收藏本站
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

植物化感作用代谢途径模拟预测系统的构建与应用

潘志宏  
【摘要】: 生物信息学是当今比较重要和前沿的科学发展领域之一,被广泛用于生物研究的各个方面,特别是应用生物信息学的研究方法来研究植物化感作用代谢途径受到了国内外同行的关注。本文通过构建化感作用代谢途径预测系统,应用生物信息学方法对未知序列进行比对,从而实现对该序列功能与代谢途径的预测.主要结果总结如下: 1、应用改进型Smith-Waterman动态规划算法为核心构建化感作用代谢途径模拟系统。并选用Java语言作为整个系统的开发环境,配合MySql数据库使之在各个平台上具有移植性与良好的交互性。 2、根据与化感作用密切相关的酚酸类代谢途径以及萜类代谢途径上的数据,通过NCBI上的基因序列号查询并运用站内网页爬行技术搜集其相关的cDNA序列以及氨基酸序列进行初始数据库的建立以及数据的自动录入。 3、运用本文所建立的化感作用代谢途径预测系统来研究植物化感作用方面的可行性与实用性,主要是进行基因序列比对并分析比对的结果。 4、最后结合相关文献提出使序列匹配更为智能化的解决方案,主要包括在空间、时间和蛋白质的三维结构上提出自己的改进设想和今后研究的方向。


