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霸王、沙冬青、小叶锦鸡儿CBF/DREB1转录因子cDNA全长的克隆及生物信息学分析

张飞  
【摘要】: 霸王(Zygophyllum xanthoxylon)、沙冬青(Ammopiptanthus mongolicus)、小叶锦鸡儿(Caragana microphylia Lam)是我国西北荒漠区典型的资源植物,不但具有重要的生态和经济价值,而且抗逆境能力强,是非常好的研究抗逆的实验材料。 CBF/DREB1(C-repeat binding factor/dehydration resistance element binding protein 1)基因是一类抗逆相关转录因子,它们的表达可以激活下游一系列逆境应答基因的表达,从整体水平提高植株的抗逆性。 本文利用RT-PCR和RACE技术首次克隆了霸王、沙冬青、小叶锦鸡儿CBF/DREB1基因cDNA全序列,并对其推导的氨基酸序列进行了相关生物信息学分析,确认其具有AP2结构域,且AP2域的两端拥有CBF家族特有的PKK/RPAGRxKFxETRHP和DSAWR短多肽序列,属于CBF家族。 通过对霸王、沙冬青、小叶锦鸡儿CBF/DREB1与其它植物来源的蛋白全序列比较发现,与霸王CBF/DREB1亲缘关系最近的是白桦(Betula platyphylla)的BpCBF,二者蛋白序列同源性为60.1%。沙冬青、小叶锦鸡儿因为都属于豆科,它们的CBF/DREB1与野生大豆(Glycine soja)CBF/DREB1的GsCBF1亲缘关系最近,蛋白序列同源性分别为49.6%和66.8%。


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