收藏本站
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

中巴蜻蜓分布和遗传多样性及其相关单链DNA病毒鉴定

Saif Ul Islam  
【摘要】:蜻蜓目昆虫由6000多个种组成,广泛分布于世界各地,俗称蜻蜓或豆娘。蜻蜓(目)以蚊子等小型昆虫为食。已有研究表明在特定环境下释放蜻蜓若虫可以起到生物防治的作用。另外,最近有研究者从蜻蜓中分离出几十种环状单链DNA(ssDNA)病毒。提出,作为一个顶级昆虫捕食者,蜻蜓是一种昆虫ssDNA病毒的富集“机器”。因其进化上的多样性、生态型和表型的可塑性以及生命周期的复杂性,蜻蜓正在吸引越来越多研究者的目光。不过,目前关于蜻蜓的分子水平的研究还是较少。在本研究中,我们从2014到2017年在中国中部、南部以及巴基斯坦的西南部采集了大量的蜻蜓。然后,我们通过COI基因测序对这些蜻蜓进行了分子鉴定,并以滚环扩增技术从采自福州的蜻蜓中富集和鉴定了 ssDNA病毒。对所得COI序列,我们以BioEdit v6中的Clustal-W进行比对,通过邻接法进行系统发育树构建;用MEGA7通过Kimura2参数计算遗传距离,并以DnaSPv5计算遗传多样性。此外,我们还分析了核苷酸错配分布以确认所有序列的遗传多样性。对ssDNA病毒序列,我们也以类似方法进行了分析。序列分析表明,我们从中国中部(武汉)和巴基斯坦(5个地点)采集了 67个不同种的蜻蜓,它们可以归为15个不同的属,两个不同的科(Gomphidae和Libellulidae)。在种的水平上,猩红蜻蜓(Crocothemis servi/iai)遗传多样性最高,为24.96%,Libellulidae sp.次之,为 22.30%。遗传多样性最小的为 Melligomphus ardens(0.82%)。总体来讲,我们所获得的序列一共有341个突变位点。其中,猩红蜻蜓突变位点最多,为176个。Libellulidae sp.次之,为 150个。而 Melligomphus ardens仅有 3 个突变位点。一个意外的发现是,尽管所有的中国猩红蜻蜓都采自武汉这一个城市,而巴基斯坦的猩红蜻蜓采自相距超过500公里的多个地点,在猩红蜻蜓的遗传多样性上,中国明显高于巴基斯坦。对采自中国南部的蜻蜓,我们获得了 61条COI序列。分析表明,这些蜻蜓可以归为16个不同的种,分属于11个不同的属和3个不同的科(Aeshnidae,Gomphidae and Libellulidae)。赤蜻属(Trithemis)遗传多样性最高(18.69%),灰蜻属(Ortetrum)次之(18.16%),而多样性最低的为黄蜻属(Pantala,0.31%)。从赤蜻属和灰蜻属序列中,我们分别发现了 142和126个突变位点,而从黄蜻属序列中我们仅发现了 2个突变位点。总的来讲,我们共从三个科的蜻蜓中发现404个突变位点,其中,从Libellulidae中发现了 344个。此外,序列分析表明,我们从中国南部采集的蜻蜓(目)中,还有10个豆娘种,分属于7个不同的属,4个不同的科。在属的水平上,鼻蟌属(Rhinocypha)遗传多样性最高(9.31%),Hetaerina 次之(8.23%),而黄蟌属(Ceriagrion)和异痣蟌属(Ischnura)遗传多样性较低,分别在0.32%和0.48%。我们分别从Hetaerina和鼻蟌属发现了 181和68个突变位点,而从黄蟌属和异痣蟌属,我们仅分别发现了 2个和6个突变位点。从科的水平讲,4个不同的科之间具有显著差异,这种差异的显著性可以通过Tajima's D和Fu's Fs两种检测。我们从福州的蜻蜓中发现了 3种cycloviruses,分别将其命名为蜻蜓相关Cyclovirus-9-11(DfCyV-9,-10,-11)。这三种Cycloviruses在全基因组水平上的同源率在61.6-65.1%,而它们与已正式确立的Cycloviruses间的同源率在56.1-79.6%。根据cycloviruses的分类标准,DfCyV-9,-10和11自代表一个cyclovirus新种。