收藏本站
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

中国沼虾属分子系统学及日本沼虾群体遗传结构的研究

杨频  
【摘要】: 沼虾属Macrobrachium是一类生存环境多样,起源与分化过程尚不甚明了,分类地位具争议性的动物类群。众多学者在分类方面已做了大量的研究,然而由于其鉴别特征的保守性及形态性状多态性丰富等特点,导致了沼虾属种类鉴定的困难,使得相关研究难以深入。本研究以中国境内分布的沼虾属种类为主要研究对象,利用DNA测序、PCR-RFLP技术和ISSR技术等分子生物学实验手段,运用支序系统学与分子进化生物学理论及分析方法,以地理群体为基本研究单元,展开从地理种群-物种-属的逐级水平的系统学研究。探讨长臂虾亚科各属、沼虾属各种及日本沼虾不同地理群体的分子遗传学特征,并重建系统发育树。其次,在重建系统发育关系树的基础上,诠释现存的种、属分类问题。此外,本研究对揭示沼虾属种间的系统发育关系、澄清其种属分类问题、对整个沼虾属的系统演化与分类格局关系的研究具有重要意义。还可揭示主要经济种类日本沼虾地理群体之间的遗传多样性信息,为有效保护和合理开发利用野生资源提供重要的理论基础。 本研究主要从以下几个方面进行研究: 1.应用支序系统学的原理和方法,选取长臂虾亚科9属60物种和Procaridae科2物种(外群)的形态和生态性状。并对其分类学、系统学、形态学及部分生物学等方面的文献资料进行综合分析,进行形态学观察和系统发育研究。构建的严格一致树显示,(1)两个外群聚为一支,与内类群的物种分开,位于支序图的基部。内类群长臂虾亚科的60个物种由3个主要特征(即尾节常具2对末端刺,有2或更多对中央刚毛,第三颚足常具2关节鳃)构成一支,形成一个单系群。(2)沼虾属也形成一个单系群,由头胸甲具肝刺,无鳃甲刺支持与其它几个属区分开来。(3)其他几个属间的亲缘关系并不明确。说明Holthuis(1950)和Chace(1992)所建立的分类系统虽然能够将一些种类区分开来,但是无法反映出这些类群的亲缘关系。 2.利用线粒体16S rDNA部分序列对我国沼虾属的系统发育关系进行了探讨,使用PAUP软件构建NJ、MP、ML系统树,使用MrBayes3.0b4软件构建BI树。在忽略小于50%的支持率后,这四种系统树所显示的拓扑结构具有一定一致性,所有结果均支持沼虾属为单系群,但在几种沼虾的相互关系上有所区别。为了得到四种分析方法一致的沼虾属系统发育关系,我们构建了这四棵树的50%合一树,结果发现沼虾属可分为第二对步足左右不对称的类群和第二对步足左右对称的类群。另外,外形上极易混淆的三种沼虾(日本沼虾、胖掌沼虾和细螯沼虾)的分子数据显示其亲缘关系很近。 3.使用分子鉴别方法对我国代表地区的日本沼虾、细螯沼虾和胖掌沼虾进行分类研究。共使用了3种分子标记,即线粒体16S rDNA、COⅠ和D-loopPCR-RFLP。线粒体16S rDNA和CO I基因序列分析结果显示这三种沼虾之间的差异小于沼虾属不同种间的遗传差异,并与沼虾属同种不同群体间的遗传差异有重叠现象。D-loop PCR-RFLP的结果亦显示这三种沼虾间的遗传距离比罗氏沼虾与这三种沼虾间的距离小得多。三种分子数据构建的系统发育树也显示不同采集地点的日本沼虾、细螯沼虾和胖掌沼虾之间的亲缘关系很近。因此结合三种分子标记的结果推测这三种沼虾间的差异处于种内水平,它们可能是同一物种。 4.日本沼虾Macrobrachium nipponense是我国分布范围广、经济价值较大的一种重要淡水虾类。使用线粒体CO I基因片段与ISSR标记技术,对我国日本沼虾长江水系和澜沧江水系的10个野生群体的遗传结构进行分析,显示大致可分为长江上游及澜沧江族群、长江中游族群和长江下游族群。群体间存在遗传差异,且各群体间的遗传差异与其地理分布关系密切。两种分子标记的研究结果均显示湖北武汉群体的遗传多样性高,意味着该群体对外界环境变化的适应能力较强。遗传距离和聚类图显示浙江湖州(HZ)、江苏苏州(SZ)与上海(SH)群体的亲缘关系较近。从整个日本沼虾物种来说,存在较高的遗传多样性。线粒体COⅠ序列的研究结果相对于其他间接分子标记,能够直接揭示物种的遗传变异,但是相对耗时,花费较高。因此在无相关DNA序列信息的情况下,ISSR标记技术是一个非常有效的检测群体遗传变异的遗传标记。


知网文化
