ISSR分子标记揭示黑斑侧褶蛙中国种群的遗传结构和遗传多样性

【摘要】：第一章: 介绍ISSR分子标记的原理特点及其在遗传学研究中的应用。 第二章: 用ISSR分子标记探讨了中国大陆黑斑侧褶蛙(Pelophylax nigromaculata)的遗传多样性及其种群遗传结构。我们在25条ISSR引物中筛选了10条扩增稳定、条带清晰、多态性高的引物。一共获得127条清晰条带,其中103条具有多态性,多态带百分率(PPB)达81.10%。在种群水平上,平均期望杂合度(He)、Shannon指数(I)和多态带百分率分别为0.1518、0.2233和38.67%;在物种水平上,平均期望杂合度(He)、Shannon指数(I)和多态带百分率(PPB)分别为0.2664、0.4000和81.10%。从分析结果中我们发现中部和东部地区的种群内条带多态性比较高,而南北两端以及西南边缘地区的种群的条带多态性一般比较低。 在UPMGA系统发生树上我们发现系统树由两大分支组成,即由大陆支系(A)和东北支系(B)组成。并且,在A支系内部又出现了两个支系,即东部支系A1和西南支系A2。东部支系A1分布在东部平原及北部的广大地区而西南支系A2分布在西南的高原地区。各种群间的遗传距离(Fst)在0.15181-0.77390之间,平均遗传距离是0.50086。A、B支系种群间的遗传距离一般都比较大,几乎都高出平均遗传距离;而A、B各支系内部种群间的遗传距离普遍要比A、B两支系间的要低,这说明了A、B两大支系间存在较深的遗传分化。此外,我们还发现东辽种群内存在A、B两个支系的个体,并且检测到这两大支系的个体间存在基因交流。我们认为该地区处于A、B支系重新建群时发生二次接触的地带上。