收藏本站
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

生防枯草芽孢杆菌mRNA差异显示分析

周红梅  
【摘要】: 枯草芽孢杆菌是一种重要的生物拮抗菌,在植物病害生物防治方面具有突出贡献。枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)Zh-2、Zh-4、Zh-6、Zh-18菌株是黑龙江省科学院微生物研究所基因工程室分离、鉴定并保存的4株重要生防菌。这些菌株形态、生理生化特性相同,而抑菌能力和抑菌谱不同。为了从分子水平区分这些菌株和快速克隆功能性新基因,本文首次采用mRNA差异显示分析技术,从分子水平探讨各个菌株之间的差异,寻找和分离其差异表达基因片段,为各个菌株建立一个分子档案,以区别各个菌株,同时,对特异表达基因的研究也有助于我们挖掘和利用优良基因,为快速克隆功能性新基因提供一种技术方法。 本项研究采用TaKara RNAiso Reagent法提取枯草芽孢杆菌总RNA,选择MICROBExpress TM Bacterial mRNA Enrichment Kit(Ambion)试剂盒富集mRNA,根据枯草芽孢杆菌基因组DNA GC含量与大肠杆菌基因组DNA GC含量具有相似性,从文献中选择11条随机引物对4株枯草芽孢杆菌进行mRNA差异显示分析,结果表明用这些随机引物进行PCR扩增,获得了77个差异片段。选择5个差异片段测序后进行了生物信息学分析。 来自于Zh-4菌株的S-1序列片段长750bp,经过生物信息学分析,该序列片段与来自枯草芽孢杆菌菌株168的相关基因序列有84%的相似性,编码产物名称是假定蛋白(hypothetical protein)。但该序列片段的功能目前还不清楚。 来自于Zh-4菌株的S-2序列片段长462bp,经过生物信息学分析,该序列片段与来自枯草芽孢杆菌菌株168的16SrRNA有99%的相似性。 来自于Zh-4菌株的S-3序列片段长度414bp,经过生物信息学分析,该序列片段与来自枯草芽孢杆菌168菌株的序列(检索号:ref|NP_387945.1|)有84%的相似性,编码产物名称是磷酸丝氨酸酶(serine phosphatase),其余的一部分相似序列所代表的功能均与孢子形成II期有关,剩余的相似序列来源于BAC库的测序结果。但该序列片段的功能目前还不清楚。 来自于Zh-18菌株的S-4序列片段长418bp,氨基酸序列比对检索与S-3序列片段相同,但2个序列的核苷酸序列不同。S-4序列片段的功能也未知。 来自于Zh-18菌株的S-5序列片段长222bp,经过生物信息学分析,该序列片段与来自短小芽孢杆菌菌株SAFR-032 (gb│cp000813.1│)有95%的相似性,相似序列功能是编码核糖核酸酶R。


知网文化
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前20条
1 李晶;杨谦;;生防枯草芽孢杆菌的研究进展[J];安徽农业科学;2008年01期
2 邱旺;张东杰;;枯草芽孢杆菌apr基因表达载体的构建[J];黑龙江八一农垦大学学报;2010年02期
3 孙晓宇;沈卫荣;韩丽萍;路鹏鹏;门欣;;枯草芽孢杆菌BSK1抗菌物质的初步研究[J];陕西农业科学;2010年06期
4 杨锋;章亭洲;;枯草芽孢杆菌生物学特性的研究[J];饲料研究;2011年03期
5 李瑞芳;薛雯雯;黄亮;熊前程;王彬;;枯草芽孢杆菌感受态细胞的制备及质粒转化方法研究[J];生物技术通报;2011年05期
6 韩继宏,阮宜兵,黄志诚;枯草芽孢杆菌及其在水产养殖中的应用[J];渔业致富指南;2002年22期
7 王振华,潘康成,张均利,杨金龙;枯草芽孢杆菌制剂在奶牛生产上的应用研究[J];饲料广角;2005年19期