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前20条
1 蒋芳;赵婷;刘成君;卢涛;张和民;;兼性厌氧纤维素菌的分离与系统发育分析[J];微生物学通报;2006年03期
2 杨频;张浩;陈立侨;叶金云;禹娜;顾志敏;宋大祥;;利用COI基因序列分析长江与澜沧江水系日本沼虾群体的遗传结构(英文)[J];动物学研究;2007年02期
3 马克异;冯建彬;谢楠;冯晓宇;李家乐;;钱塘江日本沼虾野生群体遗传变异的SSR分析[J];动物学研究;2011年04期
4 徐晓红;吴敏;张会斌;刘志虎;;嗜盐古生菌br基因的遗传分析[J];遗传;2007年03期
5 吴琼;苑琳;路福平;申明华;刘纯燕;白宇辰;;高碱性纤维素酶产生菌的筛选及鉴定[J];生物技术通报;2010年09期
6 黄大林;袁桂峰;徐雅娟;骆耐香;陈建宏;刘菁;蒋莲秀;陈森洲;;具有抗菌活性红树林土壤放线菌BH0951的分离和鉴定[J];安徽农业科学;2010年19期
7 冯建彬;吴春林;马克异;丁怀宇;华雪铭;李家乐;;太湖日本沼虾野生群体遗传结构的微卫星分析[J];应用生态学报;2011年06期
8 周月慧;张苓花;王飞;永田进一;王运吉;;一株中度嗜盐菌SL21合成Ectoine的研究[J];河南工业大学学报(自然科学版);2006年02期
9 孙悦娜;冯建彬;李家乐;聂式忠;;日本沼虾三群体线粒体16S rRNA基因片段序列的差异与系统进化[J];动物学杂志;2007年01期
10 刘琳;刘洋;刘红娟;;基于16S rDNA的系统发育分析在微生物进化关系中的应用[J];生物学通报;2008年11期
11 范方玲;汪开毓;耿毅;黄小丽;陈德芳;;斑点叉尾(Ictalunes punctatus)源鲁氏耶尔森氏菌的分离鉴定及系统发育分析[J];海洋与湖沼;2010年06期
12 孟冬冬;王瑞明;马春玲;;一株1,3-丙二醇生产菌的分离鉴定及其发酵特性[J];微生物学通报;2011年06期
13 董秀英;谈奇坤;;巢湖日本沼虾的繁殖周期及其资源量估计[J];安徽师范大学学报(自然科学版);1987年02期
14 蔡雪峰,罗琳,朱继龙;日本沼虾眼柄结构的研究(简报)[J];西南农业大学学报;2000年02期
15 王春明;李大平;刘世贵;;4株多环芳烃降解菌的分离及鉴定[J];应用与环境生物学报;2007年04期
16 汪川;张朝武;陈会超;余倩;裴晓方;刘衡川;;两株耐酸耐胆盐人肠源菌株的鉴定及系统发育分析[J];四川大学学报(医学版);2008年02期
17 窦红霞;张彤晴;许志强;陈婵娟;张鑫;葛家春;黄亚红;;长臂虾亚科9个种系统发育关系的16S rDNA序列分析[J];淡水渔业;2008年01期
18 张迎春;阚丽娟;刘少佳;刘磊;杨秀萍;韩素贞;;西藏卡拉山土样中放线菌的多相分类研究[J];生物技术通报;2008年06期
19 葛菁萍;平文祥;高原;凌宏志;宋刚;;一株果胶酶产生菌HDYM-02的分离鉴定及系统发育分析[J];微生物学杂志;2008年06期
20 程虹;王晗;吴敏;季荣;;新疆意大利蝗不同地理种群16S rDNA序列差异研究[J];昆虫知识;2010年05期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 费晨;张海燕;钱永华;鲁兴萌;;一株家蚕肠球菌16SrDNA的研究[A];“蚕业生物技术与家蚕病害控制”高级研讨班、“家蚕生理、病理和生物技术”学术研讨会论文选集[C];2006年
2 程起群;张凊漪;;三种沼虾的COI基因序列变异及其分类地位探讨[A];北方遗传资源的保护与利用研讨会论文汇编[C];2010年
3 杨金权;阎雪岚;胡雪莲;唐文乔;;刀鲚群体的遗传结构及其种群历史[A];中国鱼类学会2008学术研讨会论文摘要汇编[C];2008年
4 马克异;冯建彬;李家乐;;钱塘江日本沼虾野生群体遗传变异的SSR分析[A];2010年中国水产学会学术年会论文摘要集[C];2011年
5 丁志丽;陈立侨;李二超;陈彦良;黎明;;不同脂肪源对日本沼虾非越冬期生长、存活及性腺发育的影响[A];渔业科技创新与发展方式转变——2011年中国水产学会学术年会论文摘要集[C];2011年
6 冯建彬;吴春林;姜虎成;李家乐;;江苏主要湖泊日本沼虾遗传多样性及系统进化分析[A];中国甲壳动物学会第十一届年会暨学术研讨会论文摘要集[C];2011年
