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牡丹SSR分子标记的开发及其在亲缘关系分析中的应用

于海萍  
【摘要】:牡丹(Paeonia Sect. Moutan)隶属于芍药属牡丹组,是我国特产传统名花,被誉为“花王”,具有重要的观赏、药用和油用价值。随着牡丹育种事业的发展及全球化的广泛栽培,许多关于牡丹种问亲缘关系、栽培种起源及分子标记辅助育种等问题迫切需要可靠的分子标记。本研究以凤丹(P. ostii T. HongJ. X. Zhang)为材料,采用“磁珠富集法”开发SSR分子标记,探讨其在芍药组植物中的通用性,并利用所开发标记研究牡丹种与品种及品种之间的亲缘关系,主要结果如下: 1、利用“磁珠富集法”构建牡丹微卫星富集文库,从中挑取237个阳性克隆并测序,得到91条含115个SSR序列,设计出79对引物,经筛选共有36对扩增出单一清晰条带,其中12对为多态性引物,24对为单态型引物。检测上述多态性引物在近缘物种芍药中的通用性,结果表明多数引物在近缘物种中具有较高的通用性。 2、利用所开发的12对多态性引物分析48个牡丹种及品种的亲缘关系。12对引物在48个牡丹样本中共扩增得到42个等位位点,多态信息含量为0.257~0.794,平均0.468;Shannon多样性指数为0.594~1.771,平均0.906,说明所得SSR位点遗传多样性较丰富。聚类分析结果显示紫斑牡丹是西北牡丹品种群的主要原种之一,且二者与四川牡丹有较近的亲缘关系;凤丹参与了中原牡丹品种群的起源;Lemoinei系个体与中原牡丹品种群个体也有一定的亲缘关系。主成分分析所得结果与聚类分析基本一致。


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