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动态性状基因复合区间定位理论与方法研究

高会江  
【摘要】:我们把组织器官的生长发育和随生命时间或某些定量因素变化的生产性能统称为动态性状。本文针对F2资源群体,从理论和模拟实验两个方面系统地研究了动态性状基因复合区间定位的原理与方法,取得了如下研究成果: 1 创建了动态性状基因复合区间定位分析的数学模型 根据Legendre多项式的正交、可加和普适的特性,将关于时间(测定日期)的Legendre多项式镶嵌在遗传模型的每个遗传效应中,以刻画QTL和协同因子对动态性状变化过程的作用。发挥复合区间定位策略的优势,提高对控制动态性状多个QTL的检测效力。 2 推证了动态性状基因复合区间定位分析模型参数的似然估计和回归估计方法 包括适于非平衡抽样的模型参数的似然估计和回归估计一般方法与平衡抽样的简化方法。在此基础上,给出了每种参数估计方法对应的参数求解过程。 3 采用蒙特卡罗模拟方法,比较了在相同的定位环境下,动态性状基因区间定位和复合区间定位同时检测多个QTL的效率的差异;探讨了以回归法代替似然法估计动态性状基因复合区间定位模型参数的可行性;着重地分析了模型中协同因子数目对动态性状基因复合区间定位效率的影响 模拟试验结果表明:复合区间定位法不仅检测出的QTL个数明显多于区间定位法,而且对所检测出的QTL位置、加性与显性回归效应值的估计准确度和精确度均优于区间定位法;在假设误差方差齐次条件下,回归分析法对多个QTL的检测效果与极大似然法基本相同,但回归分析法比极大似然法表现出相当高的运算速度。当被检测的染色体片段上密集地分布着多个QTL的情况下,随着模型中协同因子数目的增多,复合区间定位分析法检测出的QTL个数越多,对QTL位置、加性与显性回归效应的估计也越准确,但统计效力略微有所下降;当稀疏地分布着QTL的情况下,少量的协同因子数目对应的检测效果间还表现与密集地分布着多个QTL的情况相似的规律,但当协同因子数目增加到一定程度后,受需要吸收的剩余QTL效应的限制,检测效果趋于稳定。 同现有的方法相比,本文所提出的动态性状基因复合区间定位分析方法具有明显的优越性:1)因能够处理非平衡抽样资料而大大地方便了取样过程,也降低了取样成本;2)只要选择适宜阶数的Legendre多项式,就可以实现对任意动态性状变化规律的最佳拟和;3)能够同时分析除了遗传效应以外的各种系统环境因素对动态性状变化过程的影响;4)很容易推广到其他资源群体和复杂交配群体。 鉴于动态性状的广泛性及经济重要性,探索这类性状的基因定位分析方法,对丰富数量性状基因定位理论,加快其遗传改良速度具有极其重要的理论和实际意义。


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7 ;Quark Confinement and String Breaking from Lattice QCD[A];Physics of Glueballs and New Hadron States--Proceedings of CCAST (World Laboratory) Workshop[C];1999年
8 ;Markov Chain Monte Carlo (MCMC) and Sequential Monte Carlo (SMC)——Using The 2D-HP Example[A];2006“与统计有关的凝聚态物理中一些数值计算问题”研讨会论文集[C];2006年
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