头孢他啶、哌拉西林/他唑巴坦和头孢噻肟耐药。2.大部分P. aeruginosa临床菌株对抗生素的敏感性在住院和抗生素治疗期间发生了演变,不同抗生素在不同菌株有不同的演变模式。3. 49株S-ICU收集的P. aeruginosa临床菌株以多重耐药株为主,占85.7%。从2001年到2004年,多重耐药菌株所占的比例呈逐年下降趋势;在此期间,P. aeruginosa对所监测的9种抗生素的耐药率总体上也有所下降。4. PFGE所揭示的基因组型A型为P. aeruginosa临床分离株中的主要类型,占61.2% (30/49),均对阿米卡星和头孢吡肟敏感,对左旋氧氟沙星和美洛培南耐药;大多数A型P. aeruginosa临床分离株对庆大霉素、氨曲南和头孢他啶敏感,而对环丙沙星和头孢噻肟耐药;基因组型H、P以及极少数A对6种以上抗生素耐药。5. PFGE基因组型是随着时间发展演变的。6. 16S rDNA序列分析表明,不同基因组型的菌株至少在亚种(subspecies)的水平上属于相同种系群。7. mutL进化关系相近的P. aeruginosa临床分离株PFGE基因组型及多重耐药性也相同或相近。 结论:1.多重耐药P. aeruginosa是导致临床抗生素治疗失败的主要原因,在经验性不合理应用抗生素的情况下,对抗生素敏感的P. aeruginosa极易迅速演变为耐药;2. PFGE基因组型与P. aeruginosa临床分离株的多重耐药特性密切相关,PFGE是一种理想的对多重耐药P. aeruginosa临床分离株进行基因组分型研究的方法; 3. PFGE基因组型A是临床最常见的P. aeruginosa流行基因组型,通常对多数抗生素敏感,但是容易向多重耐药基因组型演变,偶尔可以演变为对抗生素全敏感的基因组型,仍然保持基因组型A的P. aeruginosa的多重耐药性多发生减退;4.其它基因组型在数量上较少,表明这些基因组型很可能不稳定;H和P基因组型的P. aeruginosa临床分离株大多表现出显著的多重耐药特性,I和J基因组型的P. aeruginosa临床分离株对大多数抗生素敏感;5. PFGE基因分型与mutL进化分析相结合可以作为临床多重耐药性监控和严重多重耐药菌株鉴定的有效手段。


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