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房间隔缺损患者心肌组织基因表达谱特征的研究

钱玲梅  
【摘要】: 目的 探讨先天性心脏病房间隔缺损患者心房肌组织与正常人心房肌组织基因表达谱的差异,初步分析Ⅱ孔型房间隔缺损患者心房肌组织基因表达谱的特征。方法 提取Ⅱ孔型房间隔缺损患者及正常人心房肌组织mRNA,标记cDNA探针,分别与含有18000条人类基因片段的cDNA微矩阵(cDNA microarray)芯片杂交,对二者差异表达基因进行生物信息学分析。结果 (1)获得表达差异2倍以上基因数1056个,其中3倍以上264个、5倍以上46个;(2)1056个基因差异表达基因中,EST片段130个、功能未知蛋白或假设蛋白248个、已知功能的独立基因(Unigene)678个;(3)差异表达基因以发育相关、代谢相关、分化相关基因为主,同时还涉及信号转导、转录调节、细胞骨架、离子通道、细胞凋亡、蛋白翻译合成、免疫等不同功能的基因群。结论 Ⅱ孔型房间隔缺损患者心肌组织的基因表达谱存在Wnt信号途径发育不良、细胞外基质信号增强而细胞内信号传导较弱、细胞周期调控异常、胎儿转录程序(fetal transcription program)启动、能量需求较高、细胞骨架紊乱和心肌收缩力降低、心肌细胞凋亡倾向、蛋白合成增加与细胞保护蛋白增多、抗病毒免疫力下降的基因表达趋势,以及Nkx2.5下游基因表达异常、多个差异表达基因集中定位染色体17p13/19p13.1-13.3/19q13.1-13.4/21q22.2-21q22.3/6p21.3区域等特征。


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