收藏本站
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

干旱胁迫诱导的水稻基因组胞嘧啶甲基化变化

刘炜  
【摘要】: 本论文采用15%PEG(聚乙二醇)溶液模拟干旱条件,分别对水稻松前和其渐渗系材料RZ1、RZ2和RZ35进行了不同时间梯度的处理(4小时、1天、6天)。对在该干旱胁迫条件下水稻基因组DNA甲基化状态及其变化用MSAP方法进行了分析。利用17对选择性扩增引物在4种材料分别得到536条、554条、554条、562条带。我们发现干旱胁迫引起了水稻基因组DNA甲基化修饰模式的明显改变。其中变化率最高的为松前4小时处理,变化位点占所检测甲基化敏感位点的54%,最低为松前6天,占所检测甲基化敏感位点的10%。但是在干旱胁迫中,不同处理组DNA甲基化变化对干旱胁迫的效应时期不同,松前、RZ1、RZ2在4小时变化达到最大值,RZ35呈现明显的对干旱胁迫应答高峰的延迟现象,在24小时(1天)达到最大值。对于考察的三个时间点,处理组DNA甲基化升降具有不同趋势,即松前、RZ1和RZ2干旱胁迫处理后均出现先升高然后急剧下降,但是RZ35却表现出逐渐升高然后缓慢降低。RZ35基因组DNA甲基化在干旱胁迫中表现特殊变化规律,推测其原因是由于基因型不同所导致。根据MSAP结果,对15个变化明显的条带进行克隆、测序。结果显示所测序列全部为一端为EcoRⅠ识别位点,一端为HapⅡ/MspⅠ识别位点,即每条带代表一个甲基化位点。基于BlastN分析,发现15条片段定位于不同的水稻染色体上。进一步的BlastX分析结果表明,其中4条带跟功能基因具有较高的同源性,占总测序序列的26.7%。我们用MSAP分析所得的特异性片段作为探针进行Southern杂交验证,共用了11条序列作为探针,除了探针MSAP16显示模糊的带型,探针MSAP15显示高拷贝而无法辨认外,探针MSAP1、MSAP12、MSAP27显示了清晰的甲基化变异条带,证实了干旱胁迫确实可以影响正常的DNA甲基化修饰状态,这也可能是干旱胁迫应答的一个关键步骤。


