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氨基酸相关复合物的分子模拟与质谱分析

刘华鼐  
【摘要】:氨基酸作为生命体系主要成分—蛋白质的基本组成单元是生命起源中的几种基本物质之一,对氨基酸、小肽与有机小分子、生物大分子DNA通过氢键得到的超分子体系结构的研究对生物高新材料的开发和应用以及生命科学的进展有着重要作用。而分子模拟这种“在计算机上的实验”已经成为分子设计的重要手段,它可以用来揭示化学反应机理、预测具有指定性质或性能的分子的可能结构,并用相应的计算程序或模型来预测有前途的化合物,这样可以指导合成实验。本论文就是利用分子模拟并结合质谱技术,对氨基酸相关复合物的分子间相互作用方式进行了探讨。主要研究工作如下: 1.综述了含氨基酸的分子聚合体的几何特征、分子间相互作用并对它们组成的超分子体系中的氢键类型进行了归纳;简要介绍质谱分析法在分子聚合体结构研究中的应用以及分子模拟理论方法的发展和应用。 2.合成了L-精氨酸和樟脑酸、L-赖氨酸和樟脑酸、L-谷氨酸和异烟碱形成的复合物;应用电喷雾质谱法对其结构进行表征,并结合谱图对分子间相互作用进行了结构分析,同时应用分子模拟的方法对可能的结合方式进行了模拟。 3.运用分子动力学和量子化学的方法对非肽类酰胺L/D丝氨酸组酰胺与5’-TpTpdC-3’的相互作用进行了模拟及计算,从理论上验证了我们假设的五配位磷中间体发生水解反应的切割机理。 4.运用分子模拟的方法对肌巨蛋白多肽片段片段进行了构象分析,探讨了蛋白质磷酸化后对其结构和功能的影响。


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