知网文化
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前20条
1 彭琦;朱莉;宋福平;张杰;高继国;黄大昉;;苏云金芽胞杆菌HD-73菌株sigL基因突变体的特性分析[J];微生物学报;2008年09期
2 郭星军;苟萍;;真菌鞘脂代谢及其与抗真菌药物关系研究进展[J];生物技术;2010年02期
3 史家樑;平石明;北村博;;光合细菌Rhodobacter sphaeroides的醋酸代谢[J];华东师范大学学报(自然科学版);1989年03期
4 李靖;马长乐;;植物脂氧合酶研究进展[J];生物学杂志;2007年06期
5 贾会勇;田佳;李杰;;代谢关键酶基因作为转基因植物选择标记的研究进展[J];中国生物工程杂志;2008年03期
6 章晶晓;陈东之;成卓韦;陈建孟;;PM1菌降解甲基叔丁基醚的代谢途径[J];中国环境科学;2008年09期
7 杨双龙;龚明;;一氧化氮对玉米幼苗体内脯氨酸积累及其代谢途径的影响[J];植物生理学通讯;2009年08期
8 吕莹果;张晖;王立;郭晓娜;孟祥勇;;植物中γ-氨基丁酸的代谢和功能[J];中国食品添加剂;2010年01期
9 文继新,钱江宁;物质代谢的教学难点及教学体会[J];生物学杂志;1999年05期
10 骆迎峰,陈跃磊;核开关:一个新的基因调控元件,一类潜在的药物靶点[J];生物化学与生物物理进展;2004年08期
11 周盛;李家洲;武波;;通过改变代谢途径选育谷氨酸生产菌株[J];氨基酸和生物资源;2005年04期
12 黄金霞;王亮生;李晓梅;鲁迎青;;花色变异的分子基础与进化模式研究进展[J];植物学通报;2006年04期
13 石宁宁;徐虹;姚俊;王军;;利用~(13)C标记葡萄糖分析γ-聚谷氨酸的代谢途径[J];过程工程学报;2007年01期
14 金凌;柳华贵;钟卫鸿;;烟草源茄尼醇的生物分离制备及转化应用进展[J];科技通报;2007年04期
15 刘蓉;刘军万;;生物信息学中途径研究进展[J];生物技术通报;2008年01期
16 丁德武;丁彦蕊;蔡宇杰;陈守文;须文波;;Pathway Hunter Tool在代谢途径分析中的应用[J];计算机与应用化学;2008年01期
17 朱玥明;张峻;邢来君;李明春;;海藻糖合酶的分子生物学研究进展[J];微生物学报;2009年01期
18 王俊姝;祁庆生;;合成生物学与代谢工程[J];生物工程学报;2009年09期
19 丁德武;陆克中;须文波;方康年;;代谢途径分析研究进展及其应用[J];计算机工程与应用;2009年33期
20 刘增俊;滕应;骆永明;李振高;;噬氨副球菌HPD-2对苯并[a]芘的降解特性及代谢途径初探[J];土壤;2010年04期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 左宝玉;姜桂珍;张泉;陈家瑞;;CO_2浓度倍增对不同代谢途径植物超微结构的效应[A];西部大开发 科教先行与可持续发展——中国科协2000年学术年会文集[C];2000年
2 沈杰;张怡;;犬尿氨酸代谢途径与高血压的相关性研究[A];第六届江浙沪儿科学术会议暨儿科学基础与临床研究进展学术班论文汇编[C];2009年
3 赖力;郝海平;王广基;刘乙潼;;人参皂苷Rh1体内外代谢途径研究[A];中国药理学会第九次全国会员代表大会暨全国药理学术会议论文集[C];2007年
4 司红彬;曾振灵;刘迎春;贺利民;丁焕中;杨帆;;乙酰甲喹在猪体内的代谢研究[A];第九届全国药物和化学异物代谢学术会议论文集[C];2009年
5 侯嵘;陈轶渊;金元杰;林娟;;麻疯树八氢番茄红素合成酶基因JcPSY的克隆及分析[A];中国遗传学会第八次代表大会暨学术讨论会论文摘要汇编(2004-2008)[C];2008年
6 梁宇和;余雅梅;王晓君;董宇辉;苏晓东;;枯草杆菌组氨酸降解代谢途径相关酶蛋白的结构生物学研究[A];第十次中国生物物理学术大会论文摘要集[C];2006年
7 刘本叶;叶和春;李国凤;;药用植物次生代谢产物的生物合成与代谢工程[A];第八届全国药用植物及植物药学术研讨会论文集[C];2009年
8 胡子豪;励建荣;;影响香菇甲醛代谢的物质研究[A];中国食品科学技术学会第五届年会暨第四届东西方食品业高层论坛论文摘要集[C];2007年
9 刘兆颖;黄玲利;陈冬梅;戴梦红;陶燕飞;王玉莲;袁宗辉;;喹乙醇在大鼠的代谢研究[A];第九届全国药物和化学异物代谢学术会议论文集[C];2009年
10 彭丽花;任源;邓留杰;韦朝海;;间甲酚降解菌Citrobacter farmeri的降解特性及代谢途径初步研究[A];中国化学会第26届学术年会环境化学分会场论文集[C];2008年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 许敬亮;多菌灵降解菌的分离、鉴定及其降解特性研究[D];南京农业大学;2006年
2 顾立锋;胺苯磺隆降解菌SW4的分离、降解途径及其应用研究[D];南京农业大学;2007年
3 王薇;产絮菌合成生物絮凝剂特性及絮凝成分解析[D];哈尔滨工业大学;2009年
4 镇达;Pseudomonas putida ZWL73降解4-氯硝基苯的研究[D];中国科学院研究生院(武汉病毒研究所);2006年
5 曾永篪;姜黄的化学成分及去甲氧基姜黄素大鼠体内代谢研究[D];沈阳药科大学;2007年
6 张俊杰;Pseudomonas sp. WBC-3菌株分解代谢4-硝基酚的机理研究[D];中国科学院研究生院(武汉病毒研究所);2006年
7 夏循礼;植物异黄酮代谢途径分子进化与系统分类学关系研究[D];华中科技大学;2008年
8 杨瑞仪;青蒿素生物合成在天然及人工模拟环境中的转录调控机制研究[D];广州中医药大学;2009年
9 邵铁娟;假单胞菌菌株HF-1的尼古丁代谢途径及其分子生物学研究[D];浙江大学;2007年
10 袁军;印度洋深海多环芳烃降解菌的多样性分析及降解菌新种的分类鉴定与降解机理初步研究[D];厦门大学;2008年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 张弛;小球藻产三酰甘油过程的代谢网络构建与代谢途径优化分析[D];浙江大学;2014年
2 桑萍;微生物代谢通量及代谢途径分析[D];大连工业大学;2008年
3 李超;噻嗪酮降解菌株YL-1的分离鉴定、代谢途径及应用研究[D];南京农业大学;2012年
4 王化宁;一氧化氮代谢途径与大鼠术后葡萄糖代谢相关性的研究[D];第四军医大学;2006年
5 潘志宏;植物化感作用代谢途径模拟预测系统的构建与应用[D];福建农林大学;2009年
6 金德才;PAEs降解菌的分离鉴定及其降解特性研究[D];中南大学;2009年
7 胡培磊;Sphingomonas sp.XJ1降解DBP的研究[D];中南大学;2008年
8 贾会勇;CGS1、DHDPS基因克隆及其作为转基因植物筛选标记的研究[D];东北农业大学;2008年
9 彭琦;苏云金芽胞杆菌sigL基因功能的研究[D];东北农业大学;2008年
10 李冠义;两种水稻病毒胁迫下水稻的生物信息学研究[D];福建农林大学;2009年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 高鑫;遗传操作利用植物光合作用同化甲醛研究获突破[N];科技日报;2007年
2 黄橙;细菌或可扮演生物燃料主角[N];中国石化报;2008年
3 记者  范建;中外学者首次揭示植物代谢奥秘[N];科技日报;2006年
4 沈英甲;基因能像“标准件”一样被组装吗?[N];科技日报;2007年
5 李标 唐坤 舒坤贤;声波刺激可提高铁皮石斛组培苗多糖含量[N];中国医药报;2006年
6 黄橙;细菌能变石油?[N];科技日报;2008年
7 张洪让;犬猫临床用药的处方原则[N];中国畜牧兽医报;2008年
8 谢建平 徐建平 王洪海 陆飞;基因组开发类公司的知识产权战略[N];中国高新技术产业导报;2001年
9 驻沪记者  张莉;高内涵药物筛选技术力推我国药物创新[N];医药经济报;2006年
10 河南科技学院 崔艳红 博士;扼制细菌抗药性的主动权在哪里?[N];中国畜牧兽医报;2006年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62982499
  • 010-62783978