知网文化
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前20条
1 ;我国率先公布水稻基因组“工作框架图”[J];中国稻米;2001年06期
2 ;何为“国际水稻基因组测序计划”[J];新农业;2003年01期
3 ;美国科学家绘出玉米基因组草图[J];农业工程技术(农产品加工业);2008年03期
4 陶全洲;日本水稻基因组研究进展[J];生命的化学;1996年04期
5 张路;水稻基因组希望与困惑[J];百科知识;2002年07期
6 高东迎;何冰;孙立华;;水稻转座子研究进展[J];植物学通报;2007年05期
7 袁云香;孙丙耀;;适于TAIL-PCR模板的水稻基因组DNA提取方法的优化[J];安徽农业科学;2009年09期
8 王希胤,史晓黎,郝柏林;水稻基因组中的tRNA和rRNA基因(英文)[J];遗传学报;2004年09期
9 黄辛 ,李存富;科学意义重大 应用前景广阔——中科院副院长许智宏就水稻基因组物理图答记者问[J];科技文萃;1997年04期
10 ;我国独立完成水稻基因组“工作框架图”[J];自然科学进展;2002年02期
11 鞠玉栋,李金泉;水稻微卫星标记的发展与应用[J];安徽农业科学;2005年10期
12 吴毅歆;熊国如;袁远;罗灯涛;何月秋;;水稻基因组中分泌蛋白的初步分析[J];分子植物育种;2008年05期
13 杨塞;;转双基因(Bt/Pi9)水稻的分子检测及抗性鉴定[J];长江大学学报(自然科学版)农学卷;2008年04期
14 唐忠海,覃静萍,储成才,彭国平,饶力群;T-DNA标签法在水稻功能基因组研究中的应用[J];杂交水稻;2005年06期
15 金伟波;吴方丽;孔栋;郭蔼光;杨淑慎;;计算识别水稻基因组中microRNA基因[J];西北农林科技大学学报(自然科学版);2006年12期
16 牛洪斌;覃怀德;王益华;翟虎渠;万建民;;水稻谷蛋白的一个新基因克隆及表达分析[J];作物学报;2007年03期
17 丁在松;赵明;荆玉祥;李良璧;匡廷云;;玉米ppc基因过表达对转基因水稻光合速率的影响[J];作物学报;2007年05期
18 李娟;文建成;谭学林;;从水稻单粒糙米中快速制备基因组DNA的方法[J];分子植物育种;2007年05期
19 赵艳;钱前;王慧中;黄大年;;基因枪转化的bar基因表达盒在水稻中遗传行为复杂(英文)[J];遗传学报;2007年09期
20 谭才邓;李静;周玲艳;李峰;庄楚雄;;水稻丙酮酸脱氢酶激酶1多克隆抗体的制备[J];江苏农业科学;2010年02期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 聂转花;刘娥娥;;激素和逆境处理对OsOxO表达的影响[A];广东省植物学会第十九期学术研讨会论文集[C];2010年
2 ;深圳华大基因研究院[A];培育生物产业,发展绿色经济——第五届中国生物产业大会·2011基因科学与产业发展论坛会刊[C];2011年
3 韩斌;;水稻第四号染色体的精确测序及分析[A];中国的遗传学研究——中国遗传学会第七次代表大会暨学术讨论会论文摘要汇编[C];2003年
4 彭凌涛;王江;张景六;;水稻谷氨酰半胱氨酸合成酶基因的克隆研究[A];中国植物生理学会全国学术年会暨成立40周年庆祝大会学术论文摘要汇编[C];2003年
5 易可可;吴忠长;周洁;吴运荣;吴平;;植物耐低磷转录因子研究[A];中国植物生理学会全国学术年会暨成立40周年庆祝大会学术论文摘要汇编[C];2003年
6 任仲海;朱美珍;高继平;孙世勇;晁代印;胡筱荷;林鸿宣;;水稻耐盐性QTL/基因的定位分析[A];中国植物生理学会全国学术年会暨成立40周年庆祝大会学术论文摘要汇编[C];2003年
7 易可可;吴忠长;周洁;张麝龙;吴运荣;刘非燕;吴平;;植物磷饥饿调控转录因子研究[A];中国植物生理学会全国学术年会暨成立40周年庆祝大会学术论文摘要汇编[C];2003年
8 杨洪全;;水稻蓝光受体隐花色素CRY1的功能研究[A];中国植物生理学会全国学术年会暨成立40周年庆祝大会学术论文摘要汇编[C];2003年
9 曹明霞;黄健秋;卫志明;;农杆菌介导的多基因转化获得优质高产水稻株系[A];中国植物生理学会全国学术年会暨成立40周年庆祝大会学术论文摘要汇编[C];2003年
10 姜华武;佃蔚敏;刘非燕;吴平;;水稻可溶性淀粉合(成)酶II的克隆与表达分析——淀粉合(成)酶和淀粉分支酶共同参与水稻稻米碱消解质调节[A];中国植物生理学会全国学术年会暨成立40周年庆祝大会学术论文摘要汇编[C];2003年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 张华;水稻基因组重复片段上籼粳间杂种不育主效位点qS12的遗传分析和精细定位[D];武汉大学;2011年
2 Muhammad Rashid;[D];华中科技大学;2012年
3 陈双燕;T-DNA标签在水稻基因组中的分布与特征[D];浙江大学;2003年
4 张玉军;水稻基因组序列分析及比较基因组研究[D];中国科学院研究生院(上海生命科学研究院);2003年
5 郭兴益;水稻基因组的进化选择模式研究[D];浙江大学;2008年
6 叶少平;水稻分子图谱的构建和QTL定位研究[D];四川农业大学;2005年
7 贾沛昕;水稻第四号染色体特异DNA芯片的研制及水稻第四号染色体基因的表达谱和籼粳稻之间差异表达谱分析[D];中国科学院研究生院(上海生命科学研究院);2005年
8 汪旭升;基于生物信息学方法分析基因家族及非编码序列的研究[D];浙江大学;2006年
9 雷海燕;水稻4号染色体BAC 1365序列测定分析以及水稻ALDH,RLK,PP2A-A基因结构和功能的研究[D];中国科学院研究生院(上海生命科学研究院);2002年
10 叶红霞;大麦低植酸基因的比较基因组学研究与定位克隆[D];浙江大学;2010年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 项迎霞;空间飞行诱发水稻基因组不稳定序列特征分析[D];大连海事大学;2010年
2 夏鹏;利用物理图谱对水稻基因组部分区段的初步分析[D];华中农业大学;2010年
3 孔为博;“昌恢121/越光”染色体片段置换系群体构建[D];江西农业大学;2012年
4 汪旭升;水稻抗旱数量性状位点(QTLs)的基因挖掘研究[D];浙江大学;2003年
5 张翠翠;不同剂量~(12)C重离子辐射对水稻基因组和基因组甲基化诱变特征的分析[D];大连海事大学;2011年
6 孙川;水稻基因组DNA简易制备方法研究以及分子标记辅助选择改良稻米品质[D];扬州大学;2010年
7 朱建丽;水稻基因组序列分析与基因结构预测[D];华中科技大学;2007年
8 郭丽君;雄性不育和可育丹参中干旱调控基因的筛选与初步定位[D];西北农林科技大学;2013年
9 李靖;OsddWRKY基因克隆及水稻基因组WRKY家族分析[D];浙江大学;2002年
10 涂青华;以昌恢121和越光互为遗传背景的染色体片段置换系的构建[D];江西农业大学;2013年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 记者 何德功;水稻基因组解析即将完成[N];新华每日电讯;2002年
2 记者 张小军;水稻基因组对社会影响更直接[N];新华每日电讯;2002年
3 杨焕明;人类与水稻基因组测序与分析[N];科技日报;2002年
4 李绍明;水稻基因组计划离大田生产有多远[N];农民日报;2001年
5 田耕;水稻基因组图谱带来希望与困惑[N];大众科技报;2002年
6 ;首张水稻基因组“精细图”出自中国[N];中国高新技术产业导报;2002年
7 记者 李斌 毛磊;我科学家率先绘出水稻基因图谱[N];新华每日电讯;2002年
8 记者 毛磊;用处何在?[N];新华每日电讯;2002年
9 记者杨健;我完成世界首张水稻基因组精细图[N];人民日报;2002年
10 本报记者 吴洁;水稻基因组探秘:测序与功能[N];科技日报;2001年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62982499
  • 010-62783978