8 卢剑;饶锐;刘模发;;微生物以菌克菌在葡萄上的应用[J];湖北植保;2006年03期
9 韩学易;陈惠;吴琦;梁如玉;高凤菊;胥兵;;产纤维素酶枯草芽孢杆菌C-36的产酶条件研究[J];四川农业大学学报;2006年02期
10 王洲;杨超英;薛正莲;;紫外辐照对产α-ALDC枯草芽孢杆菌的诱变效应[J];中国农学通报;2007年04期
11 张西锋;李万芬;袁新宇;张炜炜;刘波;王俊;杨明明;;枯草芽孢杆菌生物素操纵元的初步改造[J];西北农林科技大学学报(自然科学版);2007年07期
12 卢耀俊;周世水;朱明军;;一株水产用益生枯草芽孢杆菌液体发酵初步研究[J];内陆水产;2007年12期
13 罗楚平;陈志谊;刘永锋;刘邮洲;;利用基因工程改良枯草芽孢杆菌[J];江苏农业学报;2008年02期
14 彭化贤;席亚东;刘波微;朱建义;;枯草芽孢杆菌Xi-55液体发酵条件的优化及防治稻曲病试验[J];西南农业学报;2008年05期
15 李杰梅;刘朝亮;黄恒新;罗永发;杨得坡;;枯草芽孢杆菌对奶牛生产及乳脂脂肪酸组成的影响[J];中国乳品工业;2008年12期
16 张闻;汪立平;汪之和;;甘露聚糖酶产生菌F1-5的鉴定[J];安徽农业科学;2009年04期
17 廖春丽;张红波;王莲哲;;枯草芽孢杆菌wlcl芽孢生成条件优化及净水作用研究[J];安徽农业科学;2009年06期
18 惠明;田青;邓凤妮;;利用枯草芽孢杆菌B53发酵法生产维生素K[J];安徽农业科学;2009年08期
19 李应琼;崔堂兵;许喜林;陈成;;枯草芽孢杆菌BS-06抗真菌物质的特性研究[J];现代食品科技;2009年04期
20 徐海燕;张志焱;郭洪新;陈静;谷巍;曹斌;蒋东连;;枯草芽孢杆菌B7与甘露低聚糖制剂对雏鸡生产的影响[J];饲料博览;2009年04期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 刘桂君;孟佑婷;杨素玲;尚宏忠;;生防菌枯草芽孢杆菌的辐射诱变研究[A];公共植保与绿色防控[C];2010年
2 蒋思婧;马立新;;枯草芽孢杆菌的寡聚-1,6-葡萄糖苷酶基因的克隆及其在大肠杆菌中的表达[A];中国生物工程学会第三次全国会员代表大会暨学术讨论会论文摘要集[C];2001年
3 李华;沈立荣;冯凤琴;李铎;;细菌型豆豉发酵菌株的鉴定[A];2009食品科技(北京)论坛会议指南[C];2009年
4 杨明明;;枯草芽孢杆菌高效表达系统的构建[A];第六次全国饲料营养学术研讨会论文集[C];2010年
5 钟娟;周金燕;李志东;雷宝良;谭红;;一种新型抗菌肽——捷安肽素的研究[A];中国生物工程学会第四次会员代表大会暨学术讨论会论文摘要集[C];2005年
6 游银伟;尤升波;岳寿松;;枯草芽孢杆菌YYW-1蛋白酶缺陷株诱变与筛选[A];2006中国微生物学会第九次全国会员代表大会暨学术年会论文摘要集[C];2006年
7 亓雪晨;齐俊生;王琦;梅汝鸿;;枯草芽孢杆菌启动子片段的克隆及其在绿色荧光蛋白标记中的应用[A];中国植物病理学会2006年学术年会论文集[C];2006年
8 刘辉;魏祥法;井庆川;刘雪兰;刘瑞亭;石天虹;;一株枯草芽孢杆菌发酵培养基的优化[A];第三届第八次全国学术研讨会暨动物微生态企业发展战略论坛论文集[C];2006年
9 孙璐;文欣;谭英;李贺阳;赵月芳;牛聪伟;席真;;原卟啉原氧化酶及其突变体的酶学性质研究[A];中国化学会第26届学术年会化学生物分会场论文集[C];2008年
10 冀志霞;钱风光;陈守文;;西瓜枯萎病生防菌的筛选与鉴定[A];粮食安全与植保科技创新[C];2009年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 钱静亚;脉冲磁场对枯草芽孢杆菌的灭活作用及其机理研究[D];江苏大学;2013年
