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中华绒螯蟹卵巢发育相关基因的研究

马长艳  
【摘要】: 第一部分 中华绒螯蟹卵巢发育相关基因的筛选 1 中华绒螯蟹卵巢差减cDNA文库的构建 应用抑制性差减杂交技术,构建了中华绒螯蟹卵巢两个发育时期的差减cDNA文库。其中以Ⅲ期卵巢为试验方(tester),Ⅱ期卵巢为驱动方(driver)进行正向差减杂交;以Ⅱ期卵巢为试验方,Ⅲ期卵巢为驱动方进行反向差减杂交。分别将所获差减cDNA片段插入质粒表达载体(PinPoint Xa-1 T-Vector),转化大肠杆菌JM109。最后所获正向差减文库含863个重组子,反向差减文库含360个重组子。PCR扩增鉴定正、反向差减cDNA文库的插入片段平均大小分别为360bp和160bp,表明所构建的差减文库适合进一步研究中华绒螯蟹卵巢发育相关基因。 2 用cDNA微阵列筛选中华绒螯蟹卵巢发育相关基因 将差减cDNA文库中的所有克隆用碱裂解法提取质粒,然后以提取的质粒为模板,用PCR方法扩增插入片段。PCR产物经浓缩、变性处理后,用自动点样仪点制于尼龙膜载体上,制成cDNA微阵列。分别将中华绒螯蟹Ⅱ期和Ⅲ期卵巢的mRNA反转录标记成~(33)P探针,然后将2种探针分别与2张相同的膜杂交,经洗膜、压片和放射自显影后进行信号的扫描和分析。结果共获得2倍以上差异表达克隆167个。其中Ⅲ期高表达克隆104个,Ⅱ期高表达克隆63个。 3 中华绒螯蟹卵巢发育相关基因cDNA片段的序列测定 从cDNA微阵列筛选的差异表达克隆中选取部分克隆进行测序。结果正向差减文库中获得7个独立的EST。同源性分析结果表明,这些EST皆为新的EST,已被dbEST收录,检索号分别为:CA591892、CA591893、CA591894、CA591895、CA591896、CA591897和CA591898。 南京师范大学博士研究生毕业论文 第二部分 中华绒螫蟹卵巢发育相关基因全长叨*A的克隆及序列分析 工 中华绒蟹蟹卵巢RA*kC**A文库的构建 为了获得差异表达基因的全长CDNA序列,运用SMART技术,构建了中 华绒蟹蟹卵巢(ill期)RACE CDNA文库。琼脂糖凝胶电泳结果表明,文库所 含全长 CDNA的长度主要集中在 500~2 000 hp之间,RACE PCR结果表明,所 用基因特异性引物与接头引物皆能扩增出产物,说明构建的文库质量较好,适 于用RACE方法从中分离中华绒螫蟹卵巢发育相关基因的全长。DNA。 二中华绒螫蟹卵巢发育相关基因E*0且的全长CO*A克隆和序列分析 根据SSH结合CDNA微阵列技术获得的EST004*bEST检索号:CA591895) 的序列设计引物,分别用 5’RACE和 3RACE的方法获得了 EJO基因的全长 cDNA序列。同时用生物信息学的方法对 EJO基因的结构和功能进行了初步分 析;用RTPCR的方法对该基因的表达谱进行了研究;用NOrtheffi印迹分析的 方法对该基因在*期和*期卵巢的表达差异性进行了进一步验证。结果表明获 得的EJOI基因的CDNA长度为876 hp,开放阅读框长度为759 hp,编码252 个氨基酸。由氨基酸序列推断的 EJO基因编码蛋白的等电点为 6.18,分子量为 28.18 kDa石wissProt数据库中未发现与 EJOI基因编码蛋白有意义的匹配序列。 新基因 EJO编码的蛋白可能为分泌蛋白,前 17个氨基酸为信号肽。EJO基因 在中华绒赘蟹的心脏、肠和卵巢中皆有表达,而在肌肉和肝胰腺中未见表达。 Northern印迹分析结果表明EJOI基因在m期卵巢高表达。EJOI基因的GenBank 检索号为:AY185917。 3中华城螫蟹卵巢发育相关基因EJ 03的全长0*A克隆和序列分析 根据SSH结合CDNA微阵列技术获得的EST003(dbEST检索号:CA591894) 的序列设计引物,用5’RACE和3’RACE的方法获得了EJO3基因的全长cDNA 序列。同时用生物信息学的方法对EJO3基因的结构和功能进行了初步分析;用 RTPCR的方法对该基因的表达谱进行了研究;用N。them印迹分析的方法对该 基因在*期和皿期卵巢的表达差异性进行了进一步验证。结果表明获得的EJO3 基因的 CDNA长度为 1514 hp,开放阅读框长度为 1368 hp,编码 456个氨基酸。 由氨基酸序列推断的 EJO3基因编码蛋白的等电点为 5.79,分子量为 50刀0 ica。 SwissProt数据库中未发现与EJO3基因编码蛋白有显著性意义的匹配序列。新 基因EJO3编码的蛋白可能为分泌蛋白,前20个氨基酸为信号肽。EJO3基因主 要存在2个转录本,其中较大的转录本除了在中华绒资蟹卵巢中表达外,在肠 3 南京师范大学博士研究生毕业论文 中也有弱表达,而在心脏、肌肉和肝胰腺中未见表达;较小的转录本在所研究 的组织中皆有表达。此外,在肌肉组织中除了存在较小的转录本外,还有2个 较弱的转录本。Nonilern印迹分析结果表明EJO3基因在*期卵巢高表达。EJO3 基因的GenBank检索号为:AY185919。


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