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诱导胰腺和心肌病变的柯萨奇病毒B3 MKP株全基因组核苷酸序列分析

李哲  
【摘要】: 柯萨奇病毒(Coxsackievirus)是人类多种疾病的病原体。近年来,由于柯萨奇病毒感染报告不断增加,对人类健康造成一定的威胁,所以柯萨奇病毒基因特性的研究倍受学者们关注。为进一步认识不同来源病毒株与病毒遗传特性的关系,了解CVB3基因组特点及该病毒与心肌炎和胰腺炎的关系。本课题组对来自中国上海防疫站的柯萨奇病毒B组3型MKP株(CVB3/MKP)进行了研究。 本实验采用RT-PCR技术获得覆盖CVB3/MKP全基因组的7个cDNA片段,经测序、拼接后得到全基因组序列。对CVB3/MKP 5′端非编码区、全长核苷酸序列及氨基酸序列与GenBank中其它CVB3进行比对分析,并对RNA二级结构进行预测。其中CVB3/AS、CVB3/28、CVB3/20、CVB3/Nancy是致胰腺炎和心肌炎的毒株,CVB3/CO是仅致胰腺炎的毒株,CVB3/GA和CVB3/0是非致病毒株。此外用该病毒感染Swiss小鼠,在病毒感染3d、7d、21d、40d、55d分批处死小鼠,检测小鼠的体重、血糖、尿糖,观察小鼠胰腺和心肌组织的病理损伤情况。 CVB3/MKP基因组全序列长度为7400bp,开放阅读框架长度为6555bp,编码2185个氨基酸的多聚蛋白前体。5′端非编码区、全长核苷酸序列比对分析结果显示CVB3/MKP株与CVB3/20、CVB3/0、CVB3/28相似性在99.4~99.6%,处于系统发生树的同一分支。氨基酸序列分析有7个位点发生了独特变异。预测的RNA二级结构发现,CVB3/MKP与CVB3/20和CVB3/28仅有一个核苷酸差别,RNA二级结构基本一致;与CVB3/AS存在15个核苷酸位点的差异,但RNA二级结构却极为相似;与CVB3/CO和CVB3/GA二者无论在核苷酸序列还是RNA二级结构上都有显著不同,说明CVB3/MKP与致胰腺炎和心肌炎的CVB3/28毒株亲缘关系极为密切,进而通过动物实验证实了CVB3/MKP的胰腺毒性及心肌毒性。


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