2 杨明明;枯草芽孢杆菌关键遗传调控元件及表达系统的研究[D];西北农林科技大学;2013年
3 李晶;黄瓜枯萎病高效拮抗枯草芽孢杆菌的筛选及生防机制研究[D];哈尔滨工业大学;2010年
4 伍辉军;枯草芽孢杆菌脂肽化合物合成调控基因功能研究及多功能生防工程菌株的构建[D];南京农业大学;2008年
5 任建军;枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis RN-61)抗菌蛋白的纯化及鉴定[D];北京林业大学;2013年
6 陈云;枯草芽孢杆菌生物膜在青枯病生防中的功能研究及Cyclic-di-GMP信号通路初探[D];南京农业大学;2012年
7 连超群;枯草芽孢杆菌表面展示人生长激素及其口服功效评估[D];江苏大学;2014年
8 齐东梅;药食源芽孢杆菌的分类鉴定及枯草芽孢杆菌H110抑菌特性研究[D];中国农业大学;2005年
9 王帅;芽孢杆菌及其脂肽类化合物防治植物病害和促进植物生长的研究[D];南京农业大学;2009年
10 王光强;枯草芽孢杆菌中Sec分泌途径底物特性及非经典分泌途径的研究[D];江南大学;2013年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 徐晶;弹性蛋白酶发酵生产条件优化及性质研究[D];东北农业大学;2008年
2 石岩;欧文氏杆菌突变体的构建及枯草芽孢杆菌甘露聚糖酶基因的克隆和表达[D];中国农业科学院;2010年
3 吴宝昌;枯草芽孢杆菌混合发酵制备豆粕饲料的研究[D];山东轻工业学院;2010年
4 徐广军;枯草芽孢杆菌BS_(3-1)对小麦赤霉病(Fusarium graminearum)的生物防治研究[D];四川农业大学;2003年
5 莫宏春;枯草芽孢杆菌6-磷酸葡萄糖脱氢酶的分离纯化和部分性质[D];四川大学;2003年
6 邹立扣;枯草芽孢杆菌WHNB02植酸酶phyC基因在大肠杆菌中的表达及玉米表达载体的构建[D];四川农业大学;2004年
7 周红梅;生防枯草芽孢杆菌mRNA差异显示分析[D];黑龙江大学;2008年
8 王君;大蒜汁对枯草芽孢杆菌抑制作用的研究[D];陕西师范大学;2008年
9 方晓雨;基于二氧化硅的材料固定化枯草芽孢杆菌的研究[D];武汉理工大学;2011年
10 郭小华;枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)R21-4细菌素的研究[D];中国农业大学;2003年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 ;浅谈枯草芽孢杆菌在水产养殖上的应用[N];中国海洋报;2003年
2 江苏省淡水水产研究所研究员 徐在宽 江苏省海洋与渔业局工程师 仇丽;复合型枯草芽孢杆菌活菌生物净水剂在特种水产养殖中的应用探讨[N];科技日报;2001年
3 本报记者 仇方迎;还水体以清新[N];科技日报;2001年
4 河北远征药业 赵茂华王东军;早期仔猪断奶后常见问题及对策⑤[N];河北农民报;2007年
5 水清;活菌剂在农业生产上的应用[N];江苏农业科技报;2008年
6 ;蛋白酶[N];中国畜牧兽医报;2008年
7 香红星;走进微生物世界让这个“小精灵”为你增效[N];中国畜牧兽医报;2007年
8 王化民 本报记者  张会斌;法库创出服务农民新模式[N];辽宁日报;2006年
9 中国科学院亚热带农业生态研究所研究员 邢廷铣;水产动物微生态制剂及其应用(上)[N];湖南科技报;2008年
10 潘康成杨汉博;饲用芽孢菌作用机理的研究应用[N];中国畜牧兽医报;2008年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62982499
  • 010-62783978