收藏本站
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

九莲城淖尔药用放线菌资源勘探及特境放线菌新资源的多相分类

李小俊  
【摘要】:抗生素的有效性伴随着抗生素的使用正在减弱,要保证抗生素能被人类持续利用,一方面采取有效措施减少抗生素的使用,以达到最合理地使用抗生素;另一方面,对抗生素的有效性进行改进更新,包括提高现有抗生素的效力和开发新的抗生素。与全球细菌耐药泛滥形成鲜明对比的是,新抗生素研发相对迟缓。以放线菌为主的微生物是抗生素的重要来源,对于新抗生素的发现,除了创新现有筛选策略外,药用微生物资源问题也是导致新抗生素研发迟缓的瓶颈问题之一。特境药用放线菌资源的开发成为当前的一个研究热点。基于以上研究背景,本论文选择盐湖这一特境,开展了九莲城淖尔药用放线菌资源勘探及3株特境放线菌新资源的多相分类研究,主要开展了以下研究工作:一、对九莲城淖尔来源的土壤样品进行放线菌的分离;从中选取代表菌株进行摇瓶发酵、提取代谢产物并对其进行抗菌活性筛选;同时对代表菌株进行Ⅰ型聚酮合酶(PKSⅠ)KS域、Ⅱ型聚酮合酶(PKSⅡ)KS域和非核糖体多肽合成酶(NRPS)A结构域抗生素生物合成基因的检测。从11份土壤样品中分离纯化到251株放线菌,归属于10个目15个科31个属,优势菌属为链霉菌属和拟诺卡氏菌属;其中37株可能为放线菌新物种。96株放线菌活性筛选结果显示,56株至少对一种检定菌具有抗菌活性,阳性率较高,并且筛选到了多株对耐药革兰阴性菌有抗性的菌株;96株放线菌中84株至少携带3种生物合成基因中的1种,阳性率高。二、九莲城淖尔来源嗜盐菌株J11Y309的多相分类菌株J11Y309T与糖霉菌科Salininema proteolyticum Miq-4T、Paraglycomyces exinjiangensis TRM 49201T和Haloglycomyces albus YIM 92370T的同源性最高,16SrRNA基因序列相似度分别为95.80%、95.77%和94.84%,P. xinjiangensis TRM 49201T和S. proteolyticum Miq-4T的同源性为99.5%。系统发育树显示菌株J11Y309T和S. proteolyticum Miq-4T、P. xinjiangensis TRM 49201T、H. albus YIM 92370T在糖霉菌科内聚成一簇,并且它在该进化枝内形成了独立的分枝。综合多相分类学的研究结果,提出菌株J11Y309T代表糖霉菌科新属新种,命名为白色盐湖杆菌,同时,将Paraglycomyces xinjiangensis Luo et al.2015重新分类为Salininema proteolyticum Nikou ef al.2015的一株异名同种菌株,并对Salininema属和Salininema proteolyticum的描述进行了补充修订。三、九莲城淖尔来源耐盐菌株J12GA03的多相分类菌株J12GA03T与棒杆菌目 Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1T和Hoyosella altamirensis OFN S31T同源性最高,16S rRNA基因序列相似度分别为98.18%和97.75%;序列比对还发现,A. subflavus DQS3-9A1T和H. altamirensis OFN S31T同源性为99.77%。系统发育树显示菌株J12GA03T、A. subflavus DQS3-9A1T和H. altamirensis OFN S31T在进化树内聚成一小簇,并且菌株J12GA03T形成独立的分枝;三菌株形成的进化枝邻近分枝杆菌科分枝杆菌属的进化枝。综合多相分类学的研究结果,提出菌株J12GA03T为Hoyosella属新种,命名为Hoyosella rhizosphera;同时,将Amycolicicoccus subflavus Wang et al2010重新分类为Hoyosella altamirensis Jurado et al.2009的一株异名同种菌株,并对Hoyosella属的描述进行了补充修订。根据系统发育分析结果,提出Hoyosella属为棒杆菌目分枝杆菌科的一员。四、神仙洞来源菌株S6R2A4-9的多相分类系统发育树显示菌株S6R2A4-9T位于类诺卡氏菌科腾格里菌属的进化枝内,并且该菌株与腾格里菌属Tenggerimyces mesophilus I12A-02601T最为相似,相似度为98.98%。菌株S6R2A4-9T与T. mesophilus I12A-02601T之间的DNA-DNA杂交值为27.6±3.0%。综合多相分类学的研究结果,提出S6R2A4-9T为腾格里属新种,命名为黄色腾格里菌。


知网文化
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62982499
  • 010-62783978