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中国汉族人银屑病易感位点的精细定位

孙良丹  
【摘要】: 背景银屑病(psoriasis,OMIM #177900)是一种以红斑、鳞屑为主要表现的慢性炎症性皮肤病,人群中患病率约为0.1-5%,汉族人群发病率约为0.123%,中国目前银屑病患者已超过350万。银屑病的发病机制尚未明确,多认为是一种遗传性自身免疫性皮肤病,由遗传、免疫及环境因素共同作用所致。2002年,本研究小组对61个汉族人寻常型银屑病家系全基因组扫时证实了染色体6p21.3上易感基因位点PSORS1,同时发现一个新的易感位点4q31(PSORS9)及提示连锁位点2p、9q、13q。2003年国内Zheng等在38个中国汉族人寻常型银屑病家系中研究发现染色体17q25(PSORS2)与汉族人银屑病相连锁,但该位点在我们最初的全基因组扫描中并没有被提示。目的完善汉族人银屑病易感位点定位研究,确认染色体2p13、9q33、13q22、17q25上是否存在汉族人银屑病的易感位点,进而缩小易感区域,为易感区域内银屑病易感基因的克隆奠定基础。 方法通过增大家系样本量,加密遗传标记的方法对染色体2p22-11、9q33-34、13q21-32、17q22-25上的易感区域进行精细定位研究。以ABI3730和GeneMapper(4.0 Version)自动基因分型和分型数据初步处理;用LINKAGE软件进行数据转换,以GENEHUNTER软件(2.0 Version)对基因分型结果进行参数和非参数连锁分析,并结合Lander和Kruglyak标准(p0.000022)确定有效易感区域。 结果1. 9q33-34: 160个家系的多点非参数连锁分析显示在D9S1682与D9S164之间NPL值均大于3,在D9S1881-D9S290之间获得最大的多点NPL值4.64(p=0.0000003)。多点参数连锁分析表明在D9S1881- D9S164之间HLOD值均大于3,D9S1881- D9S290之间获得最大HLOD值5.03 (α=46%)。新增加的99个家系在D9S1682-D9S1847之间NPL值均大于3,在D9S1881- D9S290区域内获得最大的多点NPL值3.67(p=0.000003),多点参数连锁分析表明D9S1682-D9S1847约12cM的遗传距离之间HLOD值均大于3,同时在该区域内获得最大的多点参数连锁分析HLOD值4.49(α=64%)。130个早发型家系在D9S1682-D9S1847之间NPL值均大于4,在D9S1881- D9S290区域内获得最大的多点NPL值4.69(p=0.0000001) ,在D9S1881- D9S290之间获得最大的多点HLOD值6.48(α=58%)。 2. 2p22-11: 180个家系的多点非参数连锁分析显示在D2S391-D2S2109之间NPL值均大于3,在D2S2153-D2S2368之间约10cM的遗传距离内获得最大的多点NPL值4.11(p=0.000003),多点参数连锁分析表明在D2S391-D2S2368之间HLOD值均大于3,在D2S2153-D2S337区域内获得最大HLOD值4.93(α=54%),新增加的119个家系在D2S2259-D2S337之间多点非参数连锁分析显示NPL值均大于3,在D2S2153-D2S337区域内获得最大的多点NPL值3.60(p=0.00001),多点参数连锁分析表明在D2S2259-D2S2368之间HLOD值均大于3,在D2S2153-D2S337区域内获得最大HLOD值4.87(α=78%)。 3. 13q21-32和17q22-25: 180个家系和新增的119个家系的多点非参数及参数连锁分析没有获得这两个位点的提示连锁的证据。180个家系的多点连锁分析在D13S1315处获得最大的多点HLOD值0.10(α=7%),最大的多点NPL值0.95 (p=0.14),在D17S802处获得最大的多点HLOD值0.08 (α=6%),最大的多点NPL值0.94(p=0.14)。180个家系和新增的119个家系的多点参数LOD值均小于全扫时61个家系的连锁值。 结论1.染色体2p22-11和9q33-34为中国汉族人银屑病特别是早发型银屑病的易感位点,并进一步缩小染色体上易感区域,为确定区域内易感基因奠定了基础。2.染色体13q21-32和17q22-25不是汉族人银屑病的易感位点。


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