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HoxC簇基因与先天性髋脱位的传递不平衡检验及D12S1686位点基因频率分析

王岳平  
【摘要】: 目的 先天性髋脱位(congenital dislocation of the hip,CDH)是小儿骨科常见的先天畸形之一,在我国的发病率为0.91~3.80‰不等。目前,遗传流行病学调查资料表明其属于多基因遗传病。 近年来,在基因敲除的动物实验中发现Hox基因参与并调节骨骼形态发育,动物实验亦表明Abd-B组HoxC簇基因在下肢表达;1993年Spielman首先应用遗传标记进行传递不平衡检验(transmission disequilibrium test,TDT),成功地定位了Ⅰ型糖尿病的易感基因,这种方法非常适合在我国目前核心家系优势的社会进行多基因遗传病易感基因定位研究。 目前,国内外尚无HoxC簇基因与先天性髋脱位之间的研究报道。因此,本实验在HoxC簇基因所在染色体区域选取微卫星多态标记D12S1686,检测了101个CDH核心家系各成员的基因型,对65个杂合双亲家系进行TDT分析,初步探讨HoxC簇基因与先天性髋脱位的关系,并分析D12S1686位点的基因频率。 方法 1.实验对象: 实验组:101例CDH患儿及其父母组成101个核心家系。 对照组:3名正常人 2.提取基因组DNA 取外周静脉血5-10ml,EDTA抗凝,常规酚/氯仿法提取基因组DNA。 3.PCR扩增 遗传标记D1251686位于HOXC簇基因所在染色体区域;PCR 反应体系为25 ul,循环条件:94 T预变性10分钟;94℃40秒35℃ 40秒、72℃40秒,循环30次;72℃延伸7分钟。 4.基因型检测 PC R产物经6%变性聚丙烯酸胺凝胶电泳3.5-4小时,银染 法显带。根据正常对照者等位基因的位置及已知等位基因片断长 度确定核心家系各成员的基因型及片断长度。 5.传递不平衡检验 列出杂合型父母向子代传批不传递的等位基因数,建立TDT 表格,并应用SAS软件中的 FREQ程序进行分析。 6.基因频率分析 按文献的统计方法进行基因频率计算,Hardg-Weinbers平衡 吻合度检验及不同人群基因频率比较。 实验结果 二.TDT分析结果 x‘=6.且*,P=0.965,提示 D12S1686 位 点与CDH不存在传递不平衡。 2.中国辽宁汉族人群在D1251686位点基因频率分析 由于 D1251686位点与CDH之间不存在传递不平衡,选择患儿父母(共 188人)作为无遗传关系人群进行基因频率分析。 a.在188名无遗传关系的中国辽宁汉族人中检测到16个等 位基因,59个基因型。等位基因片段长度在2 15-249hP之间,基 因频率在0.003-0.245之间,杂合度为0.855。 b.Hardg-Weinbere平衡吻合度检测基因型频率的期望值和 观察值无显著性差异*‘=50.245,P>0.10人符合 Hardy-Wein- hers平衡,提示该位点可作为有效的遗传标记用于基因连锁分析。 ·2· C.中国辽宁汉族人群与高加索人群(白种人)的基因频率之 间存在显著差异(a二 0.005,X’二 48.456,P<0.001)。 结 论 1.D1251686位点与CDH之间不存在传递不平衡,HoxC簇基 因可能与先天性髓脱位无明显相关。 2.中国辽宁汉族人群在D1251686位点处共检测到16个等 位基因,片断长度在215-249hP之间,基因频率在0.003-0.245 之间、杂合度为0.855,与国外文献报道高加索人群(白种人)的基 因频率差异显著河<o.001人提示该结果可能与种族、民族差异 有关。


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