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猪H-FABP基因分子遗传多态性及其与肌内脂肪含量的关联分析

杨文平  
【摘要】:猪的肌内脂肪含量是重要的肉质性状。研究表明,心脏脂肪酸结合蛋白(Heart fatty acid-binding protein,H-FABP)基因是影响肌内脂肪含量的侯选基因。本研究选用马身猪、山西白猪、大白猪、长白猪、杜洛克猪五个猪种以及大白猪×山西白猪(简称大山猪)、杜洛克猪×山西白猪(杜山猪)、大白猪×马身猪(大本猪)、杜洛克猪×马身猪(杜本猪)四个杂种猪群为实验动物群体,采用PCR-RFLP及PCR-SSCP分析方法研究H-FABP基因的遗传变异,并运用最小二乘法拟合线性模型,对所发现的多态位点与猪肌内脂肪含量的关系进行了分析。 1.应用PCR-RFLP方法对上述猪群H-FABP基因5′-上游区和第二内含子的遗传变异进行了研究。结果表明:(1) 在5′-上游区的Hinf Ⅰ-RFLP位点上,五个品种都有变异,马身猪表现出Hh、hh两种基因型;对于杂种猪群,杜山猪均表现为HH型,大本猪表现为HH、Hh两种基因型。(2) 在第二内含子区域的Hinf Ⅰ-RFLP位点上,所有猪群都表现出多态性,马身猪只有BB、Bb两种基因型。(3) 在第二内含子内的Hae Ⅲ-RFLP位点上,马身猪均表现为DD型,其余猪群都表现出多态性,大本猪和杜本猪检测到DD、Dd两种基因型。(4) 马身猪在三个位点的基因频率明显以D、h、B占有优势,其频率分别为1.0000、0.9727和0.9667。(5) 培育中的品系山西白猪在三个位点均表现出多态性。等位基因H的频率较高,达0.7595,等位基因D、B的频率较低,分别为0.2476和0.2423。 2.根据GenBank上公开发表的相关的猪H-FABP基因序列设计特异性扩增引物P_3-P_8,应用PCR-SSCP分析方法在H-FABP基因上发现P_4-SSCP多态位点,该位点上具有两个等位基因A和B。序列测定的结果表明,P_4-SSCP的变异是由碱基C→T的替换造成的。 3.成功扩增出猪H-FABP基因intron 3的全序列,全长1350 bp,已向GenBank提交,检索号为DQ 002993。根据序列测定结果设计引物P_(10),扩增其中255 bp的片段,应用PCR-SSCP分析发现P_(10)-SSCP多态位点,该位点上具有两个等位基因A和B。序列


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