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水稻可溶性淀粉合酶基因与产量和稻米品质性状的关联分析

徐卫  
【摘要】:水稻的产量和品质性状是最主要的育种目标性状,由于多属于多基因控制的数量性状,其遗传复杂,揭示其遗传调控机制,对水稻的遗传改良具有重要的意义。本研究在本课题组前人研究基础上,从12条染色体上随机选择60个SSR标记进行群体结构分析,在此基础上进行SSI、SSIIa、SSIIIa基因等位变异与稻米品质的关联分析,以排除因为没有考虑群体结构而出现的伪关联,鉴定出真正具有显著效应的等位变异位点。同时对SSI、SSIIa、SSIIIa基因等位变异与产量性状的关联性也进行了分析,旨在探明这些等位变异对产量性状的影响,从而发掘优良基因用于水稻育种。主要研究结果如下: 1利用相同的实验材料、表型数据、群体大小和计算模式,对可溶性淀粉合酶基因与稻米支链淀粉结构和品质性状显著关联的多态性位点进行分析。考虑群体结构的关联结果中有87个多态性位点,与未考虑群体结构的试验结果相比检测到45个相同的位点,有5个位点在未做群体结构的关联分析结果中关联到,而在考虑群体结构后未关联到。 2在考虑群体结构的基础上,分别运用GLM和MLM模型进行关联分析,在其关结果中分别检测到77个和76个显著关联的位点;有3个位点在GLM模型中检测到而在MLM模型中未检测到。 3对不同年份检测到的可溶性淀粉合酶基因与稻米支链淀粉结构和品质性状显著关联的多态性位点进行比较:找到32个相同的位点;有5个位点在2011年的实验数据中未检测到。 4对16个品种的可溶性淀粉合酶基因与水稻产量和稻米品质性状的关联性进行研究。在产量性状的关联分析结果中共关联42个多态性位点,其中31个与结实率显著关联;在稻米品质的关联分析结果中共关联到75个位点。在这两个关联分析结果中找到6个相同的位点。 5新增试验材料后对可溶性淀粉合酶基因与水稻产量和稻米品质性状的关联性进行研究并将该结果与16个品种的关联分析结果进行比较:在稻米品质的关联分析中在找到44个相同的位点,在产量性状的关联分析结果中关联到5个相同位点。


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