值得指出的是,D,CyV-10所编码的Rep蛋白与蝙蝠相关cyclovirus 2(BatACyV-2,一个来自于中国的cyclovirus)的Rep高度同源,其氨基酸水平的相似性为79.4%,然而,DfCyV-10所编码的Cp蛋白却与BatACyV-10(一个来自于巴西的cyclovirus)的Cp蛋白高度同源,其氨基酸水平的相似性为71.7%。尽管研究者已对蜻蜓(目)有了较多的研究,但对世界上的很多地区来讲,关于蜻蜓的分子水平的数据还是空白。本研究以分子生物学手段从中国和巴基斯坦鉴定到30多个蜻蜓种,揭示了这两个国家蜻蜓的遗传多样性。另外,本研究还从中国福州的蜻蜓分离到3个cyclovirus新种。这些数据将为进一步研究和认识蜻蜓以及它们所携带的ssDNA病毒奠定坚实的基础。


知网文化
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前20条
1 蒋楠;;作物遗传多样性的保护和持续利用[J];德阳教育学院学报;2003年02期
2 张铧予;;人类遗传多样性探讨[J];科技风;2018年33期
3 ;遗传多样性影响人类思维[J];中国石油企业;2015年08期
4 ;“全国生物遗传多样性高峰论坛”将在昆明召开[J];生物化学与生物物理进展;2012年09期
5 褚嘉祐;李绍武;张亚平;;努力推动中国的遗传多样性研究[J];遗传;2012年11期
6 杨昭庆;禇嘉祐;;中国人类遗传多样性研究进展[J];遗传;2012年11期
7 谭玉莲;刘迎辉;熊丽娜;朱智;徐伟;曾波;;不同海拔高度的野古草的遗传多样性分析[J];西南师范大学学报(自然科学版);2009年02期
8 ;商业养殖减少了鸡的遗传多样性[J];北方牧业;2008年21期
9 梁琛;张建海;;畜禽遗传多样性的保护和分子评估[J];中国家禽;2005年14期
10 林炜,刁丽娟;RAPD技术及其在动物遗传多样性分析中的应用[J];生物学通报;2002年03期
11 胡守荣,夏铭,郭长英,陆晓春;林木遗传多样性研究方法概况[J];东北林业大学学报;2001年03期
12 李钧敏,边才苗;RAPD技术在生物遗传多样性研究中的应用[J];生物学通报;2001年12期
13 ;《遗传多样性研究的原理与方法》评介[J];动物学研究;2000年02期
14 徐崇荣;牦牛品种及遗传多样性利用[J];畜禽业;1998年05期
15 夏铭;遗传多样性研究进展[J];生态学杂志;1999年03期
16 孙超,杜森有,龙火生;家畜遗传多样性及其检测方法[J];黄牛杂志;1999年03期
17 朱列层,唐国顺,HAZEN S P,KIM H S,WARD R W;用RFLP方法研究陕西省主要小麦品种遗传多样性及其演变[J];西北植物学报;1999年02期
18 钟金城,陈智华;牦牛遗传多样性的研究[J];云南大学学报(自然科学版);1999年S3期
19 张继全;遗传多样性的保护与动物改良[J];国外畜牧科技;1994年06期
20 施立明;;遗传多样性及其保存[J];生物科学信息;1990年04期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 刘公社;徐夙侠;刘志鹏;舒庆艳;;羊草种质资源遗传多样性的形态和AFLP分子标记评价[A];中国草学会牧草育种专业委员会2007年学术研讨会论文集[C];2007年
2 ;“全国生物遗传多样性高峰论坛”日程安排[A];全国生物遗传多样性高峰论坛会刊[C];2012年
3 沙伟;林琳;郑云梅;;小仙鹤藓遗传多样性分析[A];中国植物学会七十五周年年会论文摘要汇编(1933-2008)[C];2008年
4 刘延吉;耿书;;辽宁地区5种野生软枣猕猴桃RAPD遗传多样性分析[A];中国园艺学会猕猴桃分会第四届研讨会论文摘要集[C];2010年
5 张子学;杨冬梅;李杰勤;;白头翁RAPD体系的优化及其遗传多样性分析[A];全国作物生物技术与诱变技术学术研讨会论文摘要集[C];2005年
6 芒来;杨虹;;蒙古马遗传多样性研究进展[A];遗传学进步与人口健康高峰论坛论文集[C];2007年
