收藏本站
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

蚜虫中sid-1基因的克隆与进化分析

徐维娜  
【摘要】: Sid-1基因的编码蛋白是系统性RNAi通路中发挥重要作用的跨膜蛋白,目前sid基因的研究较少,搜索不同生物基因组中的sid-1基因,已在细菌、线虫、昆虫、鱼和哺乳动物等十多种生物中发现了sid-1基因的相似序列,但并非所有这些动物均具有sid-1类似基因。本研究对已进行基因组测序的哺乳动物进行基因组搜索,结果在牛、猩猩、大鼠和人类的基因组中均发现了1-3个sid-1基因的相似序列,而在羊、猪、猫的基因组序列中却未发现sid-1基因的同源序列。在昆虫中,已报道蜜蜂、家蚕、赤拟谷盗和美洲沙蝗都有1-3个sid-1基因的相似序列,而果蝇、冈比亚按蚊基因组中缺少sid-1同源序列。 本文根据已有sid-1同源基因的保守氨基酸序列,设计简并引物,对棉蚜、麦长管蚜、禾谷缢管蚜、桃蚜等进行sid-1基因的克隆,最终分别从棉蚜、禾谷缢管蚜和麦长管蚜中克隆获得了sid-1同源基因(GenBank登录号为EF533711、EF533712、EF533713),其碱基序列相似性为90%-98%,推导的氨基酸序列同源性为96%-99%。进一步采用RACE技术成功扩增了棉蚜同源基因的全长,其氨基酸序列与预测的家蚕sid-1基因的相似性为38%-42%,与蜜蜂为44%,与赤拟谷盗为32%-44%,与美洲沙蝗sid-1基因片段为53%,与线虫仅为25%,但其拓扑学结构非常相似,表明克隆的是目标基因。该结果首次证实了同翅目昆虫体内具有sid-1同源基因。 结合已报道的sid-1基因,建立了不同生物sid-1基因的亲缘树。从建立的sid-1基因亲缘树来看,该基因的分布广泛,从细菌到哺乳动物都有,且不同生物体内sid-1的同源性与生物的亲缘关系和进化地位明显相关。这说明sid-1是进化上较原始的一类基因,各种生物体内应该普遍存在。另一方面,从不同类型生物sid-1同源基因的相似性来看,其相似性均较低,细菌、线虫、昆虫和脊椎动物之间的相似性均不超过30%,也说明这些基因具有很长的独立进化史。 另外,从本研究克隆的3种蚜虫的sid-1同源基因的相似性来看,它们的相似度极高(96%-99%),这说明该基因在蚜虫体内承担着重要功能,并承受着巨大的选择压力。由此可以推测,一些缺少sid-1同源基因的生物,可能进化了其他补偿途径,这些都有待进一步研究证实。


知网文化
【相似文献】
中国硕士学位论文全文数据库 前1条
1 许亚龙;昆虫OBP CSP和sid-1基因的预测及序列分析[D];南京农业大学;2010年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62982499
  • 010-62783978