收藏本站
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

曲率在生物序列相似性分析中的应用

汪挺松  
【摘要】: 随着人类基因组,微生物基因组和水稻基因组全序列测定项目的完成和快速进展,以及各种生物的基因和蛋白序列的研究,产生了越来越多的庞大的分子序列数据。对这些数据的科学分析,处理和保存促进了分子生物学和数学以及计算机科学的结合,产生了一门崭新的学科——计算分子生物学。计算分子生物学不仅有重大的科学意义,而且具有巨大的经济效益。它既属于基础研究,以探索生物学的自然规律为己任;又属于应用研究,它的许多研究成果可以较快或立即产业化,成为价值很高的产品。近几年来,计算分子生物学已成为生命科学中非常活跃的一个研究领域。计算分子生物学是现代信息科学,计算机科学,生命科学,数学,统计学,物理学,化学等很多学科相互交叉的学科,主要是研究分子生物学与基因和蛋白质序列有关的复杂计算问题。其中,生物序列的比较是分子生物学中最基本的问题,因为对于DNA序列,即使我们考虑它的一个很短的片段,我们也不可以直接得出它表示的对象所具有的全部信息,然而如果我们比较不同的生物序列就有可能得到某些重要信息,但是这个问题非常复杂,至今还有许多未解决的问题。总之,对生物序列进行分析和比较是计算分子生物学最基本也是最重要的课题之一,同时对生命科学的研究具有深远意义。本文将在生物序列的相似性分析方面进行研究,研究成果有: 将由三次样条函数光滑化的曲线的曲率引入生物序列的相似性分析,提出用曲率作为新的不变量。并且以九种物种的β-球蛋白基因的第一个外显子编码序列为例,利用该方法分析了他们之间的相似性。本文的方法具有准确性高,计算简单等优点。