7 顾万春;;森林遗传多样性及其资源的保存和利用[A];面向21世纪的中国林木遗传育种——中国林学会林木遗传育种第四届年会文集[C];1997年
8 毛培胜;王新国;黄莺;;分子标记技术在牧草遗传多样性研究中的应用[A];2009中国草原发展论坛论文集[C];2009年
9 周秋白;郑宇;周莉;桂建芳;;鄱阳湖鲫鱼遗传多样性分析[A];中国鱼类学会2008学术研讨会论文摘要汇编[C];2008年
10 杨昭庆;褚嘉祐;;中国人类遗传多样性研究进展[A];全国生物遗传多样性高峰论坛会刊[C];2012年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 汪焕;扬子鳄饲养种群交配体系及对种群遗传多样性的影响[D];安徽师范大学;2018年
2 Saif Ul Islam;中巴蜻蜓分布和遗传多样性及其相关单链DNA病毒鉴定[D];福建农林大学;2018年
3 孔杰;海岛棉遗传多样性及对纤维性状的关联分析与转录组学分析[D];中国农业大学;2018年
4 余惠文;柚遗传多样性及叶片渐绿性状突变研究[D];华中农业大学;2018年
5 李琦;麦田雀麦生物生态学特性与遗传多样性研究[D];山东农业大学;2017年
6 解庆;柴松分类地位与遗传多样性研究[D];西北农林科技大学;2015年
7 尹淑英;紫花苜蓿的种子功能性状及SSR分子标记的遗传多样性[D];兰州大学;2018年
8 任海龙;金花菜的遗传多样性及连锁图谱构建[D];扬州大学;2017年
9 杨建敏;中国沿海脉红螺Papana Venosa遗传多样性研究[D];中国海洋大学;2004年
10 何余堂;白菜型油菜的遗传多样性及特殊种质资源的研究[D];华中农业大学;2004年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 赵娜;上海地区重引入獐(Hydropotes inermis)遗传管理研究[D];华东师范大学;2018年
2 吴敏;蒙古高原特有植物蒙古莸的ISSR遗传多样性研究[D];内蒙古农业大学;2018年
3 张向前;古尔班通古特沙漠荒漠肉苁蓉及其对应寄主梭梭遗传多样性和营养成分的研究[D];石河子大学;2018年
4 王丹;用农艺性状和分子标记评估引入小麦资源的遗传多样性[D];西北农林科技大学;2018年
5 臧珊;甘蓝型油菜三系骨干亲本的遗传多样性分析[D];西北农林科技大学;2018年
6 逄鹏;[D];内蒙古农业大学;2018年
7 孟繁霜;糜子遗传多样性与栽培起源研究[D];吉林大学;2018年
8 翟立娟;牡丹革质花盘亚组野生种遗传多样性及演化关系研究[D];西北农林科技大学;2018年
9 徐瑶;黄帝陵古侧柏群遗传多样性及群体结构研究[D];西北农林科技大学;2018年
10 王帅;北部湾革囊星虫属资源初探及遗传多样性分析[D];广西大学;2018年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 记者 张梦然;两种主要传疟蚊子遗传多样性公布[N];科技日报;2017年
2 记者 胡德荣;亚洲人群遗传多样性研究获最新成果[N];健康报;2009年
3 胡云章;绚丽的民族文化 丰富的遗传多样性[N];大众科技报;2008年
4 本报记者 游雪晴;中国的人类遗传多样性研究成果丰硕[N];科技日报;2001年
5 记者 华凌;遗传多样性影响人类身高和思维[N];科技日报;2015年
6 卞晨光;保护家畜遗传多样性刻不容缓[N];中国畜牧兽医报;2012年
7 通威;加强鳜种改良 提高遗传多样性水平[N];中国渔业报;2015年
8 肖力伟 译;中国栽培的大豆品种 遗传多样性变异丰富[N];农民日报;2011年
9 复旦大学教授 中国科学院院士 金力;流动的基因[N];光明日报;2014年
10 记者 齐芳;肿瘤细胞遗传多样性远大于预期[N];光明日报;2015年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62982499
  • 010-62783978