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识别基因调控元件的相关算法分析与比较研究

王婷  
【摘要】: 基因非编码区的一个主要研究方向是对调控元件的研究。因为在转录和后转录水平,基因的表达在很大程度上受到一些顺式作用元件(即转录调控元件,在生物信息学中也称为模体或motif)的控制,它们本质上是一些比较短的DNA序列,这些序列一般都处在受调控基因的上游区域,DNA转录因子识别这些调控元件,并与之结合,调节DNA的代谢和转录;或者由RNA结合蛋白识别,并与之结合,影响RNA的修饰、定位、翻译和降解。因此,分析和识别转录调控元件及了解它们的功能是理解和解释整个基因组行为的重要步骤。 识别基因调控元件的计算机识别主要有两类方法:一类是转录水平的调控模型,另外一类是寻找共同模体的数学方法。包括基于字串的方法和基于序列的概率模型方法,以及模体识别的网络资源 本论文中,对基因非编码区调控元件在识别研究领域中的地位、意义和价值进行系统的阐述。并且对识别基因调控元件的相关算法进行分析和比较研究,更进一步的论证了基因调控元件的重要地位。


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