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接枝亲和配基的聚乙烯醇凝胶与组织型纤溶酶原激活剂的相互作用

金昊白  
【摘要】:组织型纤溶酶原激活剂t-PA属于胰蛋白酶类,它是纤溶系统中一种重要的丝氨酸蛋白酶,能使纤溶酶原转化为纤溶酶,纤溶酶催化纤维蛋白溶解及其他细胞外的蛋白水解。这样t-PA可用于治疗一些突发的心脏和颅内动脉损伤。我们用分子动力学模拟的方法设计能与t-PA相作用的水凝胶胶团,旨在设计出可纯化t-PA的新的生物材料。 论文主要由以下三个部分组成: 第一章,论述了本论文的研究背景与意义,并对本论文研究工作的国内外研究现状作了综述。 第二章,介绍了本论文所采用的研究方法:分子动力学模拟。 第三章,从原子尺度上揭示了蛋白质t-PA在与接枝有来自四肽QDES的配基的水凝胶的吸附-脱附机理。研究发现蛋白质t-PA的S1袋状结构所在平面的确非常具有亲和性。来自四肽QDES的三种配基:氨基-NH3+(带正电)、羧基-COO-(带负电)、羟基-OH(电中性),均与t-PA存在相互作用。当水凝胶上的配基是带电基团时(氨基、羧基),相互作用能将十分显著,且整个作用面中往往同时存在几组不同的吸附残基,因此蛋白质的脱附是一个逐步的过程,可能同时存在多个决定速率步骤,相互作用能的降低往往呈阶梯状分布;如果配基是中性基团(羟基),相互作用能将十分有限。由此还可以判断这些所选用配基对t-PA亲和能力的大小。


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