收藏本站
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

扬子鳄种群微卫星DNA多态与mtVNTR研究

黄磊  
【摘要】:本文主要从微卫星DNA和mtVNTR两个方面对扬子鳄(Alligator sinensis)种群进行了研究。 1 微卫星分子标记技术及其在濒危动物遗传保护研究中的应用 微卫星DNA是广泛分布于真核生物基因组中的短串连重复序列,具有突变速率快,多态性高、共显性标记、孟氏遗传、选择中性等特点,是一种极具应用价值的遗传标记。本章简述微卫星分子标记的基本原理、研究方法、主要特点与技术发展,并介绍了微卫星分子标记在濒危动物遗传保护研究中的应用。 2 扬子鳄种群的微卫星DNA多态及其遗传多样性保护对策分析应用微卫星DNA分子标记对扬子鳄野生群、宣州F_1代及F_2代饲养群共39个个体进行研究,分析结果显示:扬子鳄种群在微卫星水平表现出很低的遗传多样性,平均等位基因数A=2.38、平均有效等位基因数N_e=1.60、平均观察杂合度H_o=0.374、平均期望杂合度H_e=0.350、平均多态信息含量PIC=0.327,3个群体间A、N_e、H_o、H_e、PIC及各微卫星座位等位基因频率分布无显著差异,但F_2代饲养群在Ami-μ-6和Ami-μ-222两个位点表现出极显著的遗传不平衡。扬子鳄种群遗传多样性水平极低主要是近几十年来种群数量大幅减少所致,现阶段应将全部现存的扬子鳄作为一个整体加以保护,在建立新的繁殖群体时,应考虑保存物种遗传多样性所必需的有效种群大小,在种群的遗传管理上应注重低频等位基因的筛查和保护。 3 扬子鳄mtDNA控制区多态与异质性分析 由于近几十年来严重的种群衰退,扬子鳄在已进行的多种分子标记研究中均表现出极低的多样性,但在对扬子鳄mtDNA控制区3’端研究中我们发现,串连重复序列区段表现出较丰富的片段长度多态,48个个体中共发现12种长度的单元型片段和21种扩增片段表型,其中12个个体稳定检测到2~4条扩增片段,呈现明显的异质性。mtVNTR表现 中文摘要 出较丰富的长度多态,可能是经历严重瓶颈效应后,现存扬子鳄饲养种群在不同 层次的多样性恢复水平存在较大差异,同时与其特殊的重复序列组成可能也有很 大关系,而在部分个体中检测到的异质性现象提示动物mtDNA的复制与遗传机 制可能较为复杂,异质性现象的确切起因仍有待进一步研究。 4应用SSR与mtvNTR分子标记进行扬子鳄个体识别研究为有效避免扬 子鳄种群的种质衰退,最大限度的保持现有的遗传多样性,有必要对现有种群进 行个体识别,筛查稀有等位基因及其携带个体。我们应用SSR与mtVNTR两种 分子标记对扬子鳄39个个体进行了个体识别研究,结果显示8个SSR座位的累 计个体识别率与累计父权排除率分别达0.9968、0.7697;mtVNTR的个体识别率 为0.9146,联合SSR与mtVNTR两种分子标记的累计个体识别率理论值达 0.9997,并在实际分析中将所研究扬子鳄39个个体完全区分开,其区分能力较 扬子鳄已用RAPD、AFLP及mtDNA序列分析等标一记强,并可对某些低频等位 基因及其携带个体作有效筛查,对于日后进行扬子鳄的个体识别,及后续遗传谱 系建立、核心种质确定等工作将具有一定实际意义。 5扬子鳄分子遗传学与遗传多样性研究现状扬子鳄作为中国特有的珍稀 物种,其遗传资源的保护受到广泛关注和重视。本章对近年来有关扬子鳄在分子 系统学、遗传多样性与种群遗传结构、线粒体基因组、个体识别以及性别决定方 面的分子遗传学研究进展进行了综述。


知网文化
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前20条
1 鲁双庆,刘臻,刘红玉,肖调义,苏建明;鲫鱼4群体基因组DNA遗传多样性及亲缘关系的微卫星分析[J];中国水产科学;2005年04期
