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厦门西海域超微型真核浮游生物遗传多样性研究

鲍磊  
【摘要】: 本论文利用总DNA提取、PCR扩增、变性梯度凝胶电泳(DGGE)以及克隆测序等分子技术,建立了一套较为完整的适合环境样品中超微型真核浮游生物群落遗传多样性研究、基于小亚基核糖体RNA(SSU rRNA)基因研究的指纹图谱分析方法? PCR-DGGE方法。对厦门西海域四个代表性测站的周年月份的超微型真核浮游生物的类群组成和多样性时空变化进行了初步研究,同时探讨了超微型真核浮游生物群落遗传结构与环境因子之间的联系,取得如下主要结果: 1.厦门西海域超微型真核浮游生物多样性丰富,获得的序列主要包括绿藻(Chlorophyta)、定鞭金藻(Haptophyta)、Stramenopiles、海洋Alveolates以及未确定类群(unidentified groups)等。其中,绿藻、Novel Stramenopiles、海洋Alveolates以及未确定类群在超微型真核浮游生物群落中分布较广、含量较高,在群落结构变动等方面扮演着重要的角色。 2.厦门西海域周年环境样品的超微型真核浮游生物群落遗传结构具有一定程度的季节分布特征,其中23号测站群落结构的季节分布特征最为明显。主要表现为,温度较高和较低月份的环境样品分别存在较为相似的群落结构;存在着可以作为相应测站高低温月份指示的OTUs(可操作分类单位)。 3.厦门西海域超微型真核浮游生物群落遗传结构之间的空间差异表现为,不同测站的群落结构的内部稳定性存在着很大的不同,其中26号测站季节样品的超微型真核浮游生物群落内部稳定性较好,多样性结构最为相似,27号测站季度样品群落结构的内部稳定性最差;18号测站和23号测站样品的季度性群落多样性结构比较相似,与其它两个测站的群落结构存在一定的差异;在厦门西海域样品中,不同测站群落内部存在着特殊的OTUs来指示多样性组成。 4.温度、盐度、磷和氮营养盐等环境因子对不同的OTUs的分布以及相对含量产生一定的影响,这些环境因子影响着厦门西海域超微型真核浮游生物群落结构的变化,其中温度可能是较为重要的影响因子。


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