收藏本站
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

蛋白质关联图预测研究

刘桂霞  
【摘要】: 生物信息学中一个基础而尚未解决的问题是从氨基酸序列预测蛋白质的三维结构。目前,使用全分子建模方法得到蛋白质的三维结构仍然十分困难,因此,预测蛋白质三维结构的一个中间步骤----预测蛋白质残基间的关联图应运而生并得到快速发展。蛋白质关联图包含着蛋白质折叠信息和空间结构的重要信息,因此它的解决对于蛋白质折叠识别意义重大。在获取了蛋白质关联图信息后,蛋白质三级结构重建将变得比较简单,而且根据蛋白质关联图信息重建蛋白质三级结构的方法已日渐成熟。同时,在蛋白质结构比对方法中,蛋白质关联图叠合法是唯一不用预先计算蛋白质结构的方法。蛋白质的结构决定功能,因此蛋白质关联图预测问题的解决对蛋白质空间结构预测和蛋白质功能预测都有着极其重大的意义。计算智能是一种仿生计算方法,它从生物底层对智能行为进行模拟和研究,拓展了传统的计算模式,它具有在不确定及不精确环境中进行推理和学习的卓越能力,是建立智能系统的有效计算工具。随着人类基因组计划的实施,以及更多生物基因组测序计划的完成,计算智能在生物信息学中得到了广泛的应用。本文在全面分析和了解了蛋白质结构预测的研究现状、研究热点和发展趋势的基础上,重点研究了人工神经网络和人工免疫系统在蛋白质关联图预测中的应用。本文的主要贡献和研究成果如下: (1)对蛋白质关联图预测方法研究背景、研究现状、研究意义及相关概念进行了全面的综述。 (2)对后基因组时代的生物信息学和蛋白质结构及其预测原理方法进行了综述,阐述了计算智能的相关理论,介绍了人工神经网络和人工免疫系统的基础理论,最后对计算智能在生物信息学中应用做了全面总结和归纳。 (3)提出了基于偏置递归神经网络蛋白质关联图预测实现方法。 (4)提出了基于暂态混沌神经网络蛋白质关联图预测研究方法。 (5)提出了基于克隆选择算法的蛋白质联系图预测模型。 本文的研究成果丰富了计算智能理论的应用研究,在递归神经网络、混沌神经网络、克隆选择算法等方面的研究具有一定的理论意义和应用价值,为蛋白质关联图预测研究提供了有意义的方法和手段。