7 蔡雪峰;罗琳;朱继龙;;日本沼虾X器官——窦腺复合体结构的研究[A];重庆市遗传学会第一届学术年会暨纪念孟德尔规律再发现100周年学术讨论会论文集[C];2000年
8 殷维;郭立;秦海明;何其欣;吴千红;李博;傅萃长;;中国近海大鳍弹涂鱼的遗传结构和末次盛冰期后的扩展[A];中国鱼类学会2008学术研讨会论文摘要汇编[C];2008年
9 牟希东;胡隐昌;李小慧;汪学杰;宋红梅;罗建仁;;应用微卫星多态分析美丽硬仆骨舌鱼三个品系遗传结构[A];经济发展方式转变与自主创新——第十二届中国科学技术协会年会(第三卷)[C];2010年
10 颜慧;丛宁;叶金明;姜增华;;杂交青虾“太湖1号”和日本沼虾抱卵量的比较研究[A];中国南方十六省(市、区)水产学会渔业学术论坛第二十六次学术交流大会论文集(上册)[C];2010年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 杨频;中国沼虾属分子系统学及日本沼虾群体遗传结构的研究[D];华东师范大学;2007年
2 张凤英;日本沼虾(Macrobrachium nipponense)卵子和胚胎发育相关基因的克隆与表达研究[D];华东师范大学;2011年
3 李媛媛;水杉的系统发育地位及恢复评价[D];华东师范大学;2006年
4 赵卫红;日本沼虾(Macrobrachium nipponense)卵黄蛋白原代谢相关基因的克隆和表达研究[D];华东师范大学;2011年
5 张海涛;海绵放线菌的分离和多样性研究[D];中国科学院研究生院(大连化学物理研究所);2006年
6 蔡继峰;苍蝇群落演替及MtDNA分子标记的法医学研究[D];四川大学;2005年
7 蔡大伟;古DNA与家养动物的起源研究[D];吉林大学;2007年
8 高诗珠;中国西北地区三个古代人群的线粒体DNA研究[D];吉林大学;2009年
9 盛岩;梭梭种群分子生态学研究[D];中国科学院研究生院(植物研究所);2003年
10 国伟;麦长管蚜地理种群时空动态的分子特征分析[D];中国农业大学;2005年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 费晨;家蚕肠球菌16S rDNA序列及生化特性分析[D];西北农林科技大学;2006年
2 李瀚声;日本沼虾太湖和鄱阳湖群体遗传育种研究[D];上海海洋大学;2011年
3 文晓萍;鸡毛松根瘤内生细菌的初步研究[D];广西大学;2008年
4 张国政;南海西部海域沉积物细菌多样性的初步研究[D];厦门大学;2009年
5 马明;产纳豆激酶菌株的分离筛选与鉴定[D];山东农业大学;2007年
6 付博;紫花苜蓿根际氢氧化细菌的分离鉴定及促生机制研究[D];西北大学;2009年
7 陶翠花;威海仿刺参野生种群遗传多样性分析[D];山东大学;2009年
8 马丽丽;发光杆菌NJ菌株发酵条件及对大豆胞囊线虫的作用研究[D];黑龙江八一农垦大学;2008年
9 张鑫;江苏地区野生及养殖日本沼虾(Macrobrachium nipponense)群体遗传特征及营养品质的初步研究[D];南京农业大学;2008年
10 王军花;鄱阳湖日本沼虾生物学与种质资源研究[D];南昌大学;2011年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 建新;日本沼虾的活体运输[N];河南科技报;2002年
2 记者 熊燕 禹江宁;我省获奖科学家载誉回昆[N];云南日报;2007年
3 胡德荣;黎族遗传结构是东亚现代人演化活化石[N];健康报;2008年
4 董映璧;全球变暖影响西伯利亚生态系统[N];科技日报;2004年
5 记者 李天舒;汉族人群遗传结构研究取得进展[N];健康报;2009年
6 姜澎;读懂“黎族基因”有助医学研究[N];文汇报;2008年
7 本报记者 李金金;基因揭秘:我们来自南方[N];北京科技报;2010年
8 本报记者 熊燕;保护民族特有遗传资源[N];云南日报;2006年
9 陈云芬;稻作遗传育种学科前沿难题攻克稻[N];云南日报;2008年
10 王雪飞;40项医卫成果获国家大奖[N];健康报;2008年
中国知网广告投放
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62982499
  • 010-62783978