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山葡萄花色苷生物合成转录因子Vamyb_2基因cDNA的克隆与分析

付阳  
【摘要】:山葡萄是我国重要的野生资源,果实中有黄酮类、单宁类、苯丙素类等多种代谢产物,本文对山葡萄花色苷生物合成过程中的转录调节因子展开研究。 试验采用SDS法、Trizol法和改良CTAB法三种RNA提取方法,提取山葡萄果皮和叶片的总RNA。结果表明:改良CTAB法所提取山葡萄叶片和果皮的总RNA带形完整,28SrRNA和18SrRNA的荧光亮度接近2:1,OD250/OD280值介于1.8~2.0之间,该方法提取的总RNA纯度和提取量最高。 试验采用RT-PCR、SMARTTMACE技术从山葡萄成熟果皮中克隆得到了转录调节因子Vamyb2基因的cDNA全长序列,生物信息学结果表明,其编码171个氨基酸,分子量为19.47KDa,等电点值为6.15。不稳定指数为30.56,是稳定蛋白质;多序列比对与欧亚种葡萄、杂交种葡萄相似性均达到99%;分子进化树结果表明,与美洲种葡萄和杂交种葡萄亲缘关系近,与拟南芥、金鱼草等转录因子亲缘关系较远;该基因无信号肽,但具有亲、疏水性;二级结构主要是以α-螺旋和不规则卷曲盘绕为蛋白质的最大量结构原件;同时该基因不具有跨膜区,主要是在膜外进行作用。


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1 付阳;山葡萄花色苷生物合成转录因子Vamyb_2基因cDNA的克隆与分析[D];延边大学;2014年
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