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北极狐种群遗传多样性及主要生长性状相关基因的研究

张敏  
【摘要】: 品种资源是育种的物质基础。育种学家已经逐渐意识到,育种工作实质上是对品种资源的再加工。只有拥有丰富的品种资源,育种工作才能够拥有充分的选择余地,才能不断地选育出高品质、高产量和高适应能力的新品种、新品系,满足生产需要。北极狐作为一种重要的经济动物,在生产中培育出毛绒品质好、繁殖力高、生命力和适应性强的优良种群一直是人们所追求的目标。 本研究利用SRAP分子标记的方法对大兴安岭地区北极狐遗传信息进行综合分析,用于其种质资源的鉴定和评价工作,本实验也是首次在哺乳动物中引入SRAP分子标记的方法来分析大兴安岭地区的北极狐饲养群体的遗传多样性,共筛选出5对SRAP标记引物进行了分析,得到的结果如下: 1.利用em11-me6引物SRAP分析得出LGH群体和LYX群体之间的遗传相似系数最小,GDL和QD群体之间的遗传距离最小;体重等性状的Nei's遗传多样性指数和Shannon's Informationindex遗传信息指数是LI群体是最高,皮张等性壮Nei's遗传多样性指数和Shannon'sInformation index遗传信息指数是LGH群体最高的;em11-me6引物SRAP分析得出整个群体的总遗传多样性Ht=0.3770;种群内的遗传多样性Hs=0.1624;遗传分化系数Gst=0.3158:群体间的基因流动Nm*=2.5790。 2.利用em1-me1引物SRAP分析得出GDL群体和LI群体之间的遗传相似系数最小,AN和LYX群体之间的遗传距离最小;体重等性状Nei's遗传多样性指数和Shannon's Informationindex遗传信息指数LGH群体是最高,皮张等性状Nei's遗传多样性指数和Shannon'sInformation index遗传信息指数是TS群体最高的;em1-me1引物SRAP分析得出整个群体总遗传多样性Ht=0.3998;种群内的遗传多样性Hs=0.3116:遗传分化系数Gst=0.2206;群体间的基因流动Nm*=1.7663。 3.利用em11-me1引物SRAP分析得出QD群体和LYX群体之间的遗传相似系数最小是0.0003,LI和LYX群体之间的遗传距离最小是0.8883;体重等性状Nei's遗传多样性指数GDL群体是最高,Shannon's Information index遗传信息指数LGH群体是最高,皮张等性状的Nei's遗传多样性指数和Shannon's Information index遗传信息指数QD群体是最高;em11-me1引物SRAP分析得出整个群体的总遗传多样性Ht=0.2787:种群内的遗传多样性Hs=0.1637;遗传分化系数Gst=0.2331;群体间的基因流动Nm*=2.5534。 4.利用em2-me1引物SRAP分析得出TS群体和GDL群体之间的遗传相似系数最小是0.0712,LI和LYX群体之间的遗传距离最小;体重等性状Nei's遗传多样性指数LYX群体是最高,Shannon's Information index遗传信息指数是GDL群体最高,皮张等性状的Nei's遗传多样性指数和Shannon's Information index遗传信息指数LYX群体是最高:em2-me1引物SRAP分析得出整个群体总的遗传多样性Ht=0.4052;种群内的遗传多样性Hs= 0.2455;遗传分化系数Gst=0.3941;群体间的基因流动Nm*=0.7689。 5.利用em1-me2引物SRAP分析得出TS群体和LYX群体之间的遗传相似系数最小,LGH和LYX群体之间的遗传距离最小;体重等性状Nei's遗传多样性指数和Shannon's Informationindex遗传信息指数是LGH群体高,皮张等性状Nei's遗传多样性指数和Shannon'sInformation index遗传信息指数是LGH群最高;em1-me2引物SRAP分析得出整个群体的总遗传多样性Ht=0.3382;种群内的遗传多样性Hs=0.2571;遗传分化系数Gst=0.2398;群体间的基因流动Nm*=1.5847。 6.五对引物综合起来对群体的遗传信息进行分析的结果 把五对SRAP引物分析得到的遗传多样性指数综合在一起,应用SPSS 13.0进行了多重的比较分析得到对于体重等性状的Nei's多样性系数是GDL>LGH>LYX>LI,GDL群体最高的,显著的大于LI群(P=0.145)P<0.2。对于皮张等的性状的Nei's多样性系数TS>QD>LGH>LYX>AN,TS群体遗传多样性指数是最高的,显著的大于AN群体(P=0.167)P<0.2。说明GDL群体和TS群体内改良和选育的潜力较大,遗传多样性较明显,良种化的程度较高有很大的发展空间。 综合五对引物SRAP的分析得到群体总的遗传多样性是0.360;种群内的遗传多样性0.272;遗传分化系数Gst是0.236;基因流动是1.85。 本研究对于大兴安岭图强林业局狐场北极狐群体,利用测序分析方法,采用PCR-SSCP的方法检测了北极狐OB、OBR、HCRT、HCRTR1、HCRTR2、CETP这五个基因多态性,基因多态与生产性状的相关性得到如下的结论: 1.在北极狐的ob基因的第二外显子上发现了多态位点,该基因多态性位点与北极狐生产性状的相关性分析表明,OB基因是影响北极狐的体重、腹围、皮张长、针毛长的主效基因。 2.在北极狐的OBR基因的第四外显子上发现了一个多态的位点,该基因的多态性与北极狐的生产性状相关性分析表明,OBR基因是影响北极狐胴体重的主效基因或与其主效基因紧密的连锁。 3.在北极狐的HCRTR2基因的第七外显子上发现一个多态的位点,该基因多态性位点与生产性状的多重比较表明HCRTR2基因可能是影响北极狐体重、腹围、皮张的另一个主效的基因或与主效基因密切的连锁。 4.在北极狐HCRTR1基因的5‘侧翼序列上发现一个多态的位点,该基因的多态位点与北极狐的生产性状的相关分析表明,HCRTR1基因可能是影响体长和针毛长性状主效基因或与主效基因紧密的连锁。 5.在CETP基因的5‘侧翼序列检测出一个多态位点,AA基因型、BB基因型、AB基因型,经过多重比较其生产性能之间不存在显著性的差异。 6.不同位点合并基因型结果表明,OB基因和OBR基因的AB_((OB3))AA_((OBR4))合并基因型显著的有利于对体重性状的选择:AA_((OB3))AA_((OBR4))合并基因型显著的有利于对腹围性状的选择;BB_((ob3))BB_((OBR4))合并基因型显著的有利于个体针毛长性状的选择;AB_((ob3))AA_((OBR4))合并基因型显著的有利于个体皮张长性状的选择,OB和HCRTR1基因之间存在基因互作合并基因型有利于性状的选择,OBR和HCRTR1基因之间存在基因互作合并基因型有利于性状的选择,这两个合并的基因型的选择的效果均高于单个基因型的选择的效果,可以作为有利基因,但其合并基因型的选择效果不如OB基因和OBR基因合并基因型的选择的效果好。


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