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基于基因芯片数据初步分析绒毡层转录调控通路

张国强  
【摘要】: 花粉的正常形成,在植物的生殖过程中起重要的作用,花粉的正常发育,既取决于配子自身的分子与细胞功能,也依赖于花药特别是绒毡层细胞的供给支持。模式植物拟南芥绒毡层的发育过程由一系列复杂的基因调控网络所控制,基因调控网络及特定基因与其它基因的调控关系对于发育分子机理深入研究具有重要的意义。由于绒毡层在花粉发育过程中的重要作用,目前已经有5个与绒毡层发育相关转录因子其的功能被报道。本实验室的前期工作确定了这5个转录因子的上下游关系。但是DYT1、TDF1、AMS、AtMYB103四个转录因子怎样调控绒毡层发育,调控绒毡层发育的哪几个生物过程,目前尚不清楚。 本研究以拟南芥突变体dytl,tdfl, ams, ms188的花序为材料进行生物芯片分析,产生高通量的实验数据。选取芯片信号值(突变体/野生型)0.5的基因作为下调基因,根据GO和Mapman数据库的信息将不同突变体背景的下调基因逐一进行功能分类。经过分类分析,下调基因,主要可以分为五个功能类:蛋白质降解、RNA转录调控、细胞壁合成降解、激酶受体和肽运输。 绒毡层发育与功能的转录调控通路中,我们发现DYT1单独调控次级代谢,TDF1调控细胞活动,AMS和AtMYB103共同调控脂代谢。DYT1、TDF1、AMS、AtMYB103转录因子共同调控的绒毡层发育过程是影响蛋白质代谢、RNA调控、细胞壁降解、信号激酶受体、肽的运输这五个功能模块。


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