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中国狂犬病毒P和M基因分子生物学特征研究

王晓光  
【摘要】: 本研究从国内外研究较少的狂犬病毒P、M基因出发,针对中国广西、贵州、湖南、江苏、安徽和云南六省区狂犬病人、犬阳性脑组织标本通过RT-PCR方法扩增目的基因来测定P、M基因编码区全序,利用来源于GenBank中不同国家地区代表不同基因型的狂犬病毒株P、M基因序列信息在分子水平进行P、M基因序列同源性分析、主要功能位点比较和种系发生分析,探讨中国狂犬病毒P、M基因分子生物学特征,为进一步研究狂犬病毒的分子结构提供基础数据。 中国狂犬病毒P基因核苷酸与氨基酸序列同源性分别为81.8~100%和82.9~99.7%;M基因核苷酸与氨基酸序列同源性分别为88.7~100%和95.0~100%。PP与胞浆动力蛋白轻链(LC8)作用位点、PP与LP主要作用区域前19位氨基酸都高度保守,特定的蛋白激酶磷酸化丝氨酸位点、PP与NP相互作用主要区域第209~216位氨基酸仅个别位点发生变化,中部高变区第50~75位氨基酸位于核酸外导信号结构域内;MP调节病毒RNA转录和复制功能的第58位氨基酸、在病毒晚期芽生过程中起调节作用的PPxY结构域均高度保守,高变区第17~22位氨基酸位于N末端潜在的抗原决定簇内。P、M基因核苷酸水平的变异区存在于氨基酸水平同样的位置,核苷酸序列的变异多为同义突变。P、M基因系统进化分析显示所有中国标本P、M基因序列与其它基因1型序列形成独立的进化分支,具有中国地域特点:来源于同一省区的标本构成同一亚分支,趋向于同一进化群。 对P、M基因的研究结果表明中国狂犬病毒均属于基因1型,序列同源性都比较高,具有共同的进化途径和基因结构特点,序列间差异规律明显,病毒分布具有独特的中国地域性特征,但序列的差异并不完全与病毒分离的行政地理区域相关,未严格按照行政地理分群。六省区狂犬病毒不但在同一省区内循环传播,而且在各个省区相邻地域之间相互传播,中国与东南亚国家的狂犬病毒株P、M基因具有较近的亲缘关系,中国云南省个别毒株可能和泰国毒株来源于共同的狂犬病毒。六省区所有狂犬病毒街毒株都来源于人和犬,人、犬分离株P、M基因全序列无明显差异,进化呈现由犬到人的方向,从病毒的来源角度证实了犬对人狂犬病的重要影响。


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