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利用形态学标记和SSR分子标记分析茄子种质资源遗传多样性

韩洪强  
【摘要】: 茄子(Solanum melongena L.)是亚洲和非洲许多国家重要的蔬菜作物之一。茄子的遗传多样性分析工作对茄子种质资源的收集、保存、分类、鉴定以及育种都是非常必要的。本实验利用收集到的包括野生近缘种在内的126份茄子材料进行SSR分子标记和形态学标记以评价其种质资源的遗传多样性。 1.包括果实重量、果实直径、果实长度、果形等在内的12个性状用于形态学标记分析,利用DPS软件将126份茄子材料划分成两个类群,第一类群中仅包括130号材料,第二类群又可以分成6个簇。具有相同形态学性状的材料都归于相应的簇内。 2.利用正交设计的方法构建了茄子10μl体积SSR反应体系:Buffer为1μl,Mg2+为2.25mmol?L-1,dNTP为400μmol?L-1,上下游引物各为39.60ng,Taq聚合酶为0.75U,DNA约为100ng。PCR程序为94℃预变性2min;然后进行35个循环的94℃变性30s,52℃复性30s,72℃延伸45s;72℃延伸8min后4℃保存。9个等位基因。有效等位基因数为1.9405个,平均遗传多样性指数为0.748。 3.利用茄子基因组DNA从番茄的700对SSR引物中筛选出19对多态性引物。这些引物在茄子上扩增出105条特征条带,每对引物检测出的等位基因数在3~9之间,等位基因的平均数为4.8947个,其中SSR116引物产生最多的。 4.利用POPGENE软件对126份材料上SSR标记的数据进行统计分析,所有材料的相似系数跨度在0.54到0.99之间。用非加权平均数算法得到所有试验材料的亲缘关系聚类树。所有材料被聚类成两个类群,第一类群包括2份野生材料Solanum nigrum Linn (1)和S. torvum(130),第二类群又可分成包括7份半栽培种红茄的第一簇以及包括所有栽培种的第二簇。 5.通过比较形态学标记和SSR分子标记的聚类树,它们都得到了理想的实验结果,都可以用于茄子遗传多样性和亲缘关系的分析。根据茄属植物的分类作为依据,我们分析认为SSR标记更加精确可靠。所以我们通过实验证明了来自属间的SSR引物可用于遗传多样性研究的。


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