2 于冬梅;马海涛;孙效文;;三个虹鳟养殖群体遗传结构的微卫星分析[J];动物学杂志;2007年04期
3 杨凤影;杨爱国;刘志鸿;周丽青;毛连菊;;人工诱导栉孔扇贝雌核发育后代的微卫星标记分析[J];水生生物学报;2008年05期
4 王家祺;郭丰;丁少雄;王军;;斜带石斑鱼不同地理群体遗传变异的微卫星分析[J];海洋科学;2009年11期
5 许丽梅;刘丑生;张利平;王志刚;韩旭;李晓霞;常爽;;山羊群体遗传多样性的微卫星分析[J];生物工程学报;2010年05期
6 王晓清;王志勇;柳小春;谢芳靖;刘家富;;大黄鱼人工诱导雌核发育后代的微卫星标记分析[J];遗传;2006年07期
7 赵莹莹;朱晓琛;孙效文;;虹鳟6个养殖群体遗传多样性的微卫星分析[J];遗传;2006年08期
8 邱凡;苏永全;傅蒙娜;王军;丁少雄;;太平洋蓝鳍金枪鱼野生群体遗传多样性的初步研究[J];厦门大学学报(自然科学版);2008年04期
9 聂鸿涛;李琪;于瑞海;;刺参雌核发育二倍体的诱导及其早期生长发育[J];中国海洋大学学报(自然科学版);2011年09期
10 张俊娥;;苹果EST中微卫星分析[J];广西农业生物科学;2008年04期
11 景润春,何予卿,黄青阳,朱英国;水稻野败型细胞质雄性不育恢复基因座位的微卫星分析[J];云南大学学报(自然科学版);1999年S3期
12 ;生物多样性第16卷总目录[J];生物多样性;2008年06期
13 李莉;王翀;陈瑶生;;DHPLC系统工作原理及其应用[J];生物技术通报;2006年S1期
14 杨存义,陈芳远,王应祥,范小威,袁清华;粳稻品种秋光空间诱变突变体的微卫星分析[J];西北植物学报;2003年09期
15 杨燕,马月辉,吕慎金,张英汉;中国7个地方绵羊品种遗传多样性的微卫星分析[J];生物多样性;2004年06期
16 张天时,王清印,刘萍,李健,孔杰;中国对虾(Fenneropenaeus chinensis)人工选育群体不同世代的微卫星分析[J];海洋与湖沼;2005年01期
17 王希龙,欧江涛,黄礼光,郭春华,钟金城,李小成,王峰,郑心力;海南五指山猪遗传多样性的微卫星分析[J];生物多样性;2005年01期
18 王建民;岳文斌;;黄河下游家绵羊与家山羊遗传关系的微卫星分析[J];生物多样性;2008年01期
19 廖信军;常洪;张桂香;王冬蕾;宋卫涛;韩旭;张自富;;中国5个地方牦牛品种遗传多样性的微卫星分析[J];生物多样性;2008年02期
20 孙红梅;邢秀梅;荣敏;丛波;;家兔遗传多样性及系统发生关系的微卫星分析[J];生物多样性;2008年05期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 李仁燕;慧文巧;彭强;杜鑫立;木叶沙尔;贾斌;;新疆3个马鹿亚种遗传多样性和系统发生关系的微卫星分析[A];第十二次全国畜禽遗传标记研讨会论文集[C];2010年
2 林小云;张桂玲;王展林;吴宁;张志红;田鑫江;黎中宝;;拟穴青蟹群体遗传多样性的微卫星分析[A];中国甲壳动物学会第十一届年会暨学术研讨会论文摘要集[C];2011年
3 李兴明;周红;赵宗胜;李岩;向春和;梁杜;廖和荣;;新疆地方斗鸡遗传多态性的微卫星分析[A];中国动物遗传育种研究进展——第十五次全国动物遗传育种学术讨论会论文集[C];2009年
4 高悦勉;郭晋;;魁蚶遗传多样性的微卫星分析[A];2010年中国水产学会学术年会论文摘要集[C];2011年
5 杜联明;张修月;李玉芝;岳碧松;;全基因组微卫星位点搜索软件M-DNA的开发[A];四川省动物学会第九次会员代表大会暨第十届学术研讨会论文集[C];2011年
