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荷斯坦奶牛炎症相关基因多态性及其与DHI生产性能的关联分析

朱小云  
【摘要】:奶牛乳房炎是奶牛常见的一种疾病,对奶牛生产影响极大,会导致奶源产量和质量下降,进而影响养殖场收益,同时还会危害消费者的身体健康。而药物的使用不仅影响牛奶品质,也会导致细菌产生耐药性,因此需要通过对抗病基因的研究来降低奶牛乳房炎的发病率,降低奶牛饲养的经济成本,提高奶牛的生产性能。本试验通过对牛群炎症相关基因的SNP研究及其与奶牛牛群改良(DHI)生产性能的关联分析,在基因水平上寻求有效的奶牛分子标记位点,为降低牛群乳房炎发病率奠定基础。本研究以某牛场645头荷斯坦奶牛血液DNA为研究材料,用直接测序法、PCR-RFLP法、SSCP法对调控奶牛乳房炎相关的候选基因白细胞介素8(IL-8)、趋化因子受体1(CXCR1)、趋化因子受体2(CXCR2)、Toll样受体2(TLR2)和Toll样受体4(TLR4)的基因多态性(SNP)进行检测,计算SNP位点的遗传参数,并用SPSS22.0软件进行SNP位点与奶牛生产性能的的关联分析。结果如下:IL-8研究发现g.202 CT、g.264 CT、g 1892 AC、g.1939 GA、g.2103 CT、g.2209 TG、g.2222 GA这7个连锁突变SNP位点。以g.202 CT位点进行关联分析,发现CC型的305天产奶量和乳蛋白率显著高于TC型和TT型(P0.05);CXCR1研究发现g.295 CT、g.337 TC、g.341 GA、g.369 TC、g.646 GA、g.652 GT、g.739 CG、g.823 GA这8个SNP位点。对测序结果分析后,g.646 GA和g.823 GA位点进行关联分析,发现g.646 GA位点AA型的305天乳脂量、产奶量、乳蛋白量和乳蛋白率极显著高于AG型和GG型(P0.01);g.823 GA位点AG型的305天产奶量和乳蛋白量极显著高于GG型(P0.01),AG型的305天乳脂量显著高于GG型(P0.05)。CXCR2研究发现g.13783 GA、g.13895.GA、g.14444 AG和g.14476 TC这4个突变位点。对其进行关联分析后,g.13783 GA、g.14444 AG和g.14476 TC位点进行关联分析,发现g.13783 GA位点GG型的305天乳脂量、产奶量和乳蛋白量极显著高于AG型(P0.01),而AG型的乳蛋白率极显著高于GG型(P0.01);g.14444AG位点AG型的305天产奶量和乳蛋白量极显著高于GG型(P0.01),AG型的305天乳脂量显著高于GG型(P0.05);g.14476 TC位点TT型的305天乳脂量、产奶量和乳蛋白量极显著高于TC型(P0.01),而TC型的乳蛋白率极显著高于TT型(P0.01)。TLR2研究发现g.10508 GA这1个突变位点。对其进行关联分析,发现AA型的乳脂率显著高于AG和GG(P0.05),AA型和AG型乳蛋白率显著高于GG型(P0.05)。TLR4研究发现g.245 GC、g.5987 AG和g.9422 CT这3个突变位点。对其进行关联分析,发现g.245 GC位点CC型的乳脂率极显著高于GC型和GG型(P0.01),GC型的乳脂率极显著高于GG型(P0.01)。g.5987 AG位点AA型和AG型的体细胞数极显著高于GG型(P0.01)。g.9422 CT位点CC型和CT型的305天产奶量显著高于TT型(P0.05);TT型的乳脂率极显著高于CC型和CT型(P0.01)。通过对IL-8、CXCR1、CXCR2、TLR2和TLR4基因多态性的检测及其与DHI生产性能关联分析,检测到突变位点有10个:IL-8基因的g.202 CT位点、CXCR1基因的g.646 GA和g.823 GA位点、CXCR2基因的g.13783 GA、g.14444 AG和g.14476 TC位点、TLR2基因的g.10508 GA位点、TLR4基因的g.245 GC、g.5987AG和g.9422 CT位点。其中新发现的可用于分子标记位点来选育抗乳房炎的奶牛的位点有3个:IL-8基因的g.202 CT位点、CXCR2基因的g.14476 TC位点和TLR4基因的g.245 GC位点。


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