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扬子鳄种群遗传多样性及几种鳄的分子系统学关系研究

朱伟铨  
【摘要】: 扩增片段长度多态性技术(AFLP)是基于选择性扩增完全酶切消化后的基因组DNA片段。该技术的运用不需要预知基因组的序列特征,具有较高的多态分辨力,可适用于任何来源和各种复杂度的DNAs。AFLP技术被广泛地运用到动物分子生物学的研究中。 扬子鳄是一濒危物种,也是中国特有的珍稀爬行动物。本文利用AFLP技术研究了宣州饲养种群(Changxing Subpopulmion,XZSP)和长兴饲养种群(Xuanzhou Subpopulation,CXSP)种群间和种群内的遗传多样性。研究结果表明宣州种群和长兴种群有相同的起源。由于瓶颈效应和有效种群小,使得该物种种群遗传多样性贫乏。在饲养种群的人工选择交配中应增加C9904,XF_19915和XF_19933个体与其他鳄进行交配的机会。 来自宣州种群和长兴种群的39个个体的线粒体DNA控制区5’端非重复序列没有任何差异。大量的遗传多样性在种群所经历的瓶颈作用中失去,线粒体单元型并没有随着饲养种群数的增长而增加。两个饲养种群不能够被定义为两个独立的进化显著性单元(ESUs),应从整体上保护两者的遗传多样性。扬子鳄、密西西比鳄(Alligator mississippinensis)和凯门鳄(Caiman crocodilus)的线粒体DNA控制区全序列和控制区3’端串联重复序列的比较中,扬子鳄和密西西比鳄间的遗传差异最小。 百年来关于扬子鳄的分类地位存在着很多争议,本文利用测得的扬子鳄(Alligator sinensis)、暹罗鳄(Crocodlylus siamensis)和湾鳄(Crocodylus porosus)的mtDNA ND4和Cytb基因序列,以及从GenBank中获得密西西比鳄、凯门鳄和海龟(Chelonia mydas)的ND4基因和Cytb基因相应片段,构建以海龟为外群的系统进化树。结果显示:在鳄类动物中,扬子鳄与密西西比鳄的亲缘关系最近。


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