知网文化
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前20条
1 程钢;;生物信息学课程教学改革和实践[J];安徽农学通报(上半月刊);2011年13期
2 熊春江;江黎明;;增强子及其生物信息学预测[J];生命的化学;2011年03期
3 张萌;张柱;倪乐意;;生物信息学在水生植物化感控藻进化机理研究中的应用[J];安徽农业科学;2011年22期
4 张根连;范术丽;宋美珍;庞朝友;喻树迅;;植物蛋白质组学技术研究进展[J];生物技术通报;2011年07期
5 杨海秀;;面向对象课程在生物信息专业教学中的探索和实践[J];科技信息;2011年17期
6 王琦;李玮妮;王荣;;蜜蜂TPI基因克隆与生物信息学预测[J];生物技术通报;2011年09期
7 杨书卷;;研发活动,时间“竞走”[J];科技导报;2011年24期
8 ;人才职位[J];生物技术进展;2011年02期
9 程振涛;岳筠;周碧君;许乐仁;王开功;文明;李永明;;羊痘病毒P32基因生物信息学分析[J];西北农业学报;2011年08期
10 朱文楠;习杨;吕湘;刘德培;;人类miRNA上游转录因子及下游靶基因的基因本体分析[J];中国微生态学杂志;2011年08期
11 张磊;晁江涛;崔萌萌;陈雅琼;宗鹏;孙玉合;;茄子microRNAs与其靶基因的生物信息学预测[J];遗传;2011年07期
12 赵月;奚燕萍;王飞;;调控-代谢网络的集成建模与分析方法研究[J];计算机应用与软件;2011年07期
13 彭昱静;邹盛荣;陈彦;;群落划分方法在免疫网络中的比较[J];电脑知识与技术;2011年18期
14 吴序栎;朱倩倩;成小娟;徐宏;刘志刚;吴晖;;牛乳β-乳球蛋白热稳定与免疫原性关系的光谱学研究[J];光谱学与光谱分析;2011年08期
15 吕奕;王清;;一种基于概率校正和集成学习的肠癌肝转移预测模型[J];计算机应用与软件;2011年09期
16 连英丽;蓝东明;杨博;王永华;;寄生曲霉脂肪酶的全基因合成、原核表达及其结构分析[J];生物技术通报;2011年07期
17 刘丽娜;朱军民;丛延广;胡福泉;;2-型猪链球菌分泌性保护性抗原RfeA的确认[J];免疫学杂志;2011年08期
18 ;征稿启事[J];生物技术进展;2011年01期
19 肖绚;徐培杰;;哈斯矩阵图的G-蛋白偶联受体类型预测[J];计算机工程;2011年18期
20 ;科研快讯[J];现代生物医学进展;2011年08期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 李媛;崔尚金;李建伟;于康震;;分子生态学与生物信息学[A];中国畜牧兽医学会禽病学分会第十一次学术研讨会论文集[C];2002年
2 陆文聪;钮冰;;基于数据挖掘的生物信息学研究进展[A];中国化学会第27届学术年会第15分会场摘要集[C];2010年
3 陈婷婷;郭婷婷;李林;安冬;;基于生物信息学的功能蛋白基因序列分类研究[A];2011年全国通信安全学术会议论文集[C];2011年
4 卢学春;杨波;朱宏丽;姚善谦;;采用生物信息学方法优化依硫磷酸联合方案治疗MDS的应用研究[A];中国科协海峡两岸学术研讨会——2008血液肿瘤论坛会议会编[C];2008年
5 阮林;何颖;邹泽红;傅意玲;陈惠芳;陶爱林;;外源蛋白过敏原性生物信息学评价[A];中华医学会2010年全国变态反应学术会议暨中欧变态反应高峰论坛参会指南/论文汇编[C];2010年
6 冯文龙;赵清杰;;基于遗传算法的DNA多序列比对问题[A];2007年中国智能自动化会议论文集[C];2007年
7 康晓东;;生物信息学及其研究对象[A];2003年全国医学影像技术学术会议论文汇编[C];2003年
8 王智宇;童强松;曾甫清;刘媛;顾朝辉;郑丽端;蔡嘉斌;蒋国松;;小鼠睾丸特异性基因TSEG-4的克隆及表达分析[A];第十五届全国泌尿外科学术会议论文集[C];2008年
9 朱云平;刘湘军;魏丽萍;李亦学;;肝脏蛋白质组的生物信息学研究[A];中国蛋白质组学第三届学术大会论文摘要[C];2005年
10 孙琳琳;蒋继志;;生物信息学及其在作物抗性基因研究中的应用[A];中国植物病理学会2006年学术年会论文集[C];2006年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 彭司华;计算智能在生物信息学中的应用研究[D];浙江大学;2004年
2 张敏;生物信息学中多序列比对等算法的研究[D];大连理工大学;2005年
3 曾智勇;猪呼肠孤病毒SC-A株的分离鉴定及全基因组cDNA文库的构建和分子遗传特征分析[D];四川农业大学;2006年
4 肖庆;硬粒小麦硒蛋白的生物信息学研究[D];华中科技大学;2008年
5 张革新;α-淀粉酶性能与结构关系的生物信息学研究[D];江南大学;2005年
6 李艳芸;HLA-DRB1基因编码区SNPs的分析及其与宫颈癌的相关性研究[D];天津医科大学;2006年
7 童庆;面向基因预测的信息处理方法研究[D];中国科学技术大学;2006年
8 刘立芳;生物信息学中的多序列比对与模体识别问题研究[D];西安电子科技大学;2006年
9 郭雨珍;蛋白质结构预测和比较的优化研究[D];大连理工大学;2007年
10 熊赟;生物序列模式挖掘与聚类研究[D];复旦大学;2007年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 张书欣;生物信息学若干问题研究报告[D];吉林大学;2012年
2 詹超;支持向量机在基因表达数据分类中的研究[D];武汉理工大学;2006年
3 郭俊恩;蚁群遗传算法在序列比对中的应用[D];江南大学;2008年
4 潘志宏;植物化感作用代谢途径模拟预测系统的构建与应用[D];福建农林大学;2009年
5 郭洪峰;特异上调HO-1基因表达的人工转录因子构建[D];第三军医大学;2009年
6 乐东海;耐辐射球菌DNA连接酶的研究[D];浙江大学;2005年
7 黄志华;水稻基因组中的假基因研究[D];浙江大学;2005年
8 朱贤芳;生物序列的比对算法比较研究[D];南京理工大学;2005年
9 王树青;基于生物信息学的SARS冠状病毒主蛋白酶抑制剂的设计[D];天津师范大学;2005年
10 曲华;一种双聚类算法的实现与改进[D];吉林大学;2005年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 衣晓峰 乔蕤琳;哈医大建立系列生物信息学研究方法[N];中国医药报;2010年
2 记者 郭晓静 通讯员 熊学莉;三医大建起生物信息学数据库[N];重庆日报;2003年
3 邢方亮;计算智能大有可为[N];计算机世界;2003年
4 本报记者 白毅;生物信息学院士谈[N];中国医药报;2002年
5 中科院生物学部 张春霆;对生物信息学的展望[N];北京科技报;2000年
6 中科院院士 吴旻;要适时推进生物信息学综合服务[N];光明日报;2002年
7 陈光宇 丁俊娜;破译生命“天书”[N];浙江日报;2005年
8 宋翩龚华萍;华工学子2008年IEEE世界计算智能大赛折桂[N];大众科技报;2008年
9 中国科技大学计算机系 邢方亮;计算智能百花齐放[N];计算机世界;2003年
10 秦明 鸣琦;计算智能与安全国际会议在西安举行[N];陕西日报;2005年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62982499
  • 010-62783978