收藏本站
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

应用组学方法研究孕妇血清中唐氏综合征标记物

康媛  
【摘要】:唐氏综合征(Down syndrome, DS)是一种最常见的伴有智力障碍的染色体疾病,新生儿中发病率约1/800-1/600,患者生存质量极低,造成家庭和社会沉重的负担。鉴于产前诊断多有创伤性,产前筛查对预防和减少此类出生缺陷至关重要。DS遗传机制可能是由于21号染色体某一区域50-100个基因共同作用。对DS发病有重要作用的基因包括SOD1、COL6A1、ETS2、CAF1A、CBS、DYRKA1、CRYA1、GART, IFNAR、APP、GLUR5、S100B、TAM、PFKL等。虽然DS确切的发病机制尚未明了,但上述基因的过表达所引起的广泛效应是DS的主要病因。因此,我们推测是否在胎儿发育阶段已经出现21号染色体基因过表达所导致的病理生理改变。基因表达的改变可造成一些重要的生化代谢不平衡,母胎作为一个整体,势必导致孕妇妊娠过程中血清中蛋白质和代谢产物发生改变,这些蛋白质和代谢物的改变可能对产前筛查唐氏综合征有帮助。 本实验拟应用蛋白质组学和代谢组学技术研究孕妇血清中唐氏综合征相关蛋白质和代谢物。具体包括以下几个方面:iTRAQ蛋白质组学技术分析妊娠DS孕妇和正常孕妇血清蛋白质组特点之间的类似性和差异性,质谱技术鉴定蛋白质,根据定量信息得到差异蛋白质。应用生物信息学方法建立差异蛋白相互作用网络,寻找DS发病相关通路和相关蛋白质。应用代谢组学技术分析妊娠DS孕妇和正常孕妇代谢谱之间的类似性和差异性,应用模式识别技术建立小分子代谢物产前筛查模型,为产前筛查提供新思路。 第一部分应用iTRAQ蛋白质组学方法鉴定孕妇血清中蛋白质 目的:分析妊娠DS孕妇和正常孕妇血清蛋白质组学的差异性,筛选两组间的差异蛋白质。 材料和方法:从复旦大学附属妇产科医院D筛查资料库中,选取18例妊娠14-19周DS患儿孕妇血清为DS组和18例妊娠14-19周健康孕妇血清为CON组,用iTRAQ蛋白质分离技术和液相色谱质谱鉴定技术分析两组的蛋白质,按两组之间比值定量信息以DS/CON≥1.40(上调)和DS/CON0.7(下调)为显著差异的标准,得到差异蛋白质。Western blot验证差异蛋白。利用Gofact、DAVID分析工具GO数据库对蛋白质的分子功能、生物学过程分类。 结果:DS组和CON组年龄分别为30.6±4.1岁和29.3±2.2岁,孕龄分别为16.6±1.3和16.6±1.2,差异均无统计学意义。鉴定出孕妇血清中86种蛋白的相对定量信息和31种差异蛋白,经Western blot验证VDBP在两组中差异有统计学意义。差异蛋白参与细胞过程占75.9%,生物调节占72.4%,代谢过程占69%,刺激应答占58.6%:差异蛋白中17个蛋白(54.8%)具有蛋白结合功能,转运功能12个(38.7%),酶调节功能有9个(29%)。其中16种蛋白在DS组上调,15种蛋白下调。 结论:iTRAQ蛋白分离和质谱鉴定技术成功鉴定了血清中差异蛋白质。 第二部分构建差异蛋白相互作用网络 目的:在母血中寻找与DS发病相关的信号通路和蛋白质,为发现产前筛查唐氏综合征标记物打下基础。 材料和方法:DAVID分析工具对差异蛋白功能聚类分析后,利用IPA软件分析主要功能聚类中蛋白质相互作用网络、DS发病相关基因(SOD1、COL6A1、ETS2、CAF1A、CBS、DYRKA1、CRYA1、GART、IFNAR、APP, GLUR5,S100B, TAM, PFKL)的相互作用网络和差异蛋白联合经典的血清学标记物(AFP、JCG、PAPP-A、INHA)分子相互作用网络。 结果:差异蛋白的功能聚类主要是脂质运输、酶调节功能、细胞分化发育、凋亡,分别参与脂代谢、心血管系统发育、神经系统发育网络,网络枢纽为ERK信号通路。差异蛋白与经典的血清学标记物共同参与细胞生长和增殖相互作用网络,枢纽为ERK信号通路。APOE、IGFBP3、AGT、KNG1、AFM是网络中的重要蛋白质。 结论:胎儿期ERK通路的改变可能是DS神经系统和心脏受累的病理生理机制,血清中APOE、IGFBP3、AGT、KNG1、AFM与ERK通路相关,可能是产前筛查候选分子。 第三部分应用代谢组学建立产前筛查唐氏综合征模型 目的:分析妊娠DS孕妇和正常孕妇血清代谢组学谱图的差异性,建立产前筛查诊断模型。 