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核基因c-mos在系统发生研究中的应用与中华绒螯蟹BAC文库的构建

景开颜  
【摘要】: 本论文共分两大部分,分别摘要如下。 1 核基因c-mos在系统发生研究中的应用 可用于重建系统发生关系的分子标记需满足一些条件。常用的有线粒体DNA序列和一些核基因序列。C-mos是一种单拷贝、无内元的核基因,全长约1kb,便于从基因组中扩增并测序,可度量中等分类阶元的亲缘关系,目前主要应用于爬行类和鸟类的系统发生研究中。 本论文首先探讨了c-mos分别在蜥蜴亚目、新蛇下目及羊膜动物高级阶元系统发生研究中的应用。在所得蜥蜴亚目的聚类结果中,美洲鬣蜥科、夜蜥科、石龙子科、蜥蜴科、壁虎科、睑虎科、鳞脚虎科均为单系。鬣蜥科是避役科的姐妹群,盾蜥科与环尾蜥科紧密关联,鳄蜥与巨蜥相聚。支持蚓蜥类应归于石龙子型类,不支持鳄蜥类的科级分类地位,提示鳄蜥类可能是亚科级分类阶元。新蛇下目聚类结果提示蝰科、眼镜蛇科和蟒科都是单系群。游蛇科与眼镜蛇科亲缘关系较近;蝰科是游蛇科和眼镜蛇科的姐妹群。对水蛇亚科的分类地位提出疑问,支持水蛇类的科级分类地位。在用c-mos重建的羊膜动物高级阶元系统发生树中,哺乳类、龟类、鸟类、有鳞类均为单系群,哺乳类与其它羊膜类是姐妹群,有鳞类处于爬行动物系统发生的基部。建议在进行系统发生分析时,应采用不同方法构树并分析比较。 此外,本文还运用生物信息学手段,检索美丽线虫基因纽全序列,推导出了对应于人类MOS蛋白的同源氨基酸序列,并对其结构和进化进行了初步分析。 2 中华绒螯蟹BAC文库的构建 基因组文库可依据载体不同而产生大小相异的插入片段,小到质粒几个Kb,大到YAC几个Mb。随着人类基因组计划的完成,大片段基因组文库的重要性日益突出,其所用载体包括YAC、BAC和PAC。其中,BAC/PAC以其克隆效率高、操作简易、插入DNA片段大、保存稳定等特性,成为目前构建大片段基因组文库的首选。 中华绒螯蟹是我国重要的经济蟹类之一,但目前对其的研究大多数仍以形态学性状为基础。为了配合本实验室对中华绒螯蟹在分子水平的研究,作者尝试了中华绒螯蟹的BAC文库的构建。由于该实验涉及仪器、试剂众多,需要建立有关的实验技术,直至论文完成之际,文库尚未全部完成。


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