知网文化
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前20条
1 白凤兰;廖波;王天明;;拓扑指数在生物序列相似性比较中的应用[J];生物数学学报;2006年04期
2 石龙;黄海兰;;基于DNA序列混沌游戏表示的相似性分析[J];吉首大学学报(自然科学版);2009年03期
3 赵熙强;牟敬君;;基于DNA序列四维图形表示的相似性分析[J];中国海洋大学学报(自然科学版);2008年02期
4 宋杰;;基于离散度函数的DNA序列的相似性分析[J];计算机与应用化学;2007年06期
5 田智鲲;肖前军;周立前;;基于新三维图形表示及相似度量的DNA序列比较分析(英文)[J];湘潭大学自然科学学报;2010年03期
6 李梅;白凤兰;;基于DTW距离的DNA序列相似性分析[J];生物数学学报;2009年02期
7 张玉森;廖波;;基于3-D图形表示的DNA序列的相似性分析(英文)[J];生物数学学报;2007年04期
8 强静;贺平安;;蛋白质序列的图形表示及相似性分析[J];浙江农业学报;2010年05期
9 刘法利;赵熙强;;一种基于氨基酸物理化学性质上的DNA序列图形表示及相似性分析[J];中国海洋大学学报(自然科学版);2008年05期
10 石龙;;一种DNA序列的2D图形表示[J];科技信息;2009年01期
11 王世英,李湘露;DNA序列的一类非退化的2-D图表示[J];中原工学院学报;2002年01期
12 阿扎提·艾则左夫;;Mathematica在曲线论,曲面论中的应用(1)[J];新疆师范大学学报(自然科学版);2007年04期
13 迟锐;高随祥;;DNA序列的3D图形表示(英文)[J];中国科学院研究生院学报;2007年03期
14 杨子恒;多个核酸序列的计算机比较分析[J];遗传;1991年02期
15 杨子恒;DNA序列的信息度量揭示了DNA序列中多少信息量?[J];遗传;1992年04期
16 王晋芳;邱并生;田波;;水稻条纹叶枯病毒分子生物学的研究——Ⅲ.外壳蛋白基因的序列分析[J];中国病毒学;1992年04期
17 冯涛,康喆雯,韩小军,贺明峰;关于DNA序列分类问题的模型[J];数学的实践与认识;2001年01期
18 唐晓婵;周盼盼;邱文元;;基于4D图形表示的DNA序列相似性分析[J];科学通报;2010年06期
19 胡光涛,孟捷,陈滔,刘次全,彭守礼,陈中轩;DNA序列的统计信息比较分析[J];生物数学学报;1995年02期
20 车未艾;张铁明;;DNA序列在苔藓分子系统学研究中的应用[J];西北植物学报;2006年06期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 陈立萍;乔元华;;SVM方法在DNA序列识别中的应用[A];2003中国现场统计研究会第十一届学术年会论文集(下)[C];2003年
2 苏玉琢;周果宏;;HLA核甘酸序列相似性分析初探[A];21世纪医学工程学术研讨会论文摘要汇编[C];2001年
3 季韬;裘涛;;钢筋砼截面性能的研究[A];第七届全国结构工程学术会议论文集(第Ⅱ卷)[C];1998年
4 张晓俊;黄玉清;魏辉;占志雄;胡奇勇;陈元洪;;福建省褐飞虱种群的RAPD分析[A];走向21世纪的中国昆虫学——中国昆虫学会2000年学术年会论文集[C];2000年
5 李天瑞;;DNA序列分析的理论基础及挖掘算法研究[A];科技、工程与经济社会协调发展——中国科协第五届青年学术年会论文集[C];2004年
6 王叶飞;;基于DEM的地形曲率计算模型误差分析[A];中国地理学会2004年学术年会暨海峡两岸地理学术研讨会论文摘要集[C];2004年
7 赵英刚;刘仰光;何钦铭;;一种约减型支持向量域数据描述算法[A];第25届中国控制会议论文集(中册)[C];2006年
8 卢秉武;颜俊明;;测量工作中水平面代替水准面的数学分析[A];中国航海学会航标专业委员会测绘学组学术研讨会学术交流论文集[C];2006年
9 岳景朝;王浩;栾军华;刘国权;;三维个体晶粒曲率参量测量方法初探[A];第十二届中国体视学与图像分析学术会议论文集[C];2008年
10 蒲黔辉;杨永清;何广汉;;部分预应力混凝土构件的弯矩-曲率关系[A];第八届全国结构工程学术会议论文集(第Ⅱ卷)[C];1999年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 郭颖;生物序列的几何刻画及应用[D];大连理工大学;2008年
2 姚玉华;生物序列相似性分析的图形表示及其不变量方法[D];大连理工大学;2006年
3 骆嘉伟;基因数据相似性分析方法研究[D];湖南大学;2008年
4 白凤兰;生物序列的图形表示及其应用[D];大连理工大学;2006年
5 袁春欣;核酸序列的图形表示理论及应用[D];大连理工大学;2007年
6 刘立伟;蛋白质及RNA结构比较与进化分析[D];大连理工大学;2008年
7 王世元;基于信号处理技术的生物序列相似性分析与基因识别[D];重庆大学;2011年
8 解小莉;生物序列的分析方法及其进化模型研究[D];西北农林科技大学;2012年
9 杨克强;葡萄无核基因定位与作图的研究[D];西北农林科技大学;2003年
10 吕可波;有限和无限符号序列的研究[D];大连理工大学;2005年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 汪挺松;曲率在生物序列相似性分析中的应用[D];大连理工大学;2007年
2 于成龙;DNA序列的图形表示及其相似性分析[D];浙江大学;2006年
3 吴霞;蛋白质序列比较中的图形表示及其相似性分析[D];大连理工大学;2004年
4 刘赞波;DNA及蛋白序列相似性分析方法研究[D];湖南大学;2009年
5 牟敬君;生物序列的图形表示及相似性分析[D];中国海洋大学;2008年
6 李刚成;基于DNA序列4D表示的相似性分析与进化树算法研究[D];中南大学;2008年
7 李梅;基于DTW距离的生物序列相似性分析[D];大连交通大学;2010年
8 黄伟;基于面积不变量的生物序列相似性分析[D];大连理工大学;2008年
9 于正刚;生物序列新的图形表示及其应用[D];中国海洋大学;2008年
10 唐晓婵;DNA序列的图形表示方法及应用[D];兰州大学;2009年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 何瑶;美发现致病“热点”DNA序列[N];医药经济报;2002年
2 史颖 张学全;人与黑猩猩DNA序列差异为1.44%[N];医药经济报;2004年
3 演讲人 丘成桐;研学之乐[N];光明日报;2011年
4 游雪晴;我国首家DNA序列公共数据库开通[N];中国环境报;2000年
5 ;国际HGP与我国的“1%项目”[N];科技日报;2000年
6 ;生命大解密[N];中国消费者报;2001年
7 无锡市石塘湾中心小学 李建清;小线条 大学问[N];中国电脑教育报;2009年
8 王洛宾;您认识这些名车车标吗?[N];温州日报;2005年
9 李学华;飞秒级超短脉冲激光束整形技术获突破[N];科技日报;2007年
10 高文;尊贵典雅浪漫 [N];中华工商时报;2002年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62982499
  • 010-62783978