材料和方法:选取9例妊娠14-19周妊娠DS孕妇血清为DS组,44例14-19正常孕妇血清为CON组。采用毛细管液相色谱质谱分析两组代谢谱的差异性,应用PCA、PLS-DA分析代谢谱,应用SVM产前筛查模型,筛选出差异代谢物。 结果:PCA和PLS-DA分析病例组和对照组聚类在各自的区域,区分良好。应用SVM前10位代谢物建立模型为预测率为88.9%,假阳性率为2.3%,ROC曲线面积0.933。参与预测的离子是P127.2、P213.2、P115.1、P241.5、P214.2、P110、P131.1、N470.8、P143.2、P459.5。 结论:代谢组学方法建立的产前筛查模型准确率较经典产前筛查方法高,为产前筛查提供了新的思路。


知网文化
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前20条
1 鲍俊峰,曾品萍,邵瑛,杜金洁;孕妇血清标记物筛查唐氏综合征[J];齐齐哈尔医学院学报;2004年03期
2 郑明明;胡娅莉;;唐氏综合征的产前筛查及其进展[J];中国实用妇科与产科杂志;2006年05期
3 刘伟芬;;唐氏综合征(DS)产前筛查的研究[J];吉林医学;2008年05期
4 李光辉,黄醒华;孕妇血清标记物在产前诊断中的应用[J];中华妇产科杂志;1998年04期
5 赵晓岚,叶国玲,楚雍烈,刘琪,蔡晓宁;产前筛查和基因多态性位点在唐氏综合征产前诊断中的应用[J];中国优生与遗传杂志;2003年01期
6 张德峰;高健;余小平;王方娜;梅冰;戎立敏;李小玲;郭文潮;路璐;;化学发光和电化学发光免疫测定技术在孕妇妊娠中期血清筛查唐氏综合征的应用[J];中国优生与遗传杂志;2011年07期
7 姜虹,李大庆,周玉侠,孙萍,沈峰;应用孕妇血清标记物产前筛查胎儿唐氏综合征的初步报告[J];中国妇幼保健;2004年13期
8 袁丽萍,郭春华,苏向东,丁海明;孕中期母体血清标记物二联筛查的临床应用[J];临床医药实践杂志;2005年06期
9 韩茜;葛友;陈黎明;郑冬梅;贺彩军;杨雪松;;唐氏综合征孕中期产前筛查与产前诊断结果分析[J];中国优生与遗传杂志;2007年05期
10 戴志杰;付克勤;;妊娠中期孕妇血清AFP/hCG产前筛查试验[J];中国现代药物应用;2008年13期
11 魏新燕;陈忠领;刘建华;吴星莲;范美珍;;2458例孕中期孕妇胎儿唐氏综合征的筛查分析[J];实用医技杂志;2008年32期
12 李继慧;梁毅;;孕中期孕妇产前筛查3126例结果分析[J];中国优生与遗传杂志;2009年02期
13 王南飞;孙迪;张羽;于飞;;牡丹江地区4316例孕妇唐氏综合征产前筛查和产前诊断结果分析[J];中国优生与遗传杂志;2009年09期
14 赵建英;;PAPP-A在妊娠早期唐氏综合征筛查中的应用[J];齐齐哈尔医学院学报;2009年12期
15 钱源;肖雪;张兰;郭知;鲁玲;;孕中期产前7782例筛查结果分析[J];昆明医学院学报;2010年03期
16 林爱花,吴建民,蒋炜,李再华,叶娉婷;妊娠中期血清AFP与HCG产前筛查唐氏综合征的研究[J];中国妇幼保健;2000年04期
17 郭春华;544例孕中期非侵入性产前筛查的分析[J];临床医药实践杂志;2004年04期
18 刘晓红;产前诊断爱德华氏综合征及唐氏综合征各1例[J];中国妇产科临床杂志;2004年03期
19 龚波;李学华;;产前筛查及数据微机分析的临床意义[J];中国优生与遗传杂志;2008年05期
20 张亚萍;王晶;;产前筛查的临床意义及2例唐氏胎儿的报告[J];中国当代医药;2009年23期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 魏佳雪;宋淑本;廖灿;钟燕芳;;孕期母血清标志物筛查唐氏综合征[A];中国优生优育协会第三届学术研讨会专辑[C];2003年
2 齐宏文;周宗旗;伍家宜;石化金;唐落韵;谢和英;;胎教音乐对孕妇血清T_4、T_3变化的初步探讨[A];’96全国优生科学大会大会学术讲演与大会论文摘要汇编[C];1996年
3 徐航;王琳;侯林浦;马旭;;妊娠早期和妊娠中期联合筛查唐氏综合征的初步探讨[A];第五届全国优生科学大会论文汇编[C];2000年
4 申华;冯杏琳;;唐氏综合征121例分析(摘要)[A];中国优生科学协会2004年优生科学学术交流大会论文集[C];2004年
5 王华;雷骁;黄定梅;彭向京;周玉春;雷花香;;孕妇血清PAPP-A在产前筛查中的应用[A];中国优生优育协会第三届学术研讨会专辑[C];2003年
6 干灵红;戴美珍;伍荷芳;茅云霞;石卫武;;唐氏综合征孕中期产前筛查结果分析[A];第四届全国临床检验学术会议论文汇编[C];2006年
7 丁显平;周晓;王健;王君哲;任亚勤;;唐氏综合征及神经管畸形产前筛查、诊断的研究[A];第六届全国优生科学大会论文汇编[C];2006年
8 徐悦凡;;孕早期母血清筛查唐氏综合征的研究[A];第六届全国优生科学大会论文汇编[C];2006年
9 李响;;4074例三联标记DS筛查结果分析探讨[A];中华医学会第八次全国检验医学学术会议暨中华医学会检验分会成立30周年庆典大会资料汇编[C];2009年
10 魏祥松;魏霞;曾梅;丁显平;;唐氏综合征快速PRINS基因诊断方法的研究[A];中国优生科学协会2004年优生科学学术交流大会论文集[C];2004年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 康媛;应用组学方法研究孕妇血清中唐氏综合征标记物[D];复旦大学;2010年
2 王民;解整合素金属蛋白酶12在产前诊断唐氏综合征中应用的研究[D];浙江大学;2011年
3 杜颖颖;唐氏综合征无创性产前诊断及相关基因功能的研究[D];复旦大学;2010年
4 郭琦;中孕期非整倍体染色体异常血清学筛查不同方案的比较[D];中国协和医科大学;2008年
5 谢臻蔚;唐氏综合征血清学产前筛查方案优化的研究[D];浙江大学;2010年
6 陈振斌;唐氏综合征的基因诊断及其无创性产前基因诊断的初步研究[D];福建医科大学;2003年
7 刘娜;血片法中孕期唐氏综合症筛查的初步研究[D];中国协和医科大学;2009年
8 李军;唐氏综合征产前诊断策略的卫生经济学评价[D];复旦大学;2005年
9 胡娅莉;唐氏综合征产前快速诊断方法研究[D];南京医科大学;2006年
10 陈英耀;我国主要出生缺陷的疾病负担和预防措施的经济学评价研究[D];复旦大学;2006年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 顾而洲;我国唐氏综合征筛查效果评价[D];复旦大学;2010年
2 苗明珠;杂合型单核苷酸多态性定量焦测序分析技术在唐氏综合征快速产前诊断中的应用研究[D];南京医科大学;2011年
3 刘娟;唐氏综合征产前筛查及基因诊断的方法学研究[D];昆明医学院;2004年
4 王莹;孕早中期唐氏综合征筛查及297例介入产前诊断数据的分析[D];暨南大学;2010年
5 何薇;短串联重复序列检测在产前诊断唐氏综合征中的临床价值[D];暨南大学;2011年
6 俞冬熠;应用PCR-SSLP方法快速检测唐氏综合征的研究[D];青岛大学;2002年
7 黄星;产前筛查对不良妊娠结局的预测价值[D];暨南大学;2009年
8 龚颖萍;异位妊娠中妊娠相关血浆蛋白A水平的研究[D];中南大学;2006年
9 杨谷;荧光光谱分析鉴别SNP等位位点比例法产前诊断唐氏综合征方法的建立和应用[D];苏州大学;2010年
10 黄心宇;唐氏综合征产前筛查测试系统的研究与设计[D];福州大学;2004年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 上海市食品药品监管局稽查大队;唐氏综合征筛查诊断试剂的使用与规范[N];中国医药报;2006年
2 刘燕秋;解读唐氏综合征筛查[N];家庭医生报;2008年
3 记者 孙刚;政府埋单,筛查孕期唐氏综合征[N];解放日报;2009年
4 上海市新华医院上海市儿科医学研究所 陶炯 杨祖菁;力避唐氏综合征[N];联合时报;2009年
5 张化;早期诊断唐氏综合征胎儿[N];医药经济报;2003年
6 实习生 张梦然;唐氏综合征患者为Ets2基因正名[N];科技日报;2008年
7 曾文琼陈倩儿;专家提醒注意“唐氏妈妈”低龄化趋势及“唐氏宝宝”[N];中国中医药报;2008年
8 江 波 ;她为何担心生下“唐氏儿”[N];中国中医药报;2005年
9 刘静;抗氧化剂对唐氏综合征患儿没有帮助[N];中国医药报;2008年
10 胡德荣;唐氏综合征产前筛查系统问世[N];健康报;2004年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62982499
  • 010-62783978