6 章学东;祝荣;朱启;朱文奇;楼立峰;蔡和平;王初昌;蒋伟华;;淳安花猪遗传背景的微卫星分析[A];中国动物遗传育种研究进展——第十五次全国动物遗传育种学术讨论会论文集[C];2009年
7 汤存伟;黄锡霞;程黎明;;新疆13个绵羊群体遗传多样性及遗传分化的微卫星分析[A];中国动物遗传育种研究进展——第十五次全国动物遗传育种学术讨论会论文集[C];2009年
8 廖小林;俞小牧;谭德清;童金苟;;利用微卫星分析长江水系草鱼遗传多样性[A];湖北省生物工程学会2004年年会学术报告及论文摘要汇编[C];2004年
9 张洁;张之晟;赵俊;;复合鲫及其亲本遗传多样性的微卫星分析[A];中国海洋湖沼动物学会鱼类学分会第七届会员代表大会暨朱元鼎教授诞辰110周年庆学术研讨会学术论文摘要集[C];2006年
10 马洪雨;崔海玉;马春艳;马凌波;蒋科技;张凤英;宋炜;马群群;;利用微卫星和线粒体标记分析海南岛拟穴青蟹遗传多样性[A];2010年中国水产学会学术年会论文摘要集[C];2011年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 张国彦;东方粘虫微卫星富集文库的构建与遗传标记筛选[D];南京农业大学;2009年
2 孙荆涛;二斑叶螨与灰飞虱的微卫星开发及种群遗传结构研究[D];南京农业大学;2012年
3 聂鸿涛;两种经济贝类和刺参微卫星—着丝粒作图及与遗传图谱的整合[D];中国海洋大学;2012年
4 高建伟;应用微卫星DNA标记对延边圈养黑熊进行亲子鉴定和遗传多样性研究[D];延边大学;2012年
5 张建军;中国人膀胱癌分子遗传学异常及其在诊断中的应用[D];中国协和医科大学;2002年
6 陈磊;基于分子标记的刺苦草在长江中下游湖泊的种群动态与维持研究[D];中国科学院研究生院(武汉植物园);2007年
7 游翠红;两种小型鱼类的某些基因组特征研究[D];中国科学院研究生院(水生生物研究所);2007年
8 高立志;中国部分稻种资源基于水稻遗传图谱的微卫星多态性分析[D];中国农业科学院;1999年
9 韦力;日本伏翼(Pipistrellus abramus)微卫星位点的筛选及其种群遗传结构特征[D];华东师范大学;2010年
10 王明玲;养殖皱纹盘鲍杂交种对土著群体遗传结构的影响及种间渐渗杂交的遗传分析[D];中国海洋大学;2011年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 张宁;褶皱臂尾轮虫微卫星标记开发[D];中国海洋大学;2013年
2 李惠鑫;东北虎8个微卫星等位基因结构及群体遗传学分析[D];东北林业大学;2013年
3 吴胜军;四种羽色蛋用鹌鹑微卫星遗传多样性分析[D];河南科技大学;2010年
4 胡彩霞;肉瘤类金鱼群体遗传关系的微卫星分析[D];上海海洋大学;2012年
5 衣帅;猫微卫星DNA标记遗传检测方法的建立及对虎皮猫群体遗传结构的分析[D];吉林大学;2013年
6 臧云鹏;仿刺参微卫星DNA标记的筛选与应用及性别差异研究初探[D];上海海洋大学;2011年
7 任昆;草鱼亲子亲子关系的微卫星鉴定[D];上海海洋大学;2013年
8 朱晓宇;脊尾白虾微卫星分离及其遗传多样性分析[D];浙江大学;2010年
9 Diallo Amadou;塞内加尔尼洛罗非鱼遗传多样性的微卫星分析[D];宁波大学;2011年
10 程占军;蒙古犬品系结构及品种起源的初步研究[D];南京农业大学;2011年
中国重要报纸全文数据库 前1条
1 本报记者 岳莉;中国喜获首批成年体细胞克隆牛群体[N];中国高新技术产业导报;2002年
中国知网广告投放
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62982499
  • 010-62783978