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六个品种马CKM基因遗传多样性研究

姚全福  
【摘要】: 中国蒙古马是世界上最古老的马品种之一,经历了遗传变异和自然选择的长期进化过程,在内蒙古自治区逐渐分化形成了地方品种如锡尼河马、巴尔虎马、乌审马、乌珠穆沁马和培育品种三河马等优良类群。蒙古马具有抗严寒、耐粗饲、抗病力、持久力和适应性强等特性,是人类宝贵的遗传资源。但国内外关于中国蒙古马遗传多样性、起源进化、亲缘关系等方面的系统研究还很少。 本研究以上述6个品种马共109个样品为研究对象,利用PCR技术,首次克隆测序了6个品种马的肌酸激酶(CKM)基因第二内含子612bp的DNA片断序列,检测、分析了CKM基因的多态性,得出以下结论: (1)109匹马的CKM基因第二内含子所检测序列均为612bp,共检测到23个多态位点,18个单倍型。所获得的CKM基因单倍型序列已提交到GenBank,登录号分别是:HM151343-HM151360。 (2)CKM基因第二内含子核苷酸变异类型均为插入/缺失、转换和颠换。转换频率明显高于颠换,呈现较强的转换偏倚。 (3)根据CKM基因序列构建的系统发育关系树表明,中国家马具有多个起源,经过多次驯化。推测纯血马和蒙古马起源关系比较远。 (4)109匹马的612 nt序列的17号位点处均有1个In/Del (插入删除位点),共产生2种单倍型,其单倍型多样性为0.071,每个位点的In/Del多样性为0.00012,其中性检验的Tajima's D值为-0.70376,差异不显著(P 0.10)。 (5)109匹马的612 nt序列,不计插入删除In/Del位点,共发生23个碱基替换,其序列保守性(Sequence Conservation)为0.962,保守区域为175-27(7P=0.0132)和338-497(P=0.0008)之间的序列。 (6)分子变异分析表明,蒙古马各类群与纯血马之间的差异显著,而蒙古马各类群间的差异不显著。 本研究首次对几个品种马CKM基因序列及其多态性进行了初步研究,研究结果对今后合理利用、开发和保护我国马品种的遗传资源以及赛马的选材与选拔提供了理论依据。


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