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基因进化保守性和变异性比较分析

彭公信  
【摘要】:目前,随着生命科学的发展,基因组学和生物信息学已经成为其领域中发展迅猛的学科。生物信息学,它是对生物分子信息的获取、储存、分析和利用,以数学为工具,利用计算机技术,研究生物信息的一门科学。近几年,又随着计算机技术水平的提高,在基因水平上的研究逐渐成为二者中所关注的热点,尤其是研究基因是如何进化的,基因又是如何变异的并如何行使功能的等问题。本文针对Takeout基因家族进化以及和JHBP基因家族对比变异分析展开研究的。通过对黑腹果蝇中发现的第一条Takeout基因序列,基于数据BLAST搜索技术,在整个生物序列数据库中进行搜寻,找出其它物种的同源Takeout基因序列,并最终确定整个Takeout基因家族目前的物种和序列信息。同时,我们还从其家族基因序列一级结构Motif,二级结构分析以及三级结构预测上确定出Takeout基因家族特征。并在此基础上,对整个Takeout基因家族做系统进化分析和分子进化分析,同时也在在目前已测的12中果蝇基因组中做进一步系统发育分析。同时,结合其相近的JHBP基因家族,做二者基因间的保守性和变异性对比分析。最终得出Takeout基因家族是目前跟昆虫作息、取食、发育过程等息息相关一类重要的新家族,它在长期进化的过程中,分成两个重要的亚家族,其中在家蚕和人体虱中发现仅有一个亚家族。


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