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Y-STR基因座多态性分析及在法医学上的应用研究

杨思仪  
【摘要】: 目的Y染色体遗传标记多态性较低,需要寻找更多的基因座用于遗传学分析。本实验从染色体基因座中筛选出3个新Y-STR基因座,调查这3个Y-STR基因座在山西汉族人群中的等位基因频率及单倍型分布,并对这3个Y-STR新基因座在法医学上的应用进行可行性探讨。 方法(1)样本采集:随机抽取120例山西汉族健康男性无关个体静脉血进行等位基因频率及单倍型调查;随机抽取20例山西健康女性血样进行阴性对照;采集20例两代家系血样进行突变观察;采集同一例健康男性尸体的血液和组织器官进行同一性观察;采集3例常见雄性动物血液进行种属特异性观察。(2)用有机溶剂提取法提取基因组DNA;根据GDB基因库提供的引物序列和自行设计的引物序列合成引物。(3) PCR扩增后,进行扩增产物的非变性聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)电泳分离和硝酸银染色分型,测序。(4)计算其法医学参数。 结果研究发现DYS708基因座在120例山西汉族男性群体中分别检测出6个等位基因, DYS708*24、DYS708*25、DYS708*26、DYS708*27、DYS708*28、DYS708*29,其等位基因频率见表1。在山西汉族群体中,DYS708基因座的基因多样性(GD)为0.823,其个人识别能力(DP)和非父排除率(PE)为0.823; 20例女性对照无特异性扩增产物且20例两代家系调查无突变。同一男性个体血液、组织器官检测结果分型一致。3例动物血样中均未观察到特异性扩增。DYS724,32例样本观察到1个等位基因,68例样本观察到2个等位基因, 20例样本观察到3个等位基因,测序无结果。DYS725扩增目的DNA在聚丙烯凝胶上出现两条带,且所有样本无基因多态性。 结论基因座DYS708具有较高的个人识别能力,所得到的数据可为山西汉族人群法医学个人识别、亲子鉴定及遗传学研究提供依据。DYS724,DYS725基因多态性低,不宜作为法医学个人识别、亲子鉴定及遗传学研究的依据。 目的在前期研究的基础上筛选出12个遗传多态性较高的Y-STR基因座,调查这12个Y-STR基因座在山西汉族人群中的等位基因频率及单倍型分布,并对这12个基因座单倍型在法医学上的应用进行可行性探讨。 方法(1)样本采集:随机抽取120例山西汉族健康男性无关个体静脉血进行等位基因频率及单倍型调查;随机抽取20例山西健康女性血样进行阴性对照;采集20例两代家系血样进行突变观察;采集同一例健康男性尸体的血液和组织器官进行同一性观察;采集3例常见雄性动物血液进行种属特异性观察。(2)用有机溶剂提取法提取基因组DNA;根据GDB基因库提供的引物序列和自行设计的引物序列合成引物。(3) PCR扩增后,进行扩增产物的非变性聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)电泳分离和硝酸银染色分型,测序。(4)计算其法医学参数。 结果研究发现这12个基因座(DYS650, DYS651,DYS708,DYS711,DYS713, DYS714,DYS715,DYS716,DYS717,DYS718,DYS721,DYS726)在120例山西汉族男性群体中分别检测出4、5、6、6、8、6、6、5、5、5、4、5、5、4个等位基因,它们分别是DYS650*14、DYS650*15、DYS650*16、DYS650*17;DYS651*7、DYS651*8、DYS651*9、和DYS651*10、DYS651*11; DYS708*24、DYS708*25、DYS708*26、DYS708*27、DYS708*28、DYS708*29;DYS711*60、DYS711*63、DYS711*65、DYS711*68、DYS711*70、DYS711*74;DYS713*36、DYS713*38、DYS713*40、DYS713*42、DYS713*44、DYS713*46;DYS714*10、DYS714*11、DYS714*12、DYS714*13、DYS714*14、DYS714*15;DYS715*12、DYS715*13、DYS715*14、DYS715*15、DYS715*16;DYS716*15、DYS716*16、DYS716*17、DYS716*18、DYS716*19;DYS717*18、DYS717*19、DYS717*20、DYS717*21、DYS717*22;DYS718*14、DYS718*15、DYS718*16、DYS718*17; DYS721*9、DYS721*10、DYS721*11、DYS721*12和DYS721*13;DYS723*10、DYS723*11、DYS723*11、和DYS723*13、DYS723*14; DYS726*11、DYS726*12、DYS726*13、DYS726*14;其等位基因频率见表14。在山西汉族群体中,Y-STR基因座的基因多样性(GD)最低为0.730(DYS650) ,最高为0.831 (DYS711),其个人识别能力(DP)和非父排除率(PE)最低为0.730(DYS650) ,最高为0.831 (DYS711);12个Y-STR基因座共同构成的单倍型为120种,其多样性(HD)为0.99。20例女性对照无特异性扩增产物且20组两代家系调查无突变。同一男性个体血液、组织器官检测结果分型一致。3例动物血样中均未观察到特异性扩增。 结论这12个Y-STR基因座单倍型具有较高的个人识别能力,所得到的数据可为山西汉族人群法医学个人识别、亲子鉴定及遗传